The differential analyses of tRNA splicing processes among the three domains of life

生命三个领域tRNA剪接过程的差异分析

• 批准号: 23570208
• 负责人: YOKOGAWA Takashi
• 金额: $ 3.41万
• 依托单位: Gifu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23570208/
• 关键词: tRNA; tRNAリガーゼ; スプライシング; 古細菌; EndA; RtcB; イントロン; 低分子環状RNA; アーケオシン; ArcTGT; BHBモチーフ

In Archaea and Eucarya, some tRNA genes contain introns. Since the precursor tRNA (pre-tRNA) is not functional in protein biosynthesis, exact removal of introns must be essential. Recently, it was found that the RtcB catalyzes the ligation of exons derived from the pre-tRNA. RtcB also seems to catalyze the circulation of intron from pre-tRNA. In fact, we found the circularized intron in methanogenic archaeon, Methanosarcina acetivorans, cells. Whereas the circularized intron has any function or not, we believe it would be functional because of the following facts. First, the circularized intron was stable in M. acetivorans cells. Second, RtcB even exists in bacterial cells that any tRNA gene does not contain intron. In future, we would like to discover the functions of small circularized RNAs.

在古生代和真核生物中，一些tRNA基因含有内含子。由于前体tRNA(前-tRNA)在蛋白质生物合成中不起作用，准确去除内含子必须是必不可少的。最近发现，RtcB催化连接来自前tRNA的外显子。RtcB似乎也催化了前tRNA的内含子的循环。事实上，我们在产甲烷古细菌--食甲酸甲烷链霉菌细胞中发现了环状内含子。尽管环状内含子有没有任何功能，我们认为它是有功能的，因为以下事实。首先，环状内含子在醋酸菌细胞中是稳定的。其次，rtcB甚至存在于细菌细胞中，任何tRNA基因都不含内含子。在未来，我们想要发现小环状RNA的功能。

项目成果

Purification and comparison of native and recombinant tRNA-guanine transglycosylases from Methanosarcina acetivorans.

来自乙酸甲烷八叠球菌的天然和重组 tRNA-鸟嘌呤转糖基酶的纯化和比较。

• DOI: 10.1016/j.pep.2012.11.009
• 发表时间: 2013
• 期刊: Protein Expr. Purif.
• 作者: Nomura;Y;Onda;Y;Ohno;S;Taniguchi;H;Ando;K;Oka;N;Nishikawa;K;Yokogawa;T
• 通讯作者: T

tRNAのスプライシングによって生じる環状RNAはM. acetivorans細胞内で安定に存在している

tRNA剪接产生的环状RNA稳定存在于M. acetivorans细胞中。

• 发表时间: 2013
• 作者: Kogure H;Hikawa Y;Hagihara M;Tochio N;Koshiba S;Inoue Y;Guntert P;Kigawa;T;Yokoyama S;and Nameki N;菅原皓,岡部弘基,坂本明彦,船津高志;久野美由紀
• 通讯作者: 久野美由紀

Methanosarcina acetivorans由来tRNA-guanine transglycosylaseにおける天然型および組換え型酵素の精製とその比較

源自乙酸甲烷八叠球菌的天然和重组 tRNA-鸟嘌呤转糖基酶的纯化和比较

• 发表时间: 2013
• 作者: Watanabe;E.;Ohara;R. and Ishimi;Y.;能村友一朗
• 通讯作者: 能村友一朗

Methanosarcina acetivoransのイントロン含有tRNA前駆体と結合するタンパク質群の解析

与乙酸甲烷八叠球菌含内含子 tRNA 前体结合的蛋白质分析

• 发表时间: 2011
• 作者: 菅原皓;岡部弘基;坂本明彦;船津高志;横川隆志
• 通讯作者: 横川隆志