Glycoproteomic identification of carbohydrate targeting lung cancer biomarkers

靶向肺癌生物标志物的碳水化合物的糖蛋白组学鉴定

• 批准号: 22680064
• 负责人: UEDA Koji
• 金额: $ 15.23万
• 依托单位: The Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22680064/
• 关键词: 腫瘍マーカー; プロテオミクス; 糖鎖; 肺癌; 質量分析; 血清; バイオマーカー; レクチン; 診断; グライコプロテオミクス; LC/MS/MS; 血漿

To develop novel carbohydrate-targeting biomarkers for early detection of lung cancer, glycoproteomic profiling of 144 serum samples was conducted. We further established a mass spectrometric quantification method for glycan structure alterations, named Energy resolved oxonium ion monitoring (Erexim) technology, in order for large-scaled validation study of 16 identified lung cancer biomarker candidates. The Erexim-based validation experiment using 87 independent serum samples revealed that frequency of alpha-1, 6 fucosylation on CD163-Asn105, Asn140, and Asn1027 was significantly up-regulated in even stage-I or II lung adenocarcinoma patients compared to normal control group. The Erexim technology was patented in US (US 8653448, 18.Feb.2014) and already utilized in various areas, such as chemistry, manufacturing and control (CMC) of biologics.

为了开发用于肺癌早期检测的新型碳水化合物靶向生物标志物，对144个血清样品进行了糖蛋白质组学分析。我们进一步建立了一种用于聚糖结构改变的质谱定量方法，称为能量分辨氧离子监测（Erexim）技术，以便对16种已鉴定的肺癌生物标志物候选物进行大规模验证研究。使用87份独立血清样本进行的基于Erexim的验证实验显示，与正常对照组相比，即使在I期或II期肺腺癌患者中，CD 163-Asn 105、Asn 140和Asn 1027上的α-1，6岩藻糖基化频率也显著上调。Erexim技术已在美国获得专利（US 8653448，2014年2月18日），并已用于生物制剂的化学、制造和控制（CMC）等多个领域。

项目成果

A comprehensive peptidome profiling technology for the identification of early detection biomarkers for lung adenocarcinoma.

• DOI: 10.1371/journal.pone.0018567
• 发表时间: 2011-04-12
• 期刊: PloS one
• 影响因子: 3.7
• 作者: Ueda K;Saichi N;Takami S;Kang D;Toyama A;Daigo Y;Ishikawa N;Kohno N;Tamura K;Shuin T;Nakayama M;Sato TA;Nakamura Y;Nakagawa H
• 通讯作者: Nakagawa H

Development of pancreatic cancer biomarkers by focused proteomics technologies.

通过重点蛋白质组学技术开发胰腺癌生物标志物。

• 发表时间: 2012
• 作者: 木村 栄輝;松吉 智瑛里;宮崎 航;久保 健一郎;遠藤 俊裕;Wenting Ling;仲嶋 一範;掛山 正心;遠山 千春;植田幸嗣;竹内 賢吾;兵部唯香・板井啓明・早瀬大祐・田辺信介;宮崎航;植田幸嗣
• 通讯作者: 植田幸嗣

質量分析が明らかにする癌特異的エクソソーム表面抗原

质谱揭示癌症特异性外泌体表面抗原

• 发表时间: 2013
• 作者: Yoshimi Kamiya;Tetsuo Miyakoshi;K. Ueda
• 通讯作者: K. Ueda

Proteomic profiling of HTLV-1 infected T-cells for the Identification of potential biomarkers and therapeutic targets for HTLV-1 associated myelopathy/tropical spastic paraparesis and adult T-cell leukemia

HTLV-1 感染的 T 细胞的蛋白质组学分析，用于鉴定 HTLV-1 相关脊髓病/热带痉挛性截瘫和成人 T 细胞白血病的潜在生物标志物和治疗靶点

• 发表时间: 2011
• 作者: Ueda;K.;Ishihara;M.;Ohsawa;A.;Senkoji;N.;Araya;N.;Sato;T.;Utsunomiya;A.;Yamano;Y.;Nakamura;Y.;Nakagawa;H.
• 通讯作者: H.

Comprehensive proteome profiling to identify potential therapeutic targets for Human T-lymphotropic virus type-1 (HTLV-1)-associated myelopathy/tropical spastic paraparesis and adult T-cell leukemia

全面的蛋白质组分析，以确定人类 T 淋巴细胞病毒 1 型 (HTLV-1) 相关脊髓病/热带痉挛性截瘫和成人 T 细胞白血病的潜在治疗靶点

• 发表时间: 2010
• 作者: Hideyuki Takahashi;Takeshi Tanaka;Masakazu Hamada;Kazuyuki Tohji;植田幸嗣
• 通讯作者: 植田幸嗣