The possibility of unknown viral infection with primary biliary cirrhosis and the disease association with anellovirus infection.

原发性胆汁性肝硬化未知病毒感染的可能性以及该疾病与指环病毒感染的关联。

• 批准号: 23790765
• 负责人: NINOMIYA Masashi
• 金额: $ 2.25万
• 依托单位: Tohoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23790765/
• 关键词: 肝臓学; 肝炎ウイルス; microRNA; 次世代シークエンサー; 原発性胆汁性肝硬変

We tried to sequence hepatitis C virus (HCV) genome with RDV method, before conducting RDV method with serum in PBC patients or NOD. c3c4 mice. But this method seemed to be impossible to detect unknown viral sequence. Therefore, we tried to use deep sequencing technology.Result: The reads of HCV origin mapped 8583 reads on the reference HCV genome. The reads of HCV origin were detectable in about 0.10% of the total reads. Surprisingly, the coverage showed 98.8% and read depth indicated 69.5x. In NS3, the position of 5 amino acid bases showed mixed variants.

在对PBC患者和NOD患者血清进行RDV检测之前，我们尝试用RDV法对丙型肝炎病毒（HCV）进行全基因组测序。C3C4小鼠。但这种方法似乎不可能检测到未知的病毒序列。结果：HCV基因组同源序列在HCV参考基因组上共定位了8583个同源序列。HCV来源的读数在总读数的约0.10%中可检测到。令人惊讶的是，覆盖率显示98.8%，读取深度指示69.5x。在NS3中，5个氨基酸碱基的位置显示混合变体。

项目成果

次世代シークエンサーを用いた、C型肝炎ウイルスゲノム解析と血清内 microRNAのプロファイリング

使用下一代测序仪进行丙型肝炎病毒基因组分析和血清 microRNA 分析

• 发表时间: 2012
• 作者: Ninomiya M;Ueno Y;Funayama R;Kagashima T;Nishida Y;Kondo Y;Inoue J;Kakazu E;Kimura O;Nakayama K;Shimosegawa T;二宮匡史;二宮匡史;Ninomiya M;Ninomiya M;二宮匡史
• 通讯作者: 二宮匡史

HBc抗体陽性レシピエントに臍帯血移植を施行、HBV再活性化が認められたde novo B型肝炎の1例

1 例 HBc 抗体阳性受者在进行脐带血移植后观察到 HBV 再激活的新发乙型肝炎病例。

• 发表时间: 2011
• 作者: Ninomiya M;Ueno Y;Funayama R;Kagashima T;Nishida Y;Kondo Y;Inoue J;Kakazu E;Kimura O;Nakayama K;Shimosegawa T;二宮匡史;二宮匡史;Ninomiya M;Ninomiya M;二宮匡史;二宮匡史;二宮匡史;Ninomiya Masashi;Ninomiya Masashi;二宮匡史;二宮匡史;Ninomiya M;二宮匡史 上野義之 福島耕治 近藤泰輝 井上淳 嘉数英二 涌井祐太 下瀬川徹
• 通讯作者: 二宮匡史 上野義之 福島耕治 近藤泰輝 井上淳 嘉数英二 涌井祐太 下瀬川徹

次世代シークエンサーを用いた、C型肝炎ウイルスゲノム解析と血清内microRNAのプロファイリング

使用下一代测序仪进行丙型肝炎病毒基因组分析和血清 microRNA 分析

• 发表时间: 2012
• 作者: Ninomiya M;Ueno Y;Funayama R;Kagashima T;Nishida Y;Kondo Y;Inoue J;Kakazu E;Kimura O;Nakayama K;Shimosegawa T;二宮匡史;二宮匡史;Ninomiya M;Ninomiya M;二宮匡史;二宮匡史;二宮匡史;Ninomiya Masashi;Ninomiya Masashi;二宮匡史
• 通讯作者: 二宮匡史

Efficiency of detecting hepatitis C virus using deep sequencing technology: high faculty to differentiate the viral variants compared with Sanger sequencing

使用深度测序技术检测丙型肝炎病毒的效率：与桑格测序相比，区分病毒变异的能力更高

• 发表时间: 2011
• 作者: Ninomiya M;Ueno Y;Funayama R;Kagashima T;Nishida Y;Kondo Y;Inoue J;Kakazu E;Kimura O;Nakayama K;Shimosegawa T;二宮匡史;二宮匡史;Ninomiya M;Ninomiya M;二宮匡史;二宮匡史;二宮匡史;Ninomiya Masashi;Ninomiya Masashi;二宮匡史;二宮匡史;Ninomiya M
• 通讯作者: Ninomiya M

次世代シークエンサーを用いたC型肝炎ウイルスのアミノ酸配列解析と従来のSanger法シークエンスとの比較第48回

使用二代测序仪分析丙型肝炎病毒氨基酸序列并与传统桑格法测序No.48进行比较

• 发表时间: 2012
• 作者: Ninomiya M;Ueno Y;Funayama R;Kagashima T;Nishida Y;Kondo Y;Inoue J;Kakazu E;Kimura O;Nakayama K;Shimosegawa T;二宮匡史
• 通讯作者: 二宮匡史