ポストゲノミクスを基盤としたペルオキシソーム分裂装置の構造と分子機構の解明
ポストゲノミクスを基盤としたペルオキシソーム分裂装置の構造と分子機構の解明
批准号:
14J04556
负责人:
井元 祐太
金额:
$5.99万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2014
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2014-04-25 至 2017-03-31
中文摘要
本研究に置いて、我々はペルオキシソーム分裂装置(POD machinery)の主要構造であるDB ringのsemi-in vivo再構築系を開発し、ringの形成起点Dynamin-based ring organizing center (DOC)を同定することに成功した。mCherry-tagged Dnm1の細胞内局在解析によって、新規合成されたGTP結合型のDnm1が細胞質からDB ring上に局在化することが分かった。GTP結合型Dnm1はDB ring上に一ヵ所存在するDOCを起点としてGTP濃度依存的に一方向へ伸長した。従ってDB ringは微小管同様に方向性を持つ構造であることが予測される。興味深いことにDOCは直径500nm未満、すなわち膜分断の最終段階においてはDB ring上に二箇所形成されることが分かった。各DOCからはそれぞれ独立したDB ringが形成されていることから、包膜の分断においてはより強い収縮力を発揮するため二重構造のDB ringが必要である可能性が考えられる。この仮説は、in vivoにおいて高電子密度のリング幅が増加すること、in vitroにおいてDnm1-ringの脂質膜へ接触面の増加がより顕著な脂質膜の変形を引き起こすという過去の研究結果と一致している。以上の結果をまとめ、Journal of Cell science誌に発表し当該号のHighlight articleに選ばれた。また、ミトコンドリア分裂装置上においてもDOC様構造の存在が強く示唆されているため(投稿準備中)、本研究で同定されたDOCは普遍性を持つ構造であると考えられる。この成果に加え、プロテオーム解析を基盤とした手法によってPOD machineryの構成タンパク質同定にも成功しており、装置の形成機構、分子構造の解明に大きな進展を得られている。
英文摘要
本研究に置いて、我々はペルオキシソーム分裂装置(POD machinery)の主要構造であるDB ringのsemi-in vivo再構築系を開発し、ringの形成起点Dynamin-based ring organizing center (DOC)を同定することに成功した。mCherry-tagged Dnm1の細胞内局在解析によって、新規合成されたGTP結合型のDnm1が細胞質からDB ring上に局在化することが分かった。GTP結合型Dnm1はDB ring上に一ヵ所存在するDOCを起点としてGTP濃度依存的に一方向へ伸長した。従ってDB ringは微小管同様に方向性を持つ構造であることが予測される。興味深いことにDOCは直径500nm未満、すなわち膜分断の最終段階においてはDB ring上に二箇所形成されることが分かった。各DOCからはそれぞれ独立したDB ringが形成されていることから、包膜の分断においてはより強い収縮力を発揮するため二重構造のDB ringが必要である可能性が考えられる。この仮説は、in vivoにおいて高電子密度のリング幅が増加すること、in vitroにおいてDnm1-ringの脂質膜へ接触面の増加がより顕著な脂質膜の変形を引き起こすという過去の研究結果と一致している。以上の結果をまとめ、Journal of Cell science誌に発表し当該号のHighlight articleに選ばれた。また、ミトコンドリア分裂装置上においてもDOC様構造の存在が強く示唆されているため(投稿準備中)、本研究で同定されたDOCは普遍性を持つ構造であると考えられる。この成果に加え、プロテオーム解析を基盤とした手法によってPOD machineryの構成タンパク質同定にも成功しており、装置の形成機構、分子構造の解明に大きな進展を得られている。
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Lipid Droplet Formation in Cells of the Filamentous Green Alga <i>Klebsormidium nitens</i> as Revealed by BODIOY-DiOC<sub>6</sub> and BODIPY-Nile Red Double-Staining Microscopy
BODIOY-DiOC<sub>6</sub> 和 BODIPY-尼罗红双染色显微镜揭示丝状绿藻 <i>Klebsormidium nitens</i> 细胞中脂滴的形成
DOI:
10.1508/cytologia.79.501
发表时间:
2014
期刊:
CYTOLOGIA
影响因子:
1
作者:
[Kuroiwa T, Ohnuma M, Imoto Y, and Kuroiwa H]
通讯作者:
and Kuroiwa H
Ultrastructure of Ring-shaped Supramolecular Nanomachinery for the Division of Peroxisome and Mitochondrion Revealed by EM-Based Single Organelle Analysis
基于电镜的单细胞器分析揭示了用于过氧化物酶体和线粒体分裂的环形超分子纳米机械的超微结构
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Imoto Y, Kuroiwa T, Fujiki Y]
通讯作者:
Fujiki Y
単膜系オルガネラ分裂リングの同定 - ゲノム科学を基盤としたペルオキシソーム分裂装置(POD machinery)の微細構造と分子機構の解析
单膜细胞器分裂环的鉴定——基于基因组科学分析过氧化物酶体分裂机制(POD机制)的精细结构和分子机制
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[井元 祐太, 黒岩 晴子, 吉田 大和, 大沼 みお, 藤原 崇之, 吉田 昌樹, 西田 敬二, 八木沢 芙美, 廣岡 俊亮, 宮城島 進也, 三角 修己, 河野 重行, 黒岩 常祥]
通讯作者:
黒岩 常祥
超分子ナノマシンPeroxisome-dividing ringの形成起点同定とGTP濃度依存的伸長機構の解明
超分子纳米机器过氧化物酶体分隔环形成起源的鉴定及GTP浓度依赖性延伸机制的阐明
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[井元祐太, 阿部雄一, 奥本寛治, 本庄雅則, 黒岩晴子, 黒岩常祥, 藤木幸夫]
通讯作者:
藤木幸夫
Discovery of ring-shaped supramolecular nanomachinery for organelle division by single-organelle EM analysis
通过单细胞器电镜分析发现用于细胞器分裂的环形超分子纳米机械
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Imoto Y, Kuroiwa T, Fujiki Y]
通讯作者:
Fujiki Y
共 6 条
ミトコンドリア紡錘体に制御されるマイクロボディ分裂機構のポストゲノム科学的解明
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批准号:12J06759
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.15万
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财政年份:2012
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负责人:井元 祐太
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依托单位: