Functional analyses of antisense transcripts in the epigenetic regulation of gene expression

反义转录本在基因表达表观遗传调控中的功能分析

• 批准号: 21710196
• 负责人: SHIBA Hiroshi
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Nara Institute of Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21710196/
• 关键词: DNAメチル化; アンチセンス転写産物; メチローム; ゲノムタイリングアレイ; aberrant RNA; 次世代シークエンサー

DNA methylation within the gene body is thought to impede transcriptional elongation, but the causal role of genic DNA methylation remains essentially unknown. In this research, I have generated DNA methylation profile (methylome) as well as sense and antisense transcription profiles (transcriptome), at 35-base pair resolution, of the wild-type and the loss-of DNA methyltransferase mutant of Arabidopsis. Combinational analyses of the methylomes and the transcriptomes have indicated that some sense/antisense transcripts are associated with body methylation. I also examined correlation between body methylation and small RNAs.

基因体内的DNA甲基化被认为阻碍了转录延伸，但基因DNA甲基化的因果作用基本上仍然未知。在这项研究中，我已经产生了DNA甲基化谱（甲基化组）以及正义和反义转录谱（转录组），在35个碱基对的分辨率，野生型和拟南芥的DNA甲基转移酶突变体的损失。甲基化组和转录组的组合分析表明，一些有义/反义转录本与身体甲基化有关。我还研究了身体甲基化和小RNA之间的相关性。

项目成果

アブラナ科植物の自家不和合性でみられるエピジェネティックな遺伝子発現制御

十字花科植物自交不亲和性中观察到的表观遗传基因表达调控

• 发表时间: 2010
• 作者: Hiroshi Shiba;Taketo Kayabe;Kentaro Yanol;Junshi Yazaki;Huaming Chen;Yutaka Suzuki;Masahiro Fujita;Nori Kurata;Akira Isogai;Joseph R.Ecker;Seiji Takayama.
• 通讯作者: Seiji Takayama.

Trans-acting small RNA determines dominance relationships in Brassica self-incompatibility

• DOI: 10.1038/nature09308
• 发表时间: 2010-08-19
• 期刊: NATURE
• 影响因子: 64.8
• 作者: Tarutani, Yoshiaki;Shiba, Hiroshi;Takayama, Seiji
• 通讯作者: Takayama, Seiji

シンポジウム「高等植物の生殖および初期発生研究の最前線」S対立遺伝子の発現制御機構の解析からメンデルの優性の法則に迫る

研讨会“高等植物繁殖与早期发育研究前沿”通过分析S等位基因的表达控制机制走近孟德尔优势定律

• 发表时间: 2009
• 作者: 柴博史;樽谷芳明;岩野恵;磯貝彰;柿崎智博;渡辺正夫;高山誠司
• 通讯作者: 高山誠司

Regulation of dominance relationships between self-incompatibility alleles in Brassica via de novo DNA methylation

通过DNA从头甲基化调节芸苔属自交不亲和等位基因之间的显性关系

• 发表时间: 2010
• 作者: Tarutani;Y.;Shiba;H.;Iwano;M.;Kakizaki;T.;Suzuki;G.;Watanabe;M.;Isogai;A.;and Takayama;S.
• 通讯作者: S.

Epigenetic control of dominance relationships among self-incompatibilityalleles by DNA methylation.

通过 DNA 甲基化对自交不亲和等位基因之间的显性关系进行表观遗传控制。

• 发表时间: 2010
• 期刊: Plant Morphology 22
• 作者: Hiroshi Shiba;Yoshiaki Tarutani;Seiji Takayama.
• 通讯作者: Seiji Takayama.