Elucidation of mechanisms of bilin synthesizing enzyme and photo-adaptation regulating protein

胆素合成酶和光适应调节蛋白机制的阐明

• 批准号: 23370052
• 负责人: FUKUYAMA Keiichi
• 金额: $ 12.73万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23370052/
• 关键词: X線結晶解析; 中性子結晶解析; ビリン還元酵素; シアノバクテリオクロム; シトクロムp450還元酵素; ヘムオキシゲナーゼ; 反応機構; 立体構造; シトクロムP450還元酵素; X線結晶構造解析; 中性子構造解析; ビリン色素; 光合成色素; 酵素反応機構

We tried to elucidate the molecular mechanism of PcyA, an enzyme that synthesize bilin pigment, through crystal structures. These studies include analysis of PcyA mutants and neutron crystallography as well as X-ray crystallography. PcyA is characteristic in that it reduces two sites of biliverdin sequentially. When the first step is completed, PcyA switches to the second step. We defined Asp105 and other residues are involved in this reaction. We also determined the protonation state Asp105 and biliverdin, and clarified the molecular mechanisms of the reduction.We succeeded in crystallization of the full-length cyanobacteriochrome.

本文试图通过晶体结构来阐明胆色素合成酶PcyA的分子机制。这些研究包括PcyA突变体的分析和中子晶体学以及X射线晶体学。PcyA的特征在于它依次还原胆绿素的两个位点。当第一步完成时，PcyA切换到第二步。我们确定Asp105和其他残基参与了该反应。我们还测定了Asp105和胆绿素的质子化状态，阐明了还原的分子机理，并成功地结晶了全长的蓝藻色素。

项目成果

Structural biology of the SUF machinery involved in de novo iron-sulfur cluster biosynthesis

参与从头铁硫簇生物合成的 SUF 机器的结构生物学

• 作者: 和田啓;萩原義徳;福山恵一;和田啓
• 通讯作者: 和田啓

Cysteine 295 indirectly affects Ni coordination of carbon monoxide dehydrogenase-II C-cluster

• DOI: 10.1016/j.bbrc.2013.09.143
• 发表时间: 2013-11-08
• 期刊: BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS
• 影响因子: 3.1
• 作者: Inoue, Takahiro;Takao, Kyosuke;Sako, Yoshihiko
• 通讯作者: Sako, Yoshihiko

γ -Glutamyltranspeptidase and Its Precursor. Handbook of Proteolytic Enzymes, 3 rd Ed, Chapter 820

γ-谷氨酰转肽酶及其前体蛋白水解酶手册，第三版，第 820 章

• 发表时间: 2013
• 作者: J. Hiratake;H. Suzuki;K. Fukuyama;K. Wada;and H. Kumagai
• 通讯作者: and H. Kumagai

新たなABC蛋白質ファミリーに属する鉄硫黄クラスター生合成装置の構造・機能解析

属于新ABC蛋白家族的铁硫簇生物合成装置的结构和功能分析

• 发表时间: 2013
• 作者: 平林佳;田中尚志;福山恵一;高橋康弘;和田啓
• 通讯作者: 和田啓

Mutational analysis of IscU revealed novel functional residues

IscU 的突变分析揭示了新的功能残基

• 发表时间: 2013
• 作者: N. Tanaka;T. Masako;K. Wada;K. Fukuyama;Y. Takahashi
• 通讯作者: Y. Takahashi