Genome-wide analysis of epigenomic alterations in pancreatic islets from mice under the risk of developing glucose intolerance

对存在葡萄糖不耐症风险的小鼠胰岛表观基因组变化进行全基因组分析

• 批准号: 23591330
• 负责人: NAMMO Takao
• 金额: $ 3.49万
• 依托单位: Research Institute, International Medical Center of Japan
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23591330/
• 关键词: エネルギー・糖質代謝異常; エピジェネティクス; 2型糖尿病; 環境因子; ヒストン修飾; 膵ランゲルハンス島; インスリン分泌; 遺伝子発現; エネルギー・糖代謝異常; 膵ベータ細胞; ゲノム網羅的解析; マウスモデル

Both genetic and environmental factors play important roles in the aetiology of diabetes, although the molecular mechanisms underlying the disease remain largely unclear. These days, epigenetic regulation of gene expression, which results from changes in a chromosome without alterations in the DNA sequence, has drawn attention to the field of diabetes research. The aim of this study was to clarify the involvement of epigenetic mechanisms in the regulation of pancreatic beta-cell function and glucose metabolism by genome-wide analyses. By testing mouse models, such as diet-induced obese mice and spontaneously diabetic mice, we found the cis-regulatory regions exhibited changes in the epigenome that were characteristic for the model. Furthermore, these effects were associated with changes in the expression of overlapping or adjacent genes. In summary, these results suggest the importance of genome-wide study of epigenome for clarifying disease mechanisms and identifying new drug targets.

遗传和环境因素在糖尿病的病因学中起着重要作用，尽管该疾病的分子机制仍不清楚。目前，基因表达的表观遗传调控（由染色体变化而不改变DNA序列引起）已引起糖尿病研究领域的关注。本研究的目的是通过全基因组分析阐明胰腺β细胞功能和葡萄糖代谢调控中表观遗传机制的参与。通过测试小鼠模型，如饮食诱导的肥胖小鼠和自发性糖尿病小鼠，我们发现顺式调节区表现出的表观基因组的变化是该模型的特征。此外，这些影响与重叠或相邻基因表达的变化有关。综上所述，这些结果表明表观基因组的全基因组研究对于阐明疾病机制和确定新的药物靶点的重要性。

项目成果

FAIRE-seqを用いたヒト膵島における開放型クロマチンの網羅的同定

使用 FAIRE-seq 全面鉴定人胰岛中的开放染色质

• 发表时间: 2011
• 期刊: 糖尿病学2011(岡芳知、谷澤幸生(編))
• 作者: 南茂隆生;Jorge Ferrer
• 通讯作者: Jorge Ferrer

膵島組織のエピゲノム解析と糖尿病

胰岛组织与糖尿病的表观基因组分析

• 发表时间: 2012
• 作者: 庄司知代;袴田秀樹;楠 文代;Hayasaka N et al.;川畑由美子(他14名);南茂隆生
• 通讯作者: 南茂隆生

膵β細胞におけるエピゲノム制御

胰腺β细胞的表观基因组调控

• 发表时间: 2013
• 期刊: 週刊医学のあゆみ
• 作者: 南茂隆生;安田和基
• 通讯作者: 安田和基

ヒト膵島を使った研究

使用人类胰岛的研究

• 发表时间: 2011
• 期刊: 別冊プラクティス糖尿病とヒトゲノムQ&A(安田和基(編著))
• 作者: 南茂隆生;安田和基
• 通讯作者: 安田和基

ゲノム網羅的解析を用いた、高脂肪食摂取による膵島の代償機序の解明

利用全面的基因组分析阐明高脂肪饮食摄入引起的胰岛的代偿机制

• 发表时间: 2013
• 作者: 南茂隆生;宇田川陽秀;川口美穂;衛藤弘城;上番増喬;平本正樹;西村渉;安田和基
• 通讯作者: 安田和基