Structural basis and functional evolution of RNA maturation machinary

RNA成熟机制的结构基础和功能演化

• 批准号: 23350081
• 负责人: HORI Hiroyuki
• 金额: $ 12.4万
• 依托单位: Ehime University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23350081/
• 关键词: 核酸; 酵素; タンパク質; ＲＮＡ; RNA; RNA修飾; RNAメチル化; tRNA; メチル化酵素; RNA分解制御; ゲノム; 構造解析

The purpose of this study is physical and chemical understanding of RNA maturation system. The study were performed for three years. We mainly researched the relatively simple organism of three domains of life (eukaryotes, archaea and eubacteria). We chracterized several tRNA modification enzymes and tRNA splicing endonulceases by X-ray crystal structural study and biochemical methods. Furthermore, we investigated the network between modified nucleosides in tRNA and tRNA modification enzymes using gene disruptant strains. Moreover, we found distinct tRNA modifications in a thermo-acidophilic archaeon, Thermoplasma acidophilum.

本研究的目的是通过物理和化学方式了解 RNA 成熟系统。 该研究进行了三年。 我们主要研究生命三个领域（真核生物、古细菌和真细菌）相对简单的生物体。 我们通过 X 射线晶体结构研究和生化方法表征了几种 tRNA 修饰酶和 tRNA 剪接核酸内切酶。 此外，我们使用基因破坏菌株研究了 tRNA 中修饰核苷和 tRNA 修饰酶之间的网络。 此外，我们在嗜热嗜酸古菌嗜酸热原体中发现了独特的 tRNA 修饰。

项目成果

Substrate tRNA Recognition Mechanism of Eubacterial tRNA (m1A58) Methyltransferase (TrmI)*

• DOI: 10.1074/jbc.m114.606038
• 发表时间: 2015-01
• 期刊: The Journal of Biological Chemistry
• 作者: Hiroyuki Takuma;Natsumi Ushio;Masayuki Minoji;Ai Kazayama;Naoki Shigi;A. Hirata;Chie Tomikawa;A. Ochi;H. Hori

葉酸依存性tRNA(m5U54)メチル化酵素TrmFOはどうやってtRNA中のU54を認識しているのか?

叶酸依赖性 tRNA (m5U54) 甲基转移酶 TrmFO 如何识别 tRNA 中的 U54？

• 作者: 山上龍太;山下光輝;西増弘志;冨川千恵;越智杏奈;岩下智香子;平田 章;石谷隆一郎;濡木 理;堀 弘幸
• 通讯作者: 堀 弘幸

The 2'-O-methylation status of a single guanosine controls transfer RNA-mediated Toll-like receptor 7 activation or inhibition.

• DOI: 10.1084/jem.20111075
• 发表时间: 2012-02-13
• 期刊: The Journal of experimental medicine
• 作者: Jöckel S;Nees G;Sommer R;Zhao Y;Cherkasov D;Hori H;Ehm G;Schnare M;Nain M;Kaufmann A;Bauer S
• 通讯作者: Bauer S

実験医学増刊号 生命分子を統合するRNA-その秘められた役割と制御機構1-3 tRNA修飾と機能

实验医学专刊 整合生物分子的RNA-其隐藏作用及控制机制1-3 tRNA修饰与功能

• 发表时间: 2013
• 作者: T. Kawamura;C. Tomikawa;T. Ohira;Y. Inoue;A. Yamagishi;T. Suzuki;and H. Hori;堀弘幸;堀 弘幸
• 通讯作者: 堀 弘幸

高度好熱菌tRNA中のシュードウリジン55修飾は, 温度変化への適応因子として機能する

超嗜热生物 tRNA 中的假尿苷 55 修饰可作为温度变化的适应因子

• 发表时间: 2012
• 作者: 冨川千恵;石田一雄;国林貴史;越智杏奈;金井保;平田章;岩下知香子;堀弘幸
• 通讯作者: 堀弘幸