Identification and functional analysis of esophageal cancer-related genes by pull-down method using biotin-labeled miRNA

生物素标记miRNA的pull-down法鉴定及功能分析食管癌相关基因

• 批准号: 22591433
• 负责人: ITO Sachio
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Okayama University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22591433/
• 关键词: 食道癌; miRNA; microRNA; pull-down assay; 癌

In order to identify possible predictive markers, We performed the identification of miRNA related to the degree of differentiation-grade and malignancy by the profiling of esophageal cancer cell lines and esophageal cancer clinical specimens. In poorly differentiated cells, miR-29a and let-7b were overexpressed. We identified target genes of these miRNAs using in vitro pull-down method, and found some candidates of target genes related to tumor suppressor and apoptosis. Our results suggest that these miRNAs are involved in esophageal cancer progression.

为了寻找可能的预测标志物，我们通过对食管癌细胞系和食管癌临床标本的分析，鉴定了与食管癌分化程度和恶性程度相关的miRNA。在低分化细胞中，miR-29 a和let-7 b过表达。我们采用体外pull-down方法对这些miRNAs的靶基因进行了鉴定，发现了一些与肿瘤抑制和凋亡相关的候选靶基因。我们的研究结果表明，这些miRNAs参与了食管癌的进展。

项目成果

癌細胞におけるmiR-17-92 cluster の新規標的タンパク質のプロテオーム解析

癌细胞中 miR-17-92 簇新靶蛋白的蛋白质组学分析

• 发表时间: 2010
• 作者: 大内田 守;神崎 浩孝;伊藤 佐智夫;清水 憲二
• 通讯作者: 清水 憲二

Identification and functional analysis of miR-19a target genes in lung cancer

肺癌miR-19a靶基因的鉴定及功能分析

• 发表时间: 2011
• 作者: Kumiko Yamamoto;ほか
• 通讯作者: ほか

Identification of direct target of MicroRNA-29a in Esophageal squamous cell carcinoma

MicroRNA-29a在食管鳞状细胞癌中直接靶标的鉴定

• 发表时间: 2011
• 作者: 堀口淳;長岡りん;二宮淳;合田文則;伊藤佐智夫
• 通讯作者: 伊藤佐智夫

プロテオーム解析による癌細胞でのmiR-17-92 clusterの新規標的タンパク質の同定

通过蛋白质组学分析鉴定癌细胞中 miR-17-92 簇的新靶蛋白

• 发表时间: 2010
• 作者: Mamoru OUCHIDA;Hirotaka KANZAKI;Sachio ITO;Kumiko Yamamoto;Seiji Tamaru and Kenji SHIMIZU
• 通讯作者: Seiji Tamaru and Kenji SHIMIZU

Identification of true targets of MicroRNA-183 in lung cancer cells using labeled ds-miRNA in vitro pull-down assay

使用标记的 ds-miRNA 体外 Pull-down 测定鉴定肺癌细胞中 MicroRNA-183 的真正靶标

• 发表时间: 2010
• 作者: Ito S;Hanafusa H;Ouchida M;ShimizuK.
• 通讯作者: ShimizuK.