Development of the protein-gene motif dictionary system based on the codon reduced representation

基于密码子简化表示的蛋白质-基因基序字典系统的开发

• 批准号: 26330250
• 负责人: KATO HIROAKI
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Toyohashi University of Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2014
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2014-04-01 至 2017-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-26330250/
• 关键词: 分子構造情報処理; 配列モチーフ; タンパク質; 遺伝子; コドン縮約表現; コドン重み行列; 三次元モチーフ; データベース; モチーフ; 分子生命情報学; 縮約コドン表現; 配列解析

项目成果

回文フラグメントに注目したタンパク質アミノ酸配列特徴解析システムの開発

专注于回文片段的蛋白质氨基酸序列特征分析系统开发

• 发表时间: 2014
• 作者: 三浦智大;加藤博明
• 通讯作者: 加藤博明

Construction of the protein 3D fragment library system based on glycine neighboring environment

基于甘氨酸邻近环境的蛋白质3D片段库系统构建

• 发表时间: 2014
• 作者: R.Itoh;and H.Kato
• 通讯作者: and H.Kato

Development of the protein-gene sequence motif extraction system based on EM algorithm

基于EM算法的蛋白质-基因序列模体提取系统的开发

• 发表时间: 2016
• 作者: T.Matsubara;and H.Kato
• 通讯作者: and H.Kato

Development of the structural feature analysis system based on the motif combination pattern of proteins

基于蛋白质基序组合模式的结构特征分析系统开发

• 发表时间: 2015
• 作者: S.Azuma;and H.Kato
• 通讯作者: and H.Kato

Development of the DP-based genome sequence analysis system using the motif codon reduced representation

使用主题密码子减少表示开发基于 DP 的基因组序列分析系统

• 发表时间: 2015
• 作者: T.Kobayashi;and H.Kato
• 通讯作者: and H.Kato