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Stratification of gastroenterological tumors by genome-wide analysis of DNA methylation alteration.

Stratification of gastroenterological tumors by genome-wide analysis of DNA methylation alteration.
通过 DNA 甲基化改变的全基因组分析对胃肠道肿瘤进行分层。
批准号：
22390255
负责人：
KANEDA Atsushi
金额：
$12.23万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2010
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2010 至 2012
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22390255/
关键词：
小腸大腸肛門外科学癌エピゲノムエピジェネティクスマイクロアレイ次世代シーケンサー情報工学

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
全基因组DNA甲基化分析显示胃癌存在3种不同的表观基因型，EB病毒感染是导致广泛DNA甲基化表观基因型的原因。对于结直肠癌，发现DNA甲基化表观基因型在腺瘤阶段就已经建立;锯齿状腺瘤显示与BRAF突变强相关的高甲基化表观基因型，而非锯齿状腺瘤分为中等和低甲基化表观基因型。
英文摘要
DNA methylation analysis on genome-wide scale revealed three distint epigenotypes in gastric cancer and Epstein-Barr virus infection is the cause for extensive DNA methylation epigenotype. As for colorectal cancer, DNA methylation epigenotypes was found to be established already at adenoma stage; serrated adenoma showed high-methylation epigenotype with strong correlation to BRAF mutation, while non-serrated adenoma was classified into intermediate- and low-methylation epigenotypes.
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会议论文
Decoding the genome and transcriptome of human pancreatic cancer by integrated next-generation sequencing technologies
通过集成的下一代测序技术解码人类胰腺癌的基因组和转录组
DOI： --
发表时间： 2011
期刊：
影响因子： --
作者： [Linghua Wang, Atsushi Kaneda, et al.]
通讯作者： et al.
甲状腺乳頭癌におけるDNAメチル化解析
甲状腺乳头状癌的 DNA 甲基化分析
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： [菊池弥寿子, 金田篤志ら]
通讯作者： 金田篤志ら
大腸癌における３群のエピジェノタイプと予後.
结直肠癌的三组表观基因型和预后。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： [Takebe T, Sekine K, Enomura M, Koike H, Kimura M, Ogaeri T, Zang RR, Ueno Y, Zheng YW, Koike N, Aoyama S, Adachi Y, Taniguchi H, 金田篤志]
通讯作者： 金田篤志
Cancer classification by genome-wide and quantitative DNA methylation analyses. In "Epigenomics From Chromatin Biology to Therapeutics"(Krishnarao Appasani Ed.)
通过全基因组和定量 DNA 甲基化分析进行癌症分类。
DOI： --
发表时间： 2012
期刊：
影响因子： --
作者： [Takakura Y, Okajima M, Kanemitsu Y, Kuroda S, Egi H, Hinoi T, Tashiro H, Ohdan H, Kaneda A]
通讯作者： Kaneda A
共 41 条
    Development of new infromation and indexes with ocean observation buoys for understanding fshing ground environment
    • 批准号：
      15K14782
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.41万
    • 财政年份：
      2015
    • 负责人：
      KANEDA Atsushi
    • 依托单位：
      Fukui Prefectural University
    Study on characteristics of the bottom cold water and its influences on ocean environment in coastal waters of Japan Sea
    • 批准号：
      22740315
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • 资助金额：
      $2.33万
    • 财政年份：
      2010
    • 负责人：
      KANEDA Atsushi
    • 依托单位：
      Fukui Prefectural University
    Study on fluctuations in flow and material transport due to the meandering of the Kuroshio, in coastal waters of Shikoku and Kyushu
    • 批准号：
      19740295
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • 资助金额：
      $2.32万
    • 财政年份：
      2007
    • 负责人：
      KANEDA Atsushi
    • 依托单位：
      Fukui Prefectural University
    High-resolution epigenome analysis of cancer of the digestive system using tiling array
    • 批准号：
      19390345
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $11.81万
    • 财政年份：
      2007
    • 负责人：
      KANEDA Atsushi
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    国内基金
    海外基金
    TBK1通过磷酸化SLC7A11调控铁死亡抵抗促进鼻咽癌恶性进展的机制研究
    • 批准号：
      2026JJ50595
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2026
    • 负责人：
      王维圆
    • 依托单位：
      中南大学湘雅医院
    CCL20/CCR6/SEMA3C信号轴通过EMT及肿瘤干细胞互作调控阴茎癌转移的分子机制研究
    • 批准号：
      2026JJ50313
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2026
    • 负责人：
      胡希恒
    • 依托单位：
      中南大学湘雅医院
    基于“人源化”新型近红外荧光探针的构建及其在膀胱癌诊疗一体化中的应用研究
    棕榈酰化修饰调控肾透明细胞癌恶性进展
    • 批准号：
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2026
    • 负责人：
      金鑫
    • 依托单位：
      中南大学湘雅二医院