新奇溶菌藻における分子遺伝情報の構築

新型溶藻分子遗传信息的构建

• 批准号: 25450299
• 负责人: 朝山 宗彦
• 金额: $ 3.33万
• 依托单位: Ibaraki University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2013
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2013-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-25450299/
• 关键词: シアノバクテリア; ゲノム情報

本研究課題では、自己溶菌などユニークな特性を有する新種の糸状性シアノバクテリア藻 (藍藻、原核光合成微生物)であるLimnothrix/ Pseudanabaena ABRG5-3株の分子遺伝情報の基盤を構築することを目的とした。 当初の研究計画に基づき、まずABRG5-3株をBG11液体培地で培養後、定常期にある細胞を集菌し、これより全DNA (染色体DNA + 内在性のplasmid DNA) を抽出・精製した。それを試料として、断片化した全DNAの末端にアダプター配列を連結させ、Bridge PCR法でクラスターを作製し、そこにDNAポリメラーゼと蛍光標識した塩基を加え、一塩基ずつゲノム塩基配列を解読していった。その後、配列のアセンブルを行い、Contigを作製しながら、ドラフトシーケンス情報を収集した。このようにして得られた塩基配列情報をもとにして、遺伝子のアノテーションを行なった。その結果、ABRG5-3株がこれまでに知られているシアノバクテリアとは異なり、独自の分子遺伝情報を有していることが示唆された。特に、本株の特性を左右すると思われる重要な遺伝子群（研究計画書参照）を最優先にして分析したところ、転写調節遺伝子などに顕著な特徴が発見された。一方、ABRG5-3株の染色体DNA以外にも、内在性のplasmid DNAと考えられるContigの情報を取得することにも成功した。これら非常にユニークな分子遺伝情報を有する新奇溶菌藻の全体像解明に向け、今後も引き続き遺伝情報分析を重ね、その成果を論文、学会、ホームページなどを通じて公表してゆく所存である。

The purpose of this study is to construct a molecular genetic information template for Limnothrix/ Pseudanabaena ABRG5-3 strain, a new species of algae (cyanobacteria, prokaryotic photosynthetic microorganisms), which has its own bacteriolytic characteristics. In the initial research project, ABRG5-3 strain BG11 was isolated and purified after culture in liquid culture and steady state. All DNA fragments are linked to the ends of the DNA, and the DNA fragments are linked to the ends of the DNA. The DNA fragments are linked to the ends of the DNA. The DNA fragments are linked to the ends of the DNA. After that, the configuration of the file is displayed in the file, the file is displayed in the file, and the file information is collected. This is the first time that I've seen this. The ABRG5-3 strain was isolated from the plant and its molecular genetic information was analyzed. The characteristics of the plant and the important genetic subgroup (reference to the research proposal) are given the highest priority in the analysis, and the characteristics of the regulatory gene are found The chromosome DNA of ABRG5-3 strain was successfully detected by plasmid DNA analysis. The molecular genetic information of novel lysozyme is available, and the molecular genetic information analysis of novel lysozyme is important, and the results of this study are published in the paper, society, and literature.

项目成果

Cyanobacterial Autolysis and its Utilization for Easy Recovery of Target Gene Product

蓝藻自溶及其用于轻松回收目标基因产物的利用

• 发表时间: 2013
• 作者: Choa、A.;Kuda;T.;Yazaki;T.;Takahashi;T.;Kimura;B.;ASAYAMA Munehiko
• 通讯作者: ASAYAMA Munehiko