スリランカ中北部に多発する慢性腎臓病についての研究
スリランカ中北部に多発する慢性腎臓病についての研究
批准号:
11J02361
负责人:
ナナヤッカラ S
金额:
$0.83万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2011
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2011 至 2012
中文摘要
スリランカ東北部で原因不明の慢性腎疾患が多発しており、この医療問題が人的損失と医療費を増加させ、経済発展の阻害要因の一つとなっている。このような現状を打開するため、筆者は慢性腎疾患の原因を解明を行う。この研究は、京都大学医学研究科環境衛生学分野の小泉昭夫教授の率いる筆者等のチームとスリランカ民主社会主義共和国のペラデニア大学のDr. Nimmi Athuraliyaのチームによる共同研究である。この疾患の多発する要因として、遺伝背景と環境要因が関与すると思われる。慢性腎疾患の解明により、予防施策の確立や早期診断に資する。1.環境有害物質検討:発症地域由来の米と飲料水サンプル中の重金属濃度は、推奨範囲内であった。血清フッ化物濃度は、eGFRと逆相関を示し、CKDu進行に関連する二次要因であるようにみえる。また尿検査によって軽度のヒ素暴露を明らかにした。2.病理的検討:5例のCKDu患者の腎生検について電子顕微鏡分析を行い、糸球体基底膜の軽度の皺、内皮下の浮腫や足突起の部分的な消失を明らかにした。3.疫学的検討:2011年のサンプルプログラムで収集したCKDu症例と対照のデータの分析を行った。農業、喫煙、ベテルチューイング、噛みたばこや蛇咬傷の既往歴が対照と比べ、CKDu症例で高かった。4.遺伝疫学的検討:GWASと全Exomeシークエンス解析により、各々の方法でSLC13A3とKCNA10遺伝子上にCKDu病因と関連した主要な変異体を同定した。更に症例でのみLAMB2やSLC39A8遺伝子で希少な変異体が得られた。機能解析により、SLC13A3プロモーター活性とeGFR間での有意な関連を明らかにし、高プロモーター活性がCKDuの保護効果を持つことを示唆された。以上の内容でJournal of Human Geneticsへ投稿中である。
英文摘要
スリランカ東北部で原因不明の慢性腎疾患が多発しており、この医療問題が人的損失と医療費を増加させ、経済発展の阻害要因の一つとなっている。このような現状を打開するため、筆者は慢性腎疾患の原因を解明を行う。この研究は、京都大学医学研究科環境衛生学分野の小泉昭夫教授の率いる筆者等のチームとスリランカ民主社会主義共和国のペラデニア大学のDr. Nimmi Athuraliyaのチームによる共同研究である。この疾患の多発する要因として、遺伝背景と環境要因が関与すると思われる。慢性腎疾患の解明により、予防施策の確立や早期診断に資する。1.環境有害物質検討:発症地域由来の米と飲料水サンプル中の重金属濃度は、推奨範囲内であった。血清フッ化物濃度は、eGFRと逆相関を示し、CKDu進行に関連する二次要因であるようにみえる。また尿検査によって軽度のヒ素暴露を明らかにした。2.病理的検討:5例のCKDu患者の腎生検について電子顕微鏡分析を行い、糸球体基底膜の軽度の皺、内皮下の浮腫や足突起の部分的な消失を明らかにした。3.疫学的検討:2011年のサンプルプログラムで収集したCKDu症例と対照のデータの分析を行った。農業、喫煙、ベテルチューイング、噛みたばこや蛇咬傷の既往歴が対照と比べ、CKDu症例で高かった。4.遺伝疫学的検討:GWASと全Exomeシークエンス解析により、各々の方法でSLC13A3とKCNA10遺伝子上にCKDu病因と関連した主要な変異体を同定した。更に症例でのみLAMB2やSLC39A8遺伝子で希少な変異体が得られた。機能解析により、SLC13A3プロモーター活性とeGFR間での有意な関連を明らかにし、高プロモーター活性がCKDuの保護効果を持つことを示唆された。以上の内容でJournal of Human Geneticsへ投稿中である。
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会议论文
An Integrative Study on Genetic and Environmental Determinants of Chronic Kidney Disease of Unknown Etiology in Sri Lanka
斯里兰卡病因不明的慢性肾病的遗传和环境决定因素的综合研究
DOI:
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发表时间:
2013
期刊:
影响因子:
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作者:
[Koizumi A, et al, Nanavakkara Shanika.]
通讯作者:
Nanavakkara Shanika.
スリランカ中北部地域における原因不明の慢性腎臓病(CKDu)の全ゲノム相関解析
斯里兰卡中北部地区不明原因慢性肾脏病 (CKDu) 的全基因组相关性分析
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Shanika Nanayakkara, STMLD Senevirathna, 人見敏明、原田浩二、小泉昭夫]
通讯作者:
人見敏明、原田浩二、小泉昭夫
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精准表型鉴定联合pan-GWAS发掘谷子萌发期抗旱性的关键候选基因及优异等位变异
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批准号:32500337
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项目类别:青年科学基金项目(C类)
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资助金额:30.00万元
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批准年份:2025
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负责人:杨阳
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依托单位:
整合GWAS与单细胞多组学解析克罗恩病纤维化中肠道菌群-宿主互作机制研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:魏艳玲
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依托单位:
基于多表型GWAS的广西壮族肌少—骨质疏松症遗传解析及应用研究
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批准号:82560288
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项目类别:地区科学基金项目
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资助金额:32.00万元
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批准年份:2025
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负责人:宾晓芸
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依托单位:
基于全基因组关联分析(GWAS) 的林麝麝香质量相关基因挖掘
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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批准年份:2025
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负责人:郑瑶
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依托单位:
基于深度学习的冬虫夏草寄主生态型GWAS解析与精准育种策略研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:卫秋阳
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依托单位:
基于GWAS数据的子宫内膜异位症因果因素筛选及其多因素风险预测模型的构建与临床验证
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批准号:2025JJ80570
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项目类别:省市级项目
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批准年份:2025
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负责人:粟艳林
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依托单位:
GWAS引导的可解释机器学习基因组选择方法研究
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批准号:32502884
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项目类别:青年科学基金项目(C类)
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资助金额:30.00万元
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批准年份:2025
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负责人:吴平先
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依托单位:
基于NIRS和GWAS分析的甘薯品质性状关键基因挖掘及功能研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:15.0万元
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批准年份:2024
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负责人:唐朝臣
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依托单位:
基于 GWAS 策略研究儿童抗结核药物肝损伤药物基因组
学标志物及风险预测模型
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批准号:2024JJ8155
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项目类别:省市级项目
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批准年份:2024
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负责人:何利
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依托单位:
基于GWAS分析的桂花结实性状关联基因OfAGL62的功能验证与调控网络研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2024
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负责人:
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依托单位: