Stratification of gastroenterological tumors by genome-wide analysis of DNA methylation alteration.

通过 DNA 甲基化改变的全基因组分析对胃肠道肿瘤进行分层。

• 批准号: 22390255
• 负责人: KANEDA Atsushi
• 金额: $ 12.23万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22390255/
• 关键词: 小腸大腸肛門外科学; 癌; エピゲノム; エピジェネティクス; マイクロアレイ; 次世代シーケンサー; 情報工学

DNA methylation analysis on genome-wide scale revealed three distint epigenotypes in gastric cancer and Epstein-Barr virus infection is the cause for extensive DNA methylation epigenotype. As for colorectal cancer, DNA methylation epigenotypes was found to be established already at adenoma stage; serrated adenoma showed high-methylation epigenotype with strong correlation to BRAF mutation, while non-serrated adenoma was classified into intermediate- and low-methylation epigenotypes.

全基因组DNA甲基化分析显示胃癌存在3种不同的表观基因型，EB病毒感染是导致广泛DNA甲基化表观基因型的原因。对于结直肠癌，发现DNA甲基化表观基因型在腺瘤阶段就已经建立;锯齿状腺瘤显示与BRAF突变强相关的高甲基化表观基因型，而非锯齿状腺瘤分为中等和低甲基化表观基因型。

项目成果

Decoding the genome and transcriptome of human pancreatic cancer by integrated next-generation sequencing technologies

通过集成的下一代测序技术解码人类胰腺癌的基因组和转录组

• 发表时间: 2011
• 作者: Linghua Wang;Atsushi Kaneda;et al.
• 通讯作者: et al.

甲状腺乳頭癌におけるDNAメチル化解析

甲状腺乳头状癌的 DNA 甲基化分析

• 作者: 菊池弥寿子;金田篤志ら
• 通讯作者: 金田篤志ら

大腸癌における３群のエピジェノタイプと予後.

结直肠癌的三组表观基因型和预后。

• 作者: Takebe T;Sekine K;Enomura M;Koike H;Kimura M;Ogaeri T;Zang RR;Ueno Y;Zheng YW;Koike N;Aoyama S;Adachi Y;Taniguchi H;金田篤志
• 通讯作者: 金田篤志

Cancer classification by genome-wide and quantitative DNA methylation analyses. In "Epigenomics From Chromatin Biology to Therapeutics"(Krishnarao Appasani Ed.)

通过全基因组和定量 DNA 甲基化分析进行癌症分类。

• 发表时间: 2012
• 作者: Takakura Y;Okajima M;Kanemitsu Y;Kuroda S;Egi H;Hinoi T;Tashiro H;Ohdan H;Kaneda A
• 通讯作者: Kaneda A

肺小細胞癌株のヒストン修飾異常に関する検討

小细胞肺癌细胞系组蛋白修饰异常的研究

• 发表时间: 2010
• 作者: 佐藤輝幸;砂河孝行;石川俊平;永江玄太;野中綾;石川雄一;金田篤志;貫和敏博;油谷浩幸
• 通讯作者: 油谷浩幸