Development of a diagnostic marker and method for pancreatic cancer using secretome and proteome analysis.

使用分泌组和蛋白质组分析开发胰腺癌的诊断标记物和方法。

• 批准号: 22700904
• 负责人: SATOH Mamoru
• 金额: $ 2.5万
• 依托单位: Chiba University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22700904/
• 关键词: プロテオミクス解析; プロテオーム; セクレトーム; 安定同位体標識; 抗がん剤耐性株; 膵臓がん; 血清

In this study, we employed a quantitative proteomics technique using stable isotope labeling with amino acids in cell culture (SILAC) followed by mass spectrometry to quantify changes in protein levels between gemcitabine resistant and sensitive pancreatic cancer cells. The 120 proteins were shown more than 2-fold change between the resistant and sensitive cell lines, of which twenty proteins were confirmed by WB. Moreover, 30 proteins were changed more than two times in the comparative analysis of membrane proteins. The siRNA-mediated inhibition of protein expression which was increased in resistant cells increased the cytotoxic effect of gemcitabine. We identified the candidate proteins of diagnosis marker in secretome analysis, the validation of candidate proteins in the serum is now underway.

在这项研究中，我们采用了一种定量蛋白质组学技术，使用稳定同位素标记与细胞培养物中的氨基酸（SILAC），然后通过质谱定量吉西他滨耐药和敏感的胰腺癌细胞之间的蛋白质水平的变化。结果表明，在120个蛋白质中，有20个蛋白质在抗性细胞系和敏感细胞系之间有2倍以上的差异，其中20个蛋白质经WB鉴定。此外，在膜蛋白的比较分析中，有30个蛋白发生了两次以上的变化。在耐药细胞中增加的siRNA介导的蛋白质表达抑制增加了吉西他滨的细胞毒性作用。我们在分泌组分析中鉴定了诊断标志物的候选蛋白，目前正在血清中验证候选蛋白。

项目成果

定量的ショットガンプロテオミクスによる歯周疾患マーカーの探索

使用定量鸟枪蛋白质组学搜索牙周病标记物

• 发表时间: 2011
• 作者: 土田祥央;佐藤守;曽川一幸;川島祐介;荷堂清香;澤井摂;西村基;松下一之;小寺義男;野村文夫
• 通讯作者: 野村文夫

Adsorption of urinary proteins on the conventionally used urine collection tubes : possible effects on urinary proteome analysis and prevention of the adsorption by polymer coating

常规使用的尿液收集管上尿液蛋白质的吸附：对尿液蛋白质组分析的可能影响和聚合物涂层防止吸附的影响

• 发表时间: 2011
• 期刊: International Journal of proteomics.
• 作者: Kiyokawa I;Sogawa K;Ise K;Iida F;Satoh M;Miura T;Kojima R;Katayama K;Nomura F
• 通讯作者: Nomura F

質量分析計を用いた生体資料の藤守定量測定

Fujimori 使用质谱仪定量测量生物材料

• 发表时间: 2011
• 作者: 緑川宇一;新堀晶子;水口惣平;新森加奈子;丸尾裕二;鵜沼豊;中村眞;荒木令江;佐藤守
• 通讯作者: 佐藤守

プロテオーム解析をもっと身近に

让蛋白质组分析变得更容易

• 发表时间: 2009
• 作者: Umemura S;Fujimoto N;Hiraki A;Gemba K;Takigawa N;Fujiwara K;Fujii M;Um emura H;Satoh M;Tabata M;Ueoka H;Kiura K;Kishimoto T;Tanimoto M.;佐藤守;佐藤守;佐藤守
• 通讯作者: 佐藤守

The application of a three-step proteome analysis for identification of new biomarkers of pancreatic cancer.

• DOI: 10.1155/2011/628787
• 发表时间: 2011
• 期刊: International journal of proteomics
• 作者: Abulaizi M;Tomonaga T;Satoh M;Sogawa K;Matsushita K;Kodera Y;Obul J;Takano S;Yoshitomi H;Miyazaki M;Nomura F
• 通讯作者: Nomura F