Structural basis of replication restart primosome proteins involved in DnaB helicase loading

参与 DnaB 解旋酶加载的复制重启引发体蛋白的结构基础

• 批准号: 23570140
• 负责人: ABE Yoshito
• 金额: $ 3.41万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23570140/
• 关键词: 複製再開始プライモソーム; タンパク質-DNA複合体; タンパク質構造; DnaT; PriC; 複製再開始; PriB; 複製開始プライモソーム; 蛋白質-DNA複合体; 蛋白質構造

We performed the structure and function analysis of PriB, DnaT and PriC proteins engaged in replication restart in Escherichia coli. PriB is a single-stranded DNA (ssDNA) binding protein. Our NMR and FRET results showed that PriB bound to ssDNA in two-step binding manner, suggesting the cooperative binding between PriB and ssDNA. We also performed domain analysis of DnaT and PriC. From the domain information of DnaT, we suggested that the N-terminal domain of DnaT was involved in trimer formation and interaction with PriB, and the C-terminal domain of DnaT was involved in ssDNA binding based on the structure determined by NMR analysis. Furthermore, the domain information of PriC suggested that the C-terminal domain of PriC was involved in the ssDNA and SSB (single-stranded DNA binding protein) binding. Additionally, we determined the N-terminal domain of PriC using NMR analysis. Together with these results, we proposed the model of replication restart in Escherichia coli.

我们对大肠杆菌中参与复制重启的 PriB、DnaT 和 PriC 蛋白进行了结构和功能分析。 PriB 是一种单链 DNA (ssDNA) 结合蛋白。我们的 NMR 和 FRET 结果表明 PriB 以两步结合方式与 ssDNA 结合，表明 PriB 和 ssDNA 之间存在协同结合。我们还对 DnaT 和 PriC 进行了域分析。根据DnaT的结构域信息，根据NMR分析确定的结构，我们认为DnaT的N端结构域参与三聚体形成和与PriB的相互作用，而DnaT的C端结构域参与ssDNA结合。此外，PriC的结构域信息表明PriC的C端结构域参与了ssDNA和SSB（单链DNA结合蛋白）的结合。此外，我们使用 NMR 分析确定了 PriC 的 N 末端结构域。结合这些结果，我们提出了大肠杆菌中的复制重启模型。

项目成果

DNA 複製再開に関わる大腸菌プライモソーム構成因子DnaTの機能解析

参与重启 DNA 复制的大肠杆菌引发体成分 DnaT 的功能分析

• 发表时间: 2012
• 作者: 藤山紗季;阿部義人;谷純也;浦辺大志;片山勉;植田正
• 通讯作者: 植田正

DnaTC 末端ドメイン構造:2RU8(DB 登録)

DnaTC终端域结构：2RU8（DB注册）

DNA 複製再開始に関わる大腸菌プライモソーム構成因子PriB の変異体解析

PriB 的突变分析，PriB 是参与 DNA 复制重新启动的大肠杆菌引发体的一个组成部分

• 发表时间: 2012
• 作者: 藤山紗希;阿部義人;塩井誠次郎;竹縄太一;片山勉;植田正
• 通讯作者: 植田正

DNA 複製再開始因子PriC の機能解析

DNA复制重新启动因子PriC的功能分析

• 发表时间: 2011
• 作者: 荒牧峻彦;阿部義人;古谷佳織;片山勉;植田正
• 通讯作者: 植田正

Involvement of histidine in complex formation of PriB and single-stranded DNA.

组氨酸参与 PriB 和单链 DNA 的复合物形成。

• DOI: 10.1016/j.bbapap.2013.10.015
• 发表时间: 2013
• 期刊: Biochim. Biophys. Acta.
• 作者: Fujiyama S;et al
• 通讯作者: et al