Study of Catalytic Mechanism of Hydrogen Activation by Hydrogenase using Neutron Crystal Structure Analysis

中子晶体结构分析研究氢化酶氢活化催化机制

基本信息

批准号：
22657031
负责人：
HIGUCHI Yoshiki
金额：
$ 2.19万
依托单位：
University of Hyogo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份：
2010
资助国家：
日本
起止时间：
2010 至 2011
项目状态：
已结题

项目摘要

The perfectly deuterated[NiFe] hydrogenase was tried to prepare by inoculating the sulfate-reducing bacterium in the deuterated media in 2010.However, it was not successful to obtain enough amount of the protein sample for crystallization trial. In 2011-2012, the ordinary(not deuterated) hydrogenase was tried to crystallize using deuterated precipitant in deuterated buffer solution. We have succeeded in preparation of a single crystal with a volume of 4 mm^3.This crystal gave a neutron diffraction pattern at 5.0 Aresolution at 100 K using the neutron beam at Japan Atomic Energy Research Institute. In addition, some parameters for diffraction experiment for large single crystals of[NiFe] hydrogenase at cryo-temperature have been found.

试图通过在2010年在氘化培养基中接种硫酸盐还原细菌来制备完美的脱离[Nife]氢酶来制备。在2011 - 2012年，尝试使用氘化的缓冲液中的氘化沉淀剂来尝试将普通的（未剥离）氢化酶结晶。我们已经成功制备了一个体积为4 mm^的单晶。该晶体使用日本原子能研究所的中子束在100 k时在100 k时以5.0二元组的形式产生了中子衍射模式。此外，已经发现了一些用于冷温下[Nife]氢化酶的大型单晶的衍射实验的参数。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

マルチ銅酸化酵素の構造解析

多种铜氧化酶的结构分析

DOI：
发表时间：
2011
期刊：
影响因子：
0
作者：
小森博文;等
通讯作者：
等

Wntシグナル伝達機構ではたらくCCD1の構造化学的研究

Wnt信号传导机制中CCD1的结构化学研究

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
0
作者：
寺脇慎一;塩見健輔;桝正幸;柴田直樹;樋口芳樹
通讯作者：
樋口芳樹

An O-Centered Structure of the Trinuclear Copper Center in the Cys500Ser/Glu506Gln Mutant of CueO and Structural Changes in Low to High X-Ray Dose Conditions

DOI：
10.1002/anie.201107739
发表时间：
2012-01-01
期刊：
ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION
影响因子：
16.6
作者：
Komori, Hirofumi;Sugiyama, Ryosuke;Sakurai, Takeshi
通讯作者：
Sakurai, Takeshi

Purification, Crystallization and Preliminary X-ray Analysis of the Dissimilatory Sulfite Reductase from Desulfovibrio vulgaris Miyazaki F

普通脱硫弧菌 Miyazaki F 异化亚硫酸还原酶的纯化、结晶和初步 X 射线分析

DOI：
10.1107/s1744309110033191
发表时间：
2010
期刊：
Acta Crystallogr.
影响因子：
0
作者：
H. Ogata;Y. Shomura;A.G. Agrawal;A.P. Kaur;W. Gartner;Y. Higuchi and W. Lubitz
通讯作者：
Y. Higuchi and W. Lubitz

Crystallization and Preliminary X-ray Analysis of NADH:rubredoxin Oxidoreductase from Clostridium acetobutylicum

丙酮丁醇梭菌 NADH:红氧还蛋白氧化还原酶的结晶和初步 X 射线分析