RNA-Seq data analysis for ncRNA function prediction to thousands public RNA-Seq data on super computer
RNA-Seq data analysis for ncRNA function prediction to thousands public RNA-Seq data on super computer
在超级计算机上对数千个公共 RNA-Seq 数据进行 RNA-Seq 数据分析，用于 ncRNA 功能预测
批准号：
23650150
负责人：
NAGASAKI Masao
金额：
$1.16万
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份：
2011
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2011 至 2012
中文摘要
翻译
点击翻译按钮获取中文摘要
英文摘要
High performance sequencer (Hit-Seq) generates massive amounts of short reads. Hit-Seq is used for the analysis of transcriptome expressions. Especially, it is important to detect fusion transcripts and isoforms expression from overlapped region in a chromosome. This research developed a new method to detect isoform expressions from RNA-Seq data. By applying this method on supercomputer environment, more accurate expressions to unkown lincRNAs and mRNAs from thousands RNA-Seq data can be inferred.
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
登录
查看更多内容
Data Management and Bioinformatics of Next Generation Sequencing Data on the Massive Parallel Supercomputer
大规模并行超级计算机上下一代测序数据的数据管理和生物信息学
大规模并行超级计算机上下一代测序数据的数据管理和生物信息学
DOI：
--
发表时间：
2011
期刊：
影响因子：
--
作者：
[小椋透, 柳本武美, 鎌倉稔成, 長﨑正朗, 長﨑正朗, 小椋透，柳本武美，鎌倉稔成, Toshinari Kamakura and Kosuke Okusa, 長﨑正朗, 長崎正朗, 大倉征幸，鎌倉稔成, Chikara Furusawa and Kunihiko Kaneko, Masao Nagasaki]
通讯作者：
Masao Nagasaki
スーパーコンピュータを用いた超快適高速次世代シークエンスデータ解析環境の構築と解析
利用超级计算机构建和分析超舒适、高速的下一代序列数据分析环境
利用超级计算机构建和分析超舒适、高速的下一代序列数据分析环境
DOI：
--
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
--
作者：
[]
通讯作者：
Data Managenoment and Bioinformatics of High Throughput Sequencing Data on the Massive Parallel Supercomputer Environment
大规模并行超级计算机环境下高通量测序数据的数据管理和生物信息学
大规模并行超级计算机环境下高通量测序数据的数据管理和生物信息学
DOI：
--
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
--
作者：
[]
通讯作者：
Data Management and Bioinformatics of High Throughput Sequencing Data on the Massive Parallel Supercomputer Environment and Future
大规模并行超级计算机环境下高通量测序数据的数据管理和生物信息学及未来
大规模并行超级计算机环境下高通量测序数据的数据管理和生物信息学及未来
DOI：
--
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
--
作者：
[竹田裕一, 藤井光昭, 渡邉則生, 鎌倉稔成, 石黒真木夫・岡本基・椿広計・宮本道子・柳本武美・弥永真生, 長﨑正朗]
通讯作者：
長﨑正朗
ゲノム超ビックデータ時代における次世代シークエンスデータ解析環境の構築と解析
基因组超级大数据时代下一代序列数据分析环境构建与分析
基因组超级大数据时代下一代序列数据分析环境构建与分析
DOI：
--
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
--
作者：
[]
通讯作者：
共 9 条
Visual model checking approach of high level Petri-net and its application to dynamic biological pathway model
-
批准号：20700265
-
项目类别：Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
-
资助金额：$2.66万
-
财政年份：2008
-
负责人：NAGASAKI Masao
-
依托单位：