Genetic diversity and conservation of Asian native livestock based on development of international standard SNP sysytem

基于国际标准SNP系统开发的亚洲本土牲畜遗传多样性与保护

• 批准号: 23380165
• 负责人: MANNEN Hideyuki
• 金额: $ 11.9万
• 依托单位: Kobe University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23380165/
• 关键词: アジア; 在来家畜; SNP; ゲノム; 遺伝的多様性; 多様性

The aim of this study was to develop SNP system and estimate genetic diversity of Asian cattle, pig, chicken and goat. We developed the SNP system consisting of 121 SNPs in cattle, 101 SNPs in pig, 76 SNPs in chicken and 58 SNPs in goat. Using these SNP systems, we revealed genetic divergence of the breeds and populations, and degree of genetic admixture among breeds/populations. In order to conserve the genetic diversity of Asian native livestock, regional and scarcity lineage, breed and population should be maintained by using genetic indices obtained from genetic markers, such as SNP system developed in this study.

本研究旨在建立亚洲牛、猪、鸡和山羊的SNP系统，并对亚洲牛、猪、鸡和山羊的遗传多样性进行评估。本研究建立了牛、猪、鸡和山羊的SNP系统，包括牛的121个SNPs、猪的101个SNPs、鸡的76个SNPs和山羊的58个SNPs。利用这些SNP系统，我们揭示了品种和种群的遗传分化，以及品种/种群之间的遗传混合程度。为了保护亚洲地方家畜的遗传多样性，应利用遗传标记获得的遗传指标，如本研究开发的SNP系统，保持区域性和稀缺性的谱系、品种和群体。

项目成果

分子遺伝学から見たアジア在来牛の起源・系統史研究

分子遗传学视角下亚洲本土牛的起源及系统发育史研究

• 发表时间: 2012
• 作者: Hashizume K;Watanabe D;Kizaki K;Suzuki Y;Hosoe M;Takahashi T;万年英之
• 通讯作者: 万年英之

Genotyping of genes responsible for 7 defective traits in Japanese Black by the DigiTag2 assay

通过 DigiTag2 检测对日本黑猫 7 个缺陷性状的基因进行基因分型

• 发表时间: 2012
• 作者: Yasue H;Shimogiri T;Niwata S;Nishibori M;Mannen H
• 通讯作者: Mannen H

Identification of divergently selected regions between Japanese Black and Holstein cattle using bovine 50k SNP array

使用牛 50k SNP 阵列鉴定日本黑牛和荷斯坦牛之间的不同选择区域

• DOI: 10.1111/j.1740-0929.2011.00927.x
• 发表时间: 2012
• 期刊: Animal Science Journal
• 影响因子: 2
• 作者: Hosokawa D;Ishii A;Yama j i K;Sasazaki S;Oyama K;Mannen H
• 通讯作者: Mannen H

SRY 遺伝子を用いたアジア在来家畜ヤギの多様性解析

利用SRY基因对亚洲本土山羊进行多样性分析

• 发表时间: 2013
• 作者: 脇 愛生;笹崎晋史;万年 英之
• 通讯作者: 万年 英之

Genetic diversity and structure in goat analyzed by newly-developed SNPs

通过新开发的 SNP 分析山羊的遗传多样性和结构

• 发表时间: 2012
• 作者: Mannen H;Lin BZ;Kato T;Kaneda M;Matsumoto M;Sasazaki S
• 通讯作者: Sasazaki S