Detection of new fusion partner genes with ALK gene

检测新的与 ALK 基因融合的伴侣基因

• 批准号: 22591563
• 负责人: SONOBE Makoto
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22591563/
• 关键词: 原発性肺癌; 腺癌; ALK; 融合遺伝子

We analyzed fusion gene(s) between ALK gene and EML4 or other unknown genes using surgically resectedlung cancer specimens. And easy and effective screening method for detecting these fusion genes related to ALK gene. We have established a fluorescent immunohistochemistry (FISH) method detecting ALK fusion genes easily to place a red probe in the head of ALK gene and a green probe in the exon 20 of ALK gene, which become luminescent apart each other when the ALK fusion gene exists. Because of low incidence of ALK fusion gene in lung cancer population (under 5% of resected cases), we have established an algorithm for ALK fusion gene detection. In the algorithm, tumors those are acinar predominant adenocarcinoma, without epidermal growth factor receptor gene mutations, and of patients who are never or light smokers (20 pack-year or lower) are selected for candidates of ALK fusion gene detection. To apply the algorithm, pretest probability of positive ALK fusion genes increases up to approximately 25%.

我们用手术切除的肺癌标本分析了ALK基因与EML 4或其他未知基因的融合基因。以及检测这些与ALK基因相关的融合基因的简便有效的筛选方法。我们建立了一种检测ALK融合基因的荧光免疫组织化学（FISH）方法，将一个红色探针置于ALK基因的头部，一个绿色探针置于ALK基因的第20外显子，当ALK融合基因存在时，两个探针相互发光。由于肺癌人群中ALK融合基因的发生率较低（占切除病例的5%以下），我们建立了ALK融合基因检测算法。在该算法中，选择腺泡为主腺癌、无表皮生长因子受体基因突变、从不吸烟或轻度吸烟（20包-年或更低）患者的肿瘤作为ALK融合基因检测的候选对象。为了应用该算法，阳性ALK融合基因的预检测概率增加至约25%。

项目成果

非小細胞肺癌における EML4-ALK 融合遺伝子の臨床病理学的検討

EML4-ALK融合基因在非小细胞肺癌中的临床病理学研究

• 发表时间: 2010
• 作者: 小林正嗣;園部誠;石川将史;菊地柳太郎;喜多村次郎;中山英;毛受暁史;高橋剛士;大久保憲一;伊達洋至
• 通讯作者: 伊達洋至

非小細胞肺癌におけるEML4-ALK融合遺伝子の臨床病理学的検討

EML4-ALK融合基因在非小细胞肺癌中的临床病理学研究

• 发表时间: 2010
• 作者: 小林正嗣、園部誠;他
• 通讯作者: 他

Clinicopathologic Features of Non-Small-Cell Lung Cancer with EML4-ALK Fusion Gene

• DOI: 10.1245/s10434-009-0808-7
• 发表时间: 2010-03-01
• 期刊: ANNALS OF SURGICAL ONCOLOGY
• 影响因子: 3.7
• 作者: Takahashi, Tsuyoshi;Sonobe, Makoto;Date, Hiroshi
• 通讯作者: Date, Hiroshi

Clinicopathologic features of non-small cell lung cancer with EML4-ALK gene.

带有EML4-ALK基因的非小细胞肺癌的临床病理特征。

• 发表时间: 2010
• 期刊: Ann Surg Oncol
• 影响因子: 3.7
• 作者: Takahashi T;Sonobe M;et al.
• 通讯作者: et al.

術後73ヶ月後に再発したEML4-ALK融合遺伝子を有する原発性肺癌の一例

EML4-ALK融合基因原发性肺癌术后73个月复发一例

• 发表时间: 2010
• 作者: 高橋剛士、園部誠;他
• 通讯作者: 他