緑色海藻アオサ属にみられる汽水から淡水への適応進化の分子基盤
石莼属绿色海藻从咸水到淡水适应进化的分子基础
基本信息
- 批准号:14J08330
- 负责人:
- 金额:$ 2.58万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2014
- 资助国家:日本
- 起止时间:2014-04-25 至 2017-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
1) 四万十川採集個体でのRAD-seq解析昨年度に四万十川で採集し、SNPやマイクロサテライト部位などのゲノム中の多型情報を得るために、RAD-seq解析をおこなった。2) スジアオノリの配偶子および2本鞭毛型、4本鞭毛型無性胞子のRNA-seq解析スジアオノリの両接合型の配偶子、および2本鞭毛型無性胞子(無性配偶子)、4本鞭毛型無性胞子(無性胞子)を生殖細胞誘導によって、回収し、これらの細胞で発現している遺伝子の比較をおこなうためにRNA-seq解析をおこなった。真核生物における減数分裂コア遺伝子が保存されていることがわかり、このうち姉妹染色分体の結合に機能しているコヒーシン関連遺伝子(SYN3)が無性胞子や無性配偶子で発現量が低くなっており、前年度に観察された無性個体の生殖細胞形成時の第一減数分裂時に姉妹染色分体が乖離する現象と一致しているように思われた。3) スジアオノリとヒラアオノリの全ゲノム解析スジアオノリのゲノム解析を進め、現在までにドラフトゲノムの状態ではあるが、オスのゲノムサイズが約70 Mbpで遺伝子数は8,244個であることがわかっている。近縁種ヒラアオノリとスジアオノリのゲノムを比較したところ、ゲノム全体ではシンテニーが高度に保存されていることが確認できたが、性染色体領域ではシンテニーが失われており、この領域では遺伝子の転座等が起こりやすく、進化速度が速い領域であることが示唆された。またヒラアオノリで単離された性特異的な領域の遺伝子の多くは,スジアオノリにおいても,特定のスカッホールドにクラスター化して存在していることが明らかとなり,この性特異的な染色体領域はアオノリの性決定に保存的に機能していると考えられた。
1) the RAD-seq analysis of the collection of forty thousand ten rivers, the analysis of the collection of forty thousand ten rivers in yesterday's year, the analysis of the parts of the collection of forty thousand ten rivers, the analysis of RAD-seq, the analysis of polymorphisms, and the analysis of RAD-seq. 2) two flagellar asexual cells, four flagellate asexual RNA-seq analysis, two flagellar asexual gametes (asexual gametes), four flagellar asexual cells (asexual gametes), four flagellar asexual cells (asexual cells). This is the first time that you can see that you are not in a better position than you are in RNA-seq analysis. In eukaryotes, eucaryote meiosis, mitosis, progeny, eukaryote, meiosis, meiosis, mitosis, meiosis, meiosis, mitosis, mitosis, meiosis, sex, sex and sex. In the previous year, it was observed that during the formation of asexual reproductive cells during the first meiosis, sister staining separated from each other as if they were consistent with each other. 3) A total of about 70 Mbp per month is available. The number of customers per month is about 8244. In recent years, many kinds of equipment have been tested and compared, and all of them have been highly conserved in order to ensure that they are safe. In the field of sex chromosomes, information has been launched, such as in the field of health care, in the field of cancer, in the field of cancer, and so on, and the speed of improvement has been greatly improved. Do you want to know that there is a difference in the number of people in the field of sex in the field of sex?
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
緑藻スジアオノリに見られるアポミクシスの解析
绿藻 Sudiaonori 中观察到的无融合生殖分析
- DOI:
- 发表时间:2016
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:市原健介;宮村新一;平岡雅規;河野重行
- 通讯作者:河野重行
アポミクシスはスジアオノリの適応戦略に影響するか?
无融合生殖是否影响鹿角兰的适应策略?
- DOI:
- 发表时间:2016
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:市原健介 ;山崎誠和 ;宮村新一 ;平岡雅規 ;河野重行
- 通讯作者:河野重行
アオサ藻綱ヒラアオノリのゲノム解読と雌雄ゲノムの比較による性決定領域の探索
通过对石莼藻基因组进行测序并比较雄性和雌性基因组来探索性别决定区域
- DOI:
- 发表时间:2015
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:山﨑 誠和;鈴木 亮吾;市原 健介;豊田 敦;桑野 和可;鈴木 穣;河野 重行
- 通讯作者:河野 重行
Ulva partita ゲノムの雌雄特異的領域にある遺伝子とその発現パターン
石莼基因组性别特异性区域的基因及其表达模式
- DOI:
- 发表时间:2016
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:清水恭夫;山﨑誠和;大田修平;市原健介;鈴木亮吾;宮村新一;桑野和可;河野重行
- 通讯作者:河野重行
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