How is the genome integrity of the hyperthermophiles protected and propagated?

超级嗜热菌的基因组完整性是如何保护和繁殖的？

• 批准号: 23310152
• 负责人: ISHINO YOSHIZUMI
• 金额: $ 12.73万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23310152/
• 关键词: アーキア; DNA複製; 極限環境生命; DNA修復; 超す熱性アーキア; 生体高分子; レプリソーム; 超好熱性アーキア

Proteins and enzymes involved in DNA replication and repair in the hyperthermophilic archaea, Thermococcus kodakarensis and Pyrococcus furious were characterized by both biochemical and genetical techniques. There are three Mcm and two PCNA in T. kodakarensis, and to understand the functional sharing, we characterized the purified Mcm and PCNA proteins. In addition, we isolated amutant T. kodakarensis strains, in which one of these genes wa knocked out, and characterized their phenotypes. We found that Mcm3 and PCNA1 are essential for the viability of T. kodakarensis. Exact functions of Mcm1, Mcm2, and PCNA2 remain to be elucidated. We searched for enzymes involved in the damaged base repair system in the hyperthermophilic archaea. We identified a novel endonuclease, which cleaves at 5'-side of the damaged nucleotide, hypoxanthine, uracil, xanthine, and AP site in the DNA strand. We designated it Endonuclease Q and applied for a patent as a novel substance from Kyushu University.

利用生物化学和遗传学技术对极端嗜热古菌Thermococcus kodakarensis和Pyrococcus furious中与DNA复制和修复有关的蛋白质和酶进行了表征。T细胞有3个Mcm和2个PCNA。kodakarensis，并了解功能共享，我们的特点是纯化的Mcm和PCNA蛋白。此外，我们还分离到了突变体T. kodakarensis菌株，其中这些基因之一被敲除，并表征其表型。我们发现Mcm3和PCNA 1对T.科达卡人。 Mcm1、Mcm2和PCNA 2的确切功能仍有待阐明。 我们在嗜热古菌中寻找参与受损碱基修复系统的酶。我们鉴定了一种新的核酸内切酶，其在DNA链中受损核苷酸、次黄嘌呤、尿嘧啶、黄嘌呤和AP位点的5 '侧切割。我们将其命名为Endonuclease Q，并从九州大学申请了专利。

项目成果

A novel single-strand specific 3'-5' exonuclease found in the hyperthermophilic archaeon, Pyrococcus furiosus.

• DOI: 10.1371/journal.pone.0058497
• 发表时间: 2013
• 期刊: PloS one
• 影响因子: 3.7
• 作者: Tori K;Ishino S;Kiyonari S;Tahara S;Ishino Y
• 通讯作者: Ishino Y

アーキアに見出された損傷塩基修復酵素 Endonuclease Qの特性

古细菌中发现的一种受损碱基修复酶核酸内切酶 Q 的特征

• 发表时间: 2013
• 作者: 白石都;石野園子;牧田成人;江頭由里子;清成信一;山上健;石野良純
• 通讯作者: 石野良純

複製フォークの停止修復に関わるHefタンパク質に見られる天然変性領域の機能解析

Hef 蛋白中参与复制叉失速修复的自然退化区域的功能分析

• 发表时间: 2013
• 作者: 石野 園子;山上 健;冨田 宏矢;金井 保;跡見 晴幸;石野 良純
• 通讯作者: 石野 良純

アーキアの損傷塩基除去修復に関わる新規酵素の発見

发现一种参与古细菌受损碱基修复的新酶

• 发表时间: 2013
• 作者: 白石 都;石野園子;牧田成人;江頭由里子;清成信一;山上 健;石野良純
• 通讯作者: 石野良純

Yoshizumi Ishino More than one Mcm protein functions in the hyperthermophilic archaeon, Thermococcus kodakarensis

石野吉纯 (Yoshizumi Ishino) 超过一种 MCM 蛋白在超嗜热古菌——小田热球菌中发挥作用

• 发表时间: 2011
• 作者: Seiji Fujino;Hiroya Tomita;Hiromi Ogino;Tamotsu Kanai;Haruyuki Atomi
• 通讯作者: Haruyuki Atomi