Thermodynamics of Multiple Molecular Recognition by Intrinsically Disordered Protein

本质无序蛋白质多分子识别的热力学

• 批准号: 23570193
• 负责人: DAIZO Hamada
• 金额: $ 3.58万
• 依托单位: Kobe University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23570193/
• 关键词: 天然変性蛋白質; 分子認識; フォールディング; 構造転移; 腸管出血性大腸菌; 円二色性; 蛍光偏光解消; X線小角散乱; 揺らぎ; プレモルテングロビュール; 構造選択; トリプトファン蛍光; 両親媒性αへリックス; 円偏光二色性; モルテン・グロビュール; 中間状態

Proteins produced in biological systems assume well-defined structures to obtain their unique functions. However, there are many intrinsically disordered proteins (IDPs) which are unable to form specific structures by themselves in genomic sequences. IDPs form well-ordered structures upon binding to their specific ligands.Here, we analysed physicochemical mechanism of ligand binding by EspB, an IDP pathogens from enterohaemorrhagic E. coli. We found that EspB binds to alpha-catenin through the unstable alpha-helical regions formed around G41-E70 in a manner of "Conformational Selection".

生物系统中产生的蛋白质具有明确的结构以获得其独特的功能。然而，有许多内在无序蛋白(IDPs)不能在基因组序列中自行形成特定的结构。IDP与其特定的配体结合后形成有序的结构。在这里，我们分析了肠出血性大肠杆菌IDP病原体EspB与配体结合的物理化学机制。我们发现EspB通过在G41-E70周围形成的不稳定的α-螺旋区域以构象选择的方式与α-连环蛋白结合。

项目成果

腸管出血性大腸菌による中毒発生のメカニズム‐構造生物学的・生化学的アプローチ‐

肠出血性大肠杆菌的毒性机制-结构生物学和生化方法-

• 发表时间: 2013
• 作者: 横山謙;古池晶;岸川淳一;浜田大三
• 通讯作者: 浜田大三

高次蛋白質複合体形成における分子内構造揺らぎの役割

分子内结构波动在高阶蛋白质复合物形成中的作用

• 作者: Takaya;J.;Kusunoki;S. and Ishimi;Y.;浜田大三
• 通讯作者: 浜田大三

Molecular dissection of IZUMO1, a sperm protein essential for sperm-egg fusion

• DOI: 10.1242/dev.094854
• 发表时间: 2013-08-01
• 期刊: DEVELOPMENT
• 影响因子: 4.6
• 作者: Inoue, Naokazu;Hamada, Daizo;Hagihara, Yoshihisa
• 通讯作者: Hagihara, Yoshihisa

内分泌攪乱物質によるプロテインジスルフィドイソメラーゼの構造変化

内分泌干​​扰物引起的蛋白质二硫键异构酶的结构变化

• 发表时间: 2012
• 作者: 奥村正樹;橋本翔子;縄田万里奈;油谷克英;引間孝明;浜田大三;日高雄二;伊藤廉;志波公平;今岡進;山口宏
• 通讯作者: 山口宏

Conformational properties of intrinsically less-ordered EspB effector from Enterohaemorrhagic Esherichia coli

肠出血性大肠杆菌本质上无序 EspB 效应子的构象特性

• 发表时间: 2012
• 作者: Hamada D;Hagihara Y;Kamikubo H;Kataoka M.
• 通讯作者: Kataoka M.