膜タンパク質の動態解析のための次世代固体NMR測定技術の開発
膜タンパク質の動態解析のための次世代固体NMR測定技術の開発
批准号:
14J04060
负责人:
田巻 初
金额:
$1.41万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2014
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2014-04-25 至 2016-03-31
中文摘要
本研究の目的は、固体NMRによるタンパク質動態解析に高速測定技術を導入し、膜タンパク質等の高難易度試料を実用的に解析可能な手法を開発することであった。動態解析において重要であるタンパク質立体構造について、平成26年度の研究により、常磁性緩和促進による構造情報と立体構造予測手法を組み合わせることで、従来法より少ない情報から効率的に決定できる手法を開発した。平成27年度では、構造計算に使用した構造制限が妥当性であることを、数値解析により示した。また、高速多次元スペクトル測定技術である圧縮センシングを、七回膜貫通型タンパク質であり、光遺伝学への応用が期待されているナトリウムイオンポンプ型ロドプシンの測定に適用した。その結果、3次元CANCO測定のサンプリング点を10分の1まで圧縮した場合においても、スペクトルの特徴を保持したまま再構成可能であることを明らかにした。平成26年度に行なった、常磁性緩和促進の応用による測定時間短縮の結果も踏まえると、トータルで測定時間を16分の1まで短縮することに成功した。また、これらの技術は動態解析の基盤であるため、大きな意義があると考えている。動態解析については、本研究開始と同時に納入された固体NMR装置の安定稼動まで時間を要したため、十分な成果は得られていない。しかし、上述の通り解析技術の基礎は構築できており、近いうちに動態解析についても進展を遂げられるだろう、と考えている。
英文摘要
本研究の目的は、固体NMRによるタンパク質動態解析に高速測定技術を導入し、膜タンパク質等の高難易度試料を実用的に解析可能な手法を開発することであった。動態解析において重要であるタンパク質立体構造について、平成26年度の研究により、常磁性緩和促進による構造情報と立体構造予測手法を組み合わせることで、従来法より少ない情報から効率的に決定できる手法を開発した。平成27年度では、構造計算に使用した構造制限が妥当性であることを、数値解析により示した。また、高速多次元スペクトル測定技術である圧縮センシングを、七回膜貫通型タンパク質であり、光遺伝学への応用が期待されているナトリウムイオンポンプ型ロドプシンの測定に適用した。その結果、3次元CANCO測定のサンプリング点を10分の1まで圧縮した場合においても、スペクトルの特徴を保持したまま再構成可能であることを明らかにした。平成26年度に行なった、常磁性緩和促進の応用による測定時間短縮の結果も踏まえると、トータルで測定時間を16分の1まで短縮することに成功した。また、これらの技術は動態解析の基盤であるため、大きな意義があると考えている。動態解析については、本研究開始と同時に納入された固体NMR装置の安定稼動まで時間を要したため、十分な成果は得られていない。しかし、上述の通り解析技術の基礎は構築できており、近いうちに動態解析についても進展を遂げられるだろう、と考えている。
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Protein structure determination by paramagnetic solid-state NMR
通过顺磁固态 NMR 测定蛋白质结构
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Hajime Tamaki, Ayako Egawa, Masakatsu Kamiya, Takashi Kikukawa, Tomoyasu Aizawa, Toshimichi Fujiwara, and Makoto Demura]
通讯作者:
and Makoto Demura
固体NMRによるタンパク質測定への圧縮センシングの応用
压缩传感在固态核磁共振蛋白质测量中的应用
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[田巻初, 斉藤優太, 江川文子, 菊川峰志, 神谷昌克, 相沢智康, 藤原敏道, 出村誠]
通讯作者:
出村誠
固体NMR法を用いたナトリウムポンプ型ロドプシンの構造解析
采用固态核磁共振法分析钠泵视紫红质的结构
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[斉藤優太, 田巻初, 江川文子, 菊川峰志, 神谷昌克, 相沢智康, 藤原敏道, 出村誠]
通讯作者:
出村誠
pplication of compressed sensing to solid-state NMR measurements of heptahelical membrane protein
压缩传感在七螺旋膜蛋白固态核磁共振测量中的应用
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Hajime Tamaki, Yuta Saito, Ayako Egawa, Takashi Kikukawa, Masakatsu Kamiya, Tomoyasu Aizawa, Toshimichi Fujiwara, and Makoto Demura]
通讯作者:
and Makoto Demura
Application of paramagnetic relaxation enhancement to solid-state NMR protein structure analysis
顺磁弛豫增强在固态核磁共振蛋白质结构分析中的应用
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Hajime Tamaki, Ayako Egawa, Masakatsu Kamiya, Takashi Kikukawa, Tomoyasu Aizawa, Toshimichi Fujiwara, and Makoto Demura, 田巻初・江川文子・木戸浩貴・亀田倫史・神谷昌克・菊川峰志・相沢智康・藤原敏道・出村誠, 田巻初・江川文子・木戸浩貴・亀田倫史・神谷昌克・菊川峰志・相沢智康・藤原敏道・出村誠]
通讯作者:
田巻初・江川文子・木戸浩貴・亀田倫史・神谷昌克・菊川峰志・相沢智康・藤原敏道・出村誠
共 8 条
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