ジェネティックな変異とエピジェネティックな変異の解析による新規酵母耐熱化法の構築
ジェネティックな変異とエピジェネティックな変異の解析による新規酵母耐熱化法の構築
批准号:
14J01413
负责人:
里村 淳
金额:
$1.79万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2014
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2014-04-25 至 2017-03-31
中文摘要
熱耐性酵母を作製するためのハイスループットなゲノム編集法を開発した。これまでのゲノム編集法であるCRISPR Cas9システムでは、約30%の塩基配列は書き換えることができない欠点があった。特に、これまでの研究で発見した4つ中2つの変異は、この30%の領域に属していたため、ゲノム編集が使えなかった。そこで、編集可能領域に制限がなく、迅速にゲノムを書き換えることができる新規手法CRISPR Nickaseシステムを開発した。この手法は理論上ゲノムの97%以上の領域を編集することができる。また、特異性の点でもCRISPR Cas9システムよりも向上しており、より簡便なゲノム編集法であることを示すことができた。最終的にはこの手法により熱耐性酵母をわずか5日で構築できることをデモンストレーションした。これはこれまでの方法より10日ほど早いもので、報告されている中で最速の手法である。これらの酵母は既存法で構築したものと同様の表現型を示したことからも、CRISPR Nickase法の有用性を示すことができた。本内容はScientific Report (Nature publication group)に投稿して、受理された。
英文摘要
熱耐性酵母を作製するためのハイスループットなゲノム編集法を開発した。これまでのゲノム編集法であるCRISPR Cas9システムでは、約30%の塩基配列は書き換えることができない欠点があった。特に、これまでの研究で発見した4つ中2つの変異は、この30%の領域に属していたため、ゲノム編集が使えなかった。そこで、編集可能領域に制限がなく、迅速にゲノムを書き換えることができる新規手法CRISPR Nickaseシステムを開発した。この手法は理論上ゲノムの97%以上の領域を編集することができる。また、特異性の点でもCRISPR Cas9システムよりも向上しており、より簡便なゲノム編集法であることを示すことができた。最終的にはこの手法により熱耐性酵母をわずか5日で構築できることをデモンストレーションした。これはこれまでの方法より10日ほど早いもので、報告されている中で最速の手法である。これらの酵母は既存法で構築したものと同様の表現型を示したことからも、CRISPR Nickase法の有用性を示すことができた。本内容はScientific Report (Nature publication group)に投稿して、受理された。
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全ゲノム解析による実験室進化Saccharomyces cerevisiaeの熱適応戦略の分子解析
使用全基因组分析对实验室进化的酿酒酵母的热适应策略进行分子分析
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[里村 淳, 三浦 夏子, 黒田浩一, 植田 充美]
通讯作者:
植田 充美
Precise genome editing at single-base resolution by novel CRISPR-nickase system
通过新型 CRISPR 切口酶系统以单碱基分辨率进行精确基因组编辑
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[A. Satomura, K. Kuroda, M. Ueda]
通讯作者:
M. Ueda
Molecular analysis of adaptational strategies under heat stress by whole-genome sequencing of laboratory-evolved Saccharomyces cerevisiae
通过实验室进化的酿酒酵母的全基因组测序对热应激下的适应策略进行分子分析
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Atsushi Satomura, Natsuko Miura, Kouichi Kuroda, Mitsuyoshi Ueda]
通讯作者:
Mitsuyoshi Ueda
Generation of functionally and structurally distinct Rhizopus oryzae lipase through protein folding memory
通过蛋白质折叠记忆生成功能和结构不同的米根霉脂肪酶
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Atsushi Satomura, Kouichi Kuroda, Mitsuyoshi Ueda]
通讯作者:
Mitsuyoshi Ueda
Stepwise breeding of Saccharomyces cerevisiae for identifications of genetic mutations involved with thermotolerance
酿酒酵母的逐步育种用于鉴定与耐热性相关的基因突变
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Atsushi Satomura, Kouichi Kuroda, Mitsuyoshi Ueda]
通讯作者:
Mitsuyoshi Ueda
共 8 条