Population genetic studies of adaptation of forest trees during their expansion after the last glacial maximum

末次盛冰期后林木扩张过程中适应的种群遗传学研究

• 批准号: 22370083
• 负责人: TACHIDA Hidenori
• 金额: $ 11.9万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22370083/
• 关键词: 集団遺伝学; 適応進化; 最終氷期; 照葉樹林; 集団構造; 中立遺伝子; 適応淘汰遺伝子

Laurel forests dominating pristine lowlands in western Japan are considered to have expanded their distribution from one or more refugia after the last glacial maximum. In this project, we investigated their evolution during and after the expansion by studying genetic structure of their representative species, Distylium racemosum, Cleyera japonica, and Zanthoxylum ailanthoides, along with Taxodium distichum that grows in wetlands of North America. We obtained some indications that the three laurel forest species, although growing in the same forest at present, had different population histories. Also we found a small number of candidate genes that might have contributed to the adaptation.

在日本西部的原始低地占主导地位的月桂森林被认为是在末次盛冰期后从一个或多个避难所扩大了它们的分布。在这个项目中，我们调查了他们的进化过程中和之后的扩展，通过研究其代表物种，Distyelum racemosum，Cleyera japonica，Zanthoxylum ailanthoides，沿着Taxeliumdistichum生长在北美湿地。我们得到的一些迹象表明，这三个月桂林物种，虽然生长在同一个森林目前，有不同的人口历史。此外，我们还发现了少量可能有助于适应的候选基因。

项目成果

針葉樹スギより得られたBACクローンの塩基配列解析

针叶雪松 BAC 克隆的碱基序列分析

• 发表时间: 2010
• 作者: Uno Y;Nishida C;Tarui H;Ishishita S;Takagi C;Nishimura O;Ishijima J;Ota H;Kosaka A;Matsubara K;Murakami Y;Kuratani S;Ueno N;Agata K;Matsuda Y;田村美帆・津村義彦・舘田英典他3名
• 通讯作者: 田村美帆・津村義彦・舘田英典他3名

Extended linkage disequilibrium in non-coding regions in a conifer

针叶树非编码区的扩展连锁不平衡

• 发表时间: 2012
• 期刊: Cryptomeria japonica. Genetics
• 作者: E. Moritsuka;Y. Hisataka;M. Tamura;K. Uchiyama;A. Watanabe;Y. Tsumura;and H. Tachida
• 通讯作者: and H. Tachida

北米産針葉樹ヌマスギ2変種間の遺伝的分化に関する核遺伝子の塩基配列分析

北美针叶日本柳杉两个品种遗传分化相关核基因碱基序列分析

• 发表时间: 2012
• 作者: 濱田良真;板東哲哉;中村太郎;三戸太郎;池崎由佳・舘田英典・陶山芳久・楠見淳子他2名
• 通讯作者: 池崎由佳・舘田英典・陶山芳久・楠見淳子他2名

北米産針葉樹ヌマスギ２変種間の遺伝的分化に関する核遺伝子の塩基配列解析

北美针叶雪松两个品种遗传分化相关核基因碱基序列分析

• 发表时间: 2012
• 作者: Ishishita S;Inui T;Matsuda Y;Serikawa T;Kitada K;池崎由佳
• 通讯作者: 池崎由佳

Linkage disequilibrium in a population undergoing periodic fragmentation and admixture.

经历周期性分裂和混合的群体中的连锁不平衡。

• 发表时间: 2012
• 期刊: Genes & Genetic Systems
• 影响因子: 1.1
• 作者: Dabour N;Bando T;Nakamura T;Miyawaki K;Mito T;Ohuchi H;Noji S;H. Tachida
• 通讯作者: H. Tachida