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スパース接尾辞木を用いた高速マルチストリーム索引の研究開発

スパース接尾辞木を用いた高速マルチストリーム索引の研究開発
利用稀疏后缀树的高速多流索引的研究与开发
批准号:
15J01438
负责人:
髙木 拓也
金额:
$1.79万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2015
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2015-04-24 至 2018-03-31

项目摘要

项目成果

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本研究課題は,大規模なマルチストリームデータに対する検索やマイニングのために,スパース接尾辞木に基づいた低メモリ性と,オンライン性,多重性,適応性をもつ高速マルチストリーム索引の構築方法と周辺アルゴリズムを開発することを目標としている.平成29年度は主として研究目標である”文字列データのための省メモリな索引の研究開発”に取り組んだ.特に,索引対象の文字列に繰り返し構造が多く含まれる場合,元データサイズよりも省領域を実現する圧縮索引の実現に取り組んだ.この課題は,バージョン管理システムやヒューマンゲノムシーケンスなど非常によく似た文字列の集合に対する索引構造を構築する際の重要な問題である.これを解決するために,申請者は全文索引の1つであるコンパクト有向非巡回語グラフ(Compacted directed acyclic word graph, CDAWG)のグラフ構造が元文字列を生成する文脈自由文法の構文木になっていることを示し,それを用いて圧縮領域でCDAWGを実現する方法を示した.CDAWGは接尾辞木の同型な部分木を1つにまとめ,サイクルがないグラフ構造である有向非巡回グラフとして表現されるものである.このCDAWGは申請者がこれまで主として研究してきた接尾辞木よりも必ず小さい領域で表現できることが知られている.提案データ構造は元データよりも圧縮できる可能性があるにもかかわらず,検索クエリに要する時間は線形領域索引と変わらずパターン長に対して線形時間で可能である.また,CDAWGと文脈自由文法の関係を明らかにしたことも文字列組み合わせ分野としての1つの成果である.
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会议论文
Fully-online construction of suffix trees for multiple texts
完全在线构建多个文本的后缀树
DOI: --
发表时间: 2016
期刊:
影响因子: --
作者: [Takuya Takagi, Shunsuke Inenaga, and Hiroki Arimura]
通讯作者: and Hiroki Arimura
DOI: --
发表时间: 2016
期刊:
影响因子: --
作者: [坂上 陽規, 栗田 和宏, 瀧川 一学, 有村 博紀, 髙木拓也,稲永俊介,有村博紀]
通讯作者: 髙木拓也,稲永俊介,有村博紀
DOI: --
发表时间: 2015
期刊:
影响因子: --
作者: [金子 俊郎, 佐々木 渉太, 高島 圭介, 髙木拓也,有村博紀]
通讯作者: 髙木拓也,有村博紀
On Reverse Engineering the Lyndon Tree
关于林登树的逆向工程
DOI: --
发表时间: 2017
期刊: Proceedings of the Prague Stringology Conference 2017
影响因子: --
作者: [Yuto Nakashima, Takuya Takagi, Shunsuke Inenaga, Hideo Bannai, Masayuki Takeda]
通讯作者: Masayuki Takeda
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