Survey of anti-desiccation and ant-freezing genes in Antarctic nematodes by comparative genome analysis

通过比较基因组分析调查南极线虫的抗干燥和抗冻基因

• 批准号: 23510239
• 负责人: KAGOSHIMA Hiroshi
• 金额: $ 3.49万
• 依托单位: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(新領域融合研究センター及びライフサイ
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23510239/
• 关键词: 比較ゲノム; 極限環境; 乾燥耐性; 凍結耐性; 線形動物; 緩歩動物; 南極; 国際情報交換（ニュージーランド、英国）; 乾燥耐性遺伝子; 凍結耐性遺伝子; 線虫; クマムシ; 国際情報交換（イギリス：ニュージーランド）; 環境耐性遺伝子; 国際情報交流; イギリス：ニュージーランド

The Antarctic nematode, Panagrolaimus davidi, is a remarkable organism that tolerates desiccation and intracellular freezing. To elucidate responsible genes for the tolerances, I have performed large-scale transcriptome and genome analyses in collaboration with the researchers in UK and New Zealand, and identified 25,875 transcripts. We picked up a candidate gene family for the tolerances, LEA genes, which are reported only from organisms living in extreme environments. Although even these special organisms have one or a few LEA genes normally, P. davidi has excess number of (at least 14 types of) LEA genes. Promotion of this research may facilitate the application to preserve internal organs and living bodies in frozen and/or dry state.

南极线虫Panagrolaimus Davidi是一种非凡的生物，它耐受干燥和细胞内的冻结。为了阐明耐受性的相关基因，我与英国和新西兰的研究人员合作，进行了大规模的转录组和基因组分析，并确定了25,875个转录本。我们挑选了耐受性的候选基因家族，LEA基因，这些基因只在生活在极端环境中的生物体中被报道。虽然即使是这些特殊的生物通常也有一个或几个LEA基因，但P.Davidi的LEA基因数量过多(至少有14种)。这项研究的推广可能会促进将内脏和活体保存在冷冻和/或干燥状态的应用。

项目成果

南極線虫 Panagrolaimus davidi の乾燥耐性遺伝子の機能解析

南极线虫Panagrolaimus davidi耐干燥基因的功能分析

• 发表时间: 2013
• 作者: 鹿児島 浩;小原 雄治;仁木 宏典
• 通讯作者: 仁木 宏典

Molecular and morphological analysis of Antarctic tardigrade, Acutuncus antarcticus

南极缓步动物 Acutuncus antarcticus 的分子和形态分析

• DOI: 10.4081/jlimnol.2013.s1.e3
• 发表时间: 2013
• 期刊: Journal of Limnology
• 影响因子: 1.6
• 作者: Kagoshima;H;Imura;S and Suzuki;AC
• 通讯作者: AC

The homeobox transcription factors, CEH-14 and TTX-1, regulate expression of gcy-8 and gcy-18 in C. elegans

同源框转录因子 CEH-14 和 TTX-1 调节线虫中 gcy-8 和 gcy-18 的表达

• 发表时间: 2011
• 作者: H. Kagoshima;Y. Kohara
• 通讯作者: Y. Kohara

Functional genomics of two Antarctic nematodes, Panagrolaimus davidi and Plectus murrayi.

两种南极线虫（Panagrolaimus davidi 和 Plectus murryi）的功能基因组学。

• 发表时间: 2011
• 作者: Kagoshima;H. and Kohara;Y.
• 通讯作者: Y.

Panagrolaimus davidi の乾燥耐性タンパク質の機能解析

大虾耐干燥蛋白的功能分析

• 发表时间: 2013
• 作者: 鹿児島 浩;小原 雄治;仁木 宏典. 南極線虫
• 通讯作者: 仁木 宏典. 南極線虫