课题基金 / 基金详情

緑色海藻アオサ属にみられる汽水から淡水への適応進化の分子基盤

緑色海藻アオサ属にみられる汽水から淡水への適応進化の分子基盤
石莼属绿色海藻从咸水到淡水适应进化的分子基础
批准号:
14J08330
负责人:
市原 健介
金额:
$2.58万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2014
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2014-04-25 至 2017-03-31

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
1) 四万十川採集個体でのRAD-seq解析昨年度に四万十川で採集し、SNPやマイクロサテライト部位などのゲノム中の多型情報を得るために、RAD-seq解析をおこなった。2) スジアオノリの配偶子および2本鞭毛型、4本鞭毛型無性胞子のRNA-seq解析スジアオノリの両接合型の配偶子、および2本鞭毛型無性胞子(無性配偶子)、4本鞭毛型無性胞子(無性胞子)を生殖細胞誘導によって、回収し、これらの細胞で発現している遺伝子の比較をおこなうためにRNA-seq解析をおこなった。真核生物における減数分裂コア遺伝子が保存されていることがわかり、このうち姉妹染色分体の結合に機能しているコヒーシン関連遺伝子(SYN3)が無性胞子や無性配偶子で発現量が低くなっており、前年度に観察された無性個体の生殖細胞形成時の第一減数分裂時に姉妹染色分体が乖離する現象と一致しているように思われた。3) スジアオノリとヒラアオノリの全ゲノム解析スジアオノリのゲノム解析を進め、現在までにドラフトゲノムの状態ではあるが、オスのゲノムサイズが約70 Mbpで遺伝子数は8,244個であることがわかっている。近縁種ヒラアオノリとスジアオノリのゲノムを比較したところ、ゲノム全体ではシンテニーが高度に保存されていることが確認できたが、性染色体領域ではシンテニーが失われており、この領域では遺伝子の転座等が起こりやすく、進化速度が速い領域であることが示唆された。またヒラアオノリで単離された性特異的な領域の遺伝子の多くは,スジアオノリにおいても,特定のスカッホールドにクラスター化して存在していることが明らかとなり,この性特異的な染色体領域はアオノリの性決定に保存的に機能していると考えられた。
英文摘要
1) 四万十川採集個体でのRAD-seq解析昨年度に四万十川で採集し、SNPやマイクロサテライト部位などのゲノム中の多型情報を得るために、RAD-seq解析をおこなった。2) スジアオノリの配偶子および2本鞭毛型、4本鞭毛型無性胞子のRNA-seq解析スジアオノリの両接合型の配偶子、および2本鞭毛型無性胞子(無性配偶子)、4本鞭毛型無性胞子(無性胞子)を生殖細胞誘導によって、回収し、これらの細胞で発現している遺伝子の比較をおこなうためにRNA-seq解析をおこなった。真核生物における減数分裂コア遺伝子が保存されていることがわかり、このうち姉妹染色分体の結合に機能しているコヒーシン関連遺伝子(SYN3)が無性胞子や無性配偶子で発現量が低くなっており、前年度に観察された無性個体の生殖細胞形成時の第一減数分裂時に姉妹染色分体が乖離する現象と一致しているように思われた。3) スジアオノリとヒラアオノリの全ゲノム解析スジアオノリのゲノム解析を進め、現在までにドラフトゲノムの状態ではあるが、オスのゲノムサイズが約70 Mbpで遺伝子数は8,244個であることがわかっている。近縁種ヒラアオノリとスジアオノリのゲノムを比較したところ、ゲノム全体ではシンテニーが高度に保存されていることが確認できたが、性染色体領域ではシンテニーが失われており、この領域では遺伝子の転座等が起こりやすく、進化速度が速い領域であることが示唆された。またヒラアオノリで単離された性特異的な領域の遺伝子の多くは,スジアオノリにおいても,特定のスカッホールドにクラスター化して存在していることが明らかとなり,この性特異的な染色体領域はアオノリの性決定に保存的に機能していると考えられた。
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
生物の科学「遺伝」
生物科学“遗传”
DOI: --
发表时间: 2014
期刊:
影响因子: --
作者: [守山裕大, 竹内純, 小柴和子]
通讯作者: 小柴和子
緑藻スジアオノリに見られるアポミクシスの解析
绿藻 Sudiaonori 中观察到的无融合生殖分析
DOI: --
发表时间: 2016
期刊:
影响因子: --
作者: [市原健介, 宮村新一, 平岡雅規, 河野重行]
通讯作者: 河野重行
アポミクシスはスジアオノリの適応戦略に影響するか?
无融合生殖是否影响鹿角兰的适应策略?
DOI: --
发表时间: 2016
期刊:
影响因子: --
作者: [市原健介 , 山崎誠和 , 宮村新一 , 平岡雅規 , 河野重行]
通讯作者: 河野重行
アオサ藻綱ヒラアオノリのゲノム解読と雌雄ゲノムの比較による性決定領域の探索
通过对石莼藻基因组进行测序并比较雄性和雌性基因组来探索性别决定区域
DOI: --
发表时间: 2015
期刊:
影响因子: --
作者: [山﨑 誠和, 鈴木 亮吾, 市原 健介, 豊田 敦, 桑野 和可, 鈴木 穣, 河野 重行]
通讯作者: 河野 重行
9
    緑色海藻の生殖細胞に性差を生み出す分子機構の解明
    • 批准号:
      24K09512
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $3.0万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      市原 健介
    • 依托单位:
    緑藻スジアオノリ配偶子の微細な性差から解く、細胞間の相互認識と融合の仕組み
    • 批准号:
      21K06242
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $2.66万
    • 财政年份:
      2021
    • 负责人:
      市原 健介
    • 依托单位:
    海藻の『淡水』・『汽水』への適応に関する分子進化学的研究
    • 批准号:
      08J04039
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $1.15万
    • 财政年份:
      2008
    • 负责人:
      市原 健介
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金
    基于植物泛基因组的生姜有性生殖障碍关键分子机制
    • 批准号:
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2025
    • 负责人:
      李洪雷
    • 依托单位:
    尾草履虫有性生殖过程中大规模DNA删除的分子机制探究
    • 批准号:
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2024
    • 负责人:
      高凤
    • 依托单位:
    青海越夏易变区小麦条锈菌有性生殖在病害流行中的作用
    • 批准号:
      32360655
    • 项目类别:
      地区科学基金项目
    • 资助金额:
      32万元
    • 批准年份:
      2023
    • 负责人:
      姚强
    • 依托单位:
    通过单细胞转录组比较的方法研究拟南芥胚珠中两个助细胞在有性生殖过程中的功能分化
    • 批准号:
      32300299
    • 项目类别:
      青年科学基金项目
    • 资助金额:
      30万元
    • 批准年份:
      2023
    • 负责人:
      李玲
    • 依托单位: