立体構造を基盤に内在性リガンドの探索を目指したヒト由来機能未知GPCRの構造解析
立体構造を基盤に内在性リガンドの探索を目指したヒト由来機能未知GPCRの構造解析
批准号:
15J04343
负责人:
堀田 彰一朗
金额:
$2.58万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2015
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2015-04-24 至 2018-03-31
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標的GPCRの物性評価法の確立蛍光ゲル濾過クロマトグラフィー法と熱安定性評価を組み合わせた物性評価法の確立により、ゲル濾過クロマトグラフィーにおいて熱安定性が高く単分散性が良好な標的GPCRのコンストラクトを選別することに成功した。フィルムサンドウィッチ法の開発ガラスサンドウィッチ法を用いた脂質メソフェーズ結晶化法においては、得られた結晶がスポンジ相の中に得られた場合、結晶を拾うのに困難が伴う。特に細胞外領域や細胞内領域のドメインが大きい場合またはFab抗体との複合体状態で構造解析を目指す場合、得られる結晶はスポンジ相になりやすい。フィルムサンドウィッチ内に結晶を作製することによりそのままX線を照射できるため結晶を無駄にしなくて済む。フィルムサンドウィッチ内部に作製される結晶の品質を調べた結果、フィルムサンドウィッチ法においてもガラスサンドウィッチ法と同程度の分解能を与える結晶を得ることに成功した。標的GPCRの構造決定データセットを可能な限り多く集め構造決定に用いる最終的な回折データセットとした。回折データセット取得の後、Fab化抗体と融合タンパク質、既に登録されている活性型・非活性型GPCRの構造を鋳型として分子置換法を用いることで初期位相の決定を試みた。次に、その後の精密化を通して位相改良とモデルの構築を行い、最終的に3.2オングストロームにおける立体構造の決定に成功し、細胞外領域における構造基盤を明らかにした。
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High-resolution crystal structure of the therapeutic antibody pembrolizumab bound to the human PD-1.
DOI:
10.1038/srep35297
发表时间:
2016-10-13
期刊:
Scientific reports
影响因子:
4.6
作者:
[Horita S, Nomura Y, Sato Y, Shimamura T, Iwata S, Nomura N]
通讯作者:
Nomura N
DOI:
10.1016/j.str.2015.01.014
发表时间:
2015-04-07
期刊:
STRUCTURE
影响因子:
5.7
作者:
[Horita, Shoichiro, Scotti, John S., Thinnes, Cyrille, Mottaghi-Taromsari, Yousef S., Thalhammer, Armin, Ge, Wei, Aik, WeiShen, Loenarz, Christoph, Schofield, Christopher J., McDonough, Michael A.]
通讯作者:
McDonough, Michael A.
DOI:
10.1038/s41594-018-0079-8
发表时间:
2018-07-01
期刊:
NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY
影响因子:
16.8
作者:
[Asada, Hidetsugu, Horita, Shoichiro, Iwata, So]
通讯作者:
Iwata, So
The intervening removable affinity tag (iRAT) production system facilitates Fv antibody fragment-mediated crystallography.
介入的可移除亲和标签 (iRAT) 生产系统有利于 Fv 抗体片段介导的晶体学。
DOI:
10.1002/pro.3035
发表时间:
2016
期刊:
Protein Sci.
影响因子:
--
作者:
[Nomura Y, Sato Y, Suno R, Horita S, Iwata S, Nomura N.]
通讯作者:
Nomura N.
腎酸化ストレスに対するカナグリフロジンの潜在的な抗酸化作用の解明
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批准号:24K11414
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2024
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负责人:堀田 彰一朗
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依托单位:
鉄輸送体の三者複合体による結晶構造解析と基質認識メカニズムの解明
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批准号:11J02637
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.83万
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财政年份:2011
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负责人:堀田 彰一朗
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依托单位:
国内基金
海外基金
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FGFR3-IgG经GPCR/cAMP通路诱导GFAP-A
时周围神经损伤的效应和炎症机制研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:10.0万元
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批准年份:2025
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负责人:龙友明
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依托单位:
候选药物靶向GPCR-TRPs轴干预缺血性脑
卒中协同机制的结构功能研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:10.0万元
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批准年份:2025
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负责人:马丽娟
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依托单位:
类器官结合CRISPR-Cas9筛选:探究GPCR调控滋养层分化及其对先兆子痫的影响研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:毛倩
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依托单位:
基于磁共振方法的GPCR信号通路的蛋白质动态结构研究
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批准号:JCZRJQ202500179
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:
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依托单位:
GPCR靶向药物开发及其在非酒精性脂肪肝炎中的应用
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批准号:JCZRLH202501132
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:
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依托单位:
基于人工智能GPCR动态调控策略的高药效药物设计方法开发
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:付伟
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依托单位:
SCFAs/GPCR调控星形胶质细胞ISR通路在体外循环所致POCD中的作用及机制研究
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批准号:JCZRLH202501180
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:
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依托单位:
BRET/Nanobit 技术探索 GPCR 偏向性信号通
路
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批准号:TGC24C050003
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2024
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负责人:史影
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依托单位:
粘附型 GPCR 分子 ADGRE2 通过
AP-1/DUSP1/DNAJB1 信号轴调控蛋白质稳态
来促进 AML 功能及机制研究
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批准号:Z24H080001
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2024
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负责人:钱鹏旭
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依托单位:
基于多模态辨识和肠道菌群-短链脂肪酸-GPCR通路的连翘降脂药效
物质基础及作用机制研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2024
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负责人:
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依托单位: