课题基金 / 基金详情

パラボド目における底棲性鞭毛虫の多様性及び魚介類寄生虫の進化的起源の解明

パラボド目における底棲性鞭毛虫の多様性及び魚介類寄生虫の進化的起源の解明
阐明抛物目底栖鞭毛虫的多样性以及鱼类和贝类寄生虫的进化起源
批准号:
12J00007
负责人:
石川 奏太
金额:
$1.73万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2012
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2012-04-01 至 2015-03-31

项目摘要

项目成果

石川 奏太的其他基金

相关文献

中文摘要
翻译
点击翻译按钮获取中文摘要
英文摘要
昨年度までの成果として、キネトプラスチダ類パラボド目に属する寄生性鞭毛虫Trypanoplasma borreli(魚介類住血虫)に加え、マボヤの「被嚢軟化症」原因寄生虫であり、Hirose et al. Dis. Aquat. Organ., 97(3):227-235, 2012にてパラボド目との近縁性が示唆されたAzuminobodo hoyamushiそれぞれの大量培養を行い、Illumina Hi-seq 2000によるシーケンシングから大量のトランスクリプトームデータを得た。最終年度であるH26年度では、まず上記トランスクリプトームデータのアセンブリを行った。アセンブリ後、先行研究(Deschamps et al. Mol. Biol. Evol. 28(1):53-58. 2011)を参考に、リボソームタンパク質遺伝子など系統間で保存的な遺伝子の網羅的探索を行うことで、計43遺伝子データの取得に成功した。それぞれの遺伝子について、自由生活性鞭毛虫を含むキネトプラスチド類12種より遺伝子アライメントを構築し、計6,842アミノ酸座位からなる大規模分子系統解析用データセットを作成した。このデータセットに基づく分子系統解析により、キネトプラスチダ類内部の系統関係およびT. borreliおよびA. hoyamushiの系統的位置を頑健に推測することに成功した。最終的に、T. borreliおよびA. hoyamushiはそれぞれパラボド目、ネオボド目という異なる系統に属し、これらの寄生種への進化が独立に起こったことが示された。さらに、T. borreliがパラボド目内部の底棲性自由生活虫であるProcryptobia solokiniに最も近縁であったのに対し、A. hoyamushiは宿主であるマボヤに同じく共生するCruzella marinaに最も近縁であることも示され、両者の寄生性獲得経緯に違いがあることが示唆された。
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
不均一な置換モデルを用いた分子系統解析プログラムの高速化
使用非均匀替换模型加速分子系统发育分析程序
DOI: --
发表时间: 2013
期刊:
影响因子: --
作者: [石川奏太, 中尾昌宏, 佐藤三久]
通讯作者: 佐藤三久
配列組成の不均一性が分子系統解析の頑健性に及ぼす影響 : タンパク質コード遺伝子を想定したシミュレーションによる評価
序列组成异质性对分子系统发育分析稳健性的影响:通过假设蛋白质编码基因的模拟进行评估
DOI: --
发表时间: 2012
期刊: 統計数理(Proceedings of the Institute of StatisticaI Mathematics, 和文誌)
影响因子: --
作者: [石川奏太, 橋本哲男]
通讯作者: 橋本哲男
RY- coding and non-homogeneous models ameliorate the maximum-likelihood inferences from nucleotide sequence data with parallel compositional heterogeneity.
RY 编码和非同质模型改善了具有平行组成异质性的核苷酸序列数据的最大似然推论。
DOI: --
发表时间: 2012
期刊:
影响因子: --
作者: [Sohta Ishikawa. Yuji Inagaki, 'letsuo Hashimoto]
通讯作者: 'letsuo Hashimoto
放散虫と有孔虫が互いに姉妹群とする「レタリア仮説」に基づいたアクチン、チューブリンおよびペプチ ド伸長因子の複雑な進化シナリオ
肌动蛋白、微管蛋白和肽延伸因子的复杂进化场景基于“Letalia假说”,即放射虫和有孔虫是互为姊妹类群。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: [石谷佳之, 石川奏太, 神川龍馬, 矢吹彬憲, 土屋 正史, 稲垣祐司, 瀧下清貴]
通讯作者: 瀧下清貴
14
    ヒト腸内細菌叢における遺伝子水平転移を介した共同体ゲノム進化機構の解明
    • 批准号:
      16J02725
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $2.08万
    • 财政年份:
      2016
    • 负责人:
      石川 奏太
    • 依托单位: