イネの生殖細胞特異的に機能するARGONAUTEタンパク質の分子機構の解明
イネの生殖細胞特異的に機能するARGONAUTEタンパク質の分子機構の解明
批准号:
11J01818
负责人:
小宮 怜奈
金额:
$1.54万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2011
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2011 至 2013
中文摘要
MEL1は、生殖細胞の発生や減数分裂に機能するArgonaute (AGO)遺伝子である。AGOはsmall RNAと結合し、サイレンシング経路に関与していることから、MEL1がsmall RNAと結合し、生殖細胞の発現制御系の中心で機能する可能性が高い。平成25年度は、MEL1の局在解析、及び、MEL1と結合するsmall RNA (MEL1-small RNA)の前駆体, 長鎖non-coding RNAの機能・制御機構解明を試みた。(1)イネ生殖細胞を用いたMEL1局在解析MEL1は、主に細胞質に局在し、減数分裂期レプトテン期に、一部のMEL1が核内に局在した。mell変異体のレプトテン期には、シナプトネマコンプレックスの構成因子, ZEP1の局在異常がみられた。MEL1が、核内で減数分裂の進行制御に関与している可能性が示唆された。(2)新規長鎖non-coding RNAの同定と機能解析RNA-sequenceにより、771種の新規長鎖non-coding RNAを同定した。さらに、これら長鎖non-coding RNAのイネ生殖における機能を明らかにするため、TOS17挿入変異体54系統の稔性評価、及び、RNAiによる抑制個体を4系統作出した。(3)長鎖non-coding RNA領域のDNAメチル化解析栄養成長期(葉)と生殖成長期(葯)を用いて、長鎖non-coding RNAの周辺領域のゲノムワイドなDNAメチル化解析を行った。本年度までに、シーケンシング、及び、イネゲノムへのマッピングを終了し、現在、2サンプル間における771カ所のDNAメチル化度合いを比較し、non-coding RNAの発現制御に関与する領域を探索している。
英文摘要
MEL1は、生殖細胞の発生や減数分裂に機能するArgonaute (AGO)遺伝子である。AGOはsmall RNAと結合し、サイレンシング経路に関与していることから、MEL1がsmall RNAと結合し、生殖細胞の発現制御系の中心で機能する可能性が高い。平成25年度は、MEL1の局在解析、及び、MEL1と結合するsmall RNA (MEL1-small RNA)の前駆体, 長鎖non-coding RNAの機能・制御機構解明を試みた。(1)イネ生殖細胞を用いたMEL1局在解析MEL1は、主に細胞質に局在し、減数分裂期レプトテン期に、一部のMEL1が核内に局在した。mell変異体のレプトテン期には、シナプトネマコンプレックスの構成因子, ZEP1の局在異常がみられた。MEL1が、核内で減数分裂の進行制御に関与している可能性が示唆された。(2)新規長鎖non-coding RNAの同定と機能解析RNA-sequenceにより、771種の新規長鎖non-coding RNAを同定した。さらに、これら長鎖non-coding RNAのイネ生殖における機能を明らかにするため、TOS17挿入変異体54系統の稔性評価、及び、RNAiによる抑制個体を4系統作出した。(3)長鎖non-coding RNA領域のDNAメチル化解析栄養成長期(葉)と生殖成長期(葯)を用いて、長鎖non-coding RNAの周辺領域のゲノムワイドなDNAメチル化解析を行った。本年度までに、シーケンシング、及び、イネゲノムへのマッピングを終了し、現在、2サンプル間における771カ所のDNAメチル化度合いを比較し、non-coding RNAの発現制御に関与する領域を探索している。
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
登录
查看更多内容
Biogenesis of small RNAs interacting with rice MEL1, a germ-cell specific AGO protein
小RNA与水稻MEL1(一种生殖细胞特异性AGO蛋白)相互作用的生物发生
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Sachiko Shirasawa, et al., Reina Komiya, 小宮怜奈, Reina Komiya]
通讯作者:
Reina Komiya
It's a small world (Rice reproduction version)
世界真小(稻米再现版)
DOI:
--
发表时间:
2011
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Sachiko Shirasawa, et al., Reina Komiya, 小宮怜奈, Reina Komiya, 小宮怜奈, 小宮怜奈, 小宮怜奈, 小宮怜奈]
通讯作者:
小宮怜奈
生殖特異的Argonaute, MEL1に結合するsmall RNAの生合成経路
小RNA与生殖特异性Argonaute、MEL1结合的生物发生途径
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Sachiko Shirasawa, et al., Reina Komiya, 小宮怜奈]
通讯作者:
小宮怜奈
イネ生殖細胞特異的Argonauteタンパク質,MEL1と結合するsmall RNAsの同定
鉴定与水稻生殖细胞特异性 Argonaute 蛋白 MEL1 结合的小 RNA
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Sachiko Shirasawa, et al., Reina Komiya, 小宮怜奈, Reina Komiya, 小宮怜奈]
通讯作者:
小宮怜奈
solation and Bioinformatic Analyses of Small RNAs Interacting with Germ Cell-Specific Argonaute in Rice
水稻中与生殖细胞特异性 Argonaute 相互作用的小 RNA 的分离和生物信息学分析
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Komiya R, Nonomura K]
通讯作者:
Nonomura K
共 8 条
国内基金
海外基金
登录
查看更多内容
昼夜节律性small RNA在血斑形成时间推断中的法医学应用研究
-
批准号:
-
项目类别:省市级项目
-
资助金额:--
-
批准年份:2024
-
负责人:
-
依托单位:
tRNA-derived small RNA上调YBX1/CCL5通路参与硼替佐米诱导慢性疼痛的机制研究
-
批准号:
-
项目类别:省市级项目
-
资助金额:10.0万元
-
批准年份:2022
-
负责人:张祥忠
-
依托单位:
Small RNA调控I-F型CRISPR-Cas适应性免疫性的应答及分子机制
-
批准号:32000033
-
项目类别:青年科学基金项目
-
资助金额:24.0万元
-
批准年份:2020
-
负责人:林平
-
依托单位:
基于small RNA 测序技术解析鸽分泌鸽乳的分子机制
-
批准号:31802058
-
项目类别:青年科学基金项目
-
资助金额:26.0万元
-
批准年份:2018
-
负责人:麻慧
-
依托单位:
Small RNA介导的DNA甲基化调控的水稻草矮病毒致病机制
-
批准号:31772128
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:60.0万元
-
批准年份:2017
-
负责人:吴建国
-
依托单位:
异源small RNA调控芸薹属蔬菜遗传变异发生的分子机制研究
-
批准号:31272159
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:80.0万元
-
批准年份:2012
-
负责人:陈利萍
-
依托单位:
植物中small RNA介导的基因调控网络的构建
-
批准号:31100937
-
项目类别:青年科学基金项目
-
资助金额:25.0万元
-
批准年份:2011
-
负责人:孟一君
-
依托单位: