タンパク質の構造を基盤とした大腸菌DNA複製再開始機構の解明

基于蛋白质结构阐明大肠杆菌DNA复制重启机制

基本信息

  • 批准号:
    16J00266
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.09万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2016
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2016-04-22 至 2018-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

大腸菌におけるDNA複製再開始機構の一つであるPriA依存的複製再開始は、複数のタンパク質(PriA、PriB、DnaT)がDNA上で規律的に結合・解離する多段階の反応である。そのため、各段階で起こるタンパク質-DNA間、あるいはタンパク質-タンパク質間の相互作用を理解し、それらを繋ぎ合わせることで、複製再開始の全容を解明することが出来ると考えた。本申請ではその中の一つのタンパク質であり、複製装置であるDnaB-DnaC複合体の再導入に必要なDnaTの構造及び機能の解析を通して、DNA複製再開始機構のメカニズムを解明することを目的とした。本年度は、DnaTと複製再開始因子の一つであるPriBとの相互作用解析を行い、PriBにおいてDnaT結合部位に存在する幾つかのアミノ酸の相互作用における重要性を変異体解析およびNMR解析によって調べた。その結果から複製再開始における一本鎖DNAがPriBに結合し、複合体を形成した後、DnaTによってPriB-一本鎖DNAの複合体から一本鎖DNAが解離するモデルの構築を行った。その結果は、現在論文として投稿準備中である。また、DnaTのN末ドメインの機能であるオリゴマー形成を調べる為、幾つかの変異体を作成し、オリゴマー形成に重要な部位を同定した。この情報を利用し、未だ判明していないDnaTN末の立体構造決定に向けて、現在検討を行っている。これらの結果に関しては2件の国際学会を含め、6件の学会発表を行った。
Escherichia coli におけるDNA replication restart mechanism の一つであるPriA-dependent replication restart は, plural のタンパクThe regular binding and dissociation of plasmids (PriA, PriB, DnaT) and multi-stage reaction on DNA.そのため, each stage of でこるタンパク性-DNA, あるいはタンパク性-タンパク性性的interaction Use をUnderstand し, それらを行ぎ合わせることで, Copy and restart の全能を Explain 明することが出 るとtest えた. In this application, it is necessary to reintroduce the DnaB-DnaC complex due to the quality of the material and the replication device. Analysis of the structure and function of DnaT, and analysis of the DNA replication restart mechanism. This year は、DnaTとreplication restart factorの一つであるPriBとのinteraction analysisを行い、PriBにおいてDnaT The presence of the binding site, the interaction of the acid, the importance of the interaction, the allogeneic analysis, the NMR analysis, and the adjustment.そのRESULT からReplication Restarts における1 lock DNAがPriBにCombining し、Complex をAfter formation した、DNA TによってPriB-a lock DNA complex から a lock DNA が dissociation するモデルのconstruct を行った. As a result, the paper is now being prepared for submission.また、DnaTのドメインのfunctional であるオリゴマーform を Adjustmentべる, several different body parts are made, and the important part of the オリゴマーformation is the same as the original one. The information is used, the unidentified information is determined, and the three-dimensional structure of DnaTN at the end is decided, and the current decision is made.これらのRESULTS

项目成果

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科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Analysis of DnaT oligomeric structure in Escherichia coli replication restart primosome
大肠杆菌复制重启引发体中 DnaT 寡聚结构分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    池田陽平;藤山紗希;阿部 義人;片山 勉;植田 正
  • 通讯作者:
    植田 正
NMR Analysis of an Interaction between PriB and DnaT on Bacterial Replication Restart Primosome
核磁共振分析 PriB 和 DnaT 对细菌复制重启Primosome 的相互作用
  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    藤山 紗希;阿部 義人;片山 勉;植田 正
  • 通讯作者:
    植田 正
大腸菌 DNA 複製再開始因子 DnaT の多量体構造解析
大肠杆菌DNA复制重新启动因子DnaT多聚体结构分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    池田 陽平;藤山紗希;阿部 義人;片山 勉;植田 正
  • 通讯作者:
    植田 正
大腸菌DNA複製再開始タンパク質PriB・DnaTの構造を基盤とした相互作用解析
大肠杆菌 DNA 复制重新启动蛋白 PriB 和 DnaT 的基于结构的相互作用分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    藤山 紗希;阿部 義人;片山 勉;植田 正
  • 通讯作者:
    植田 正
大腸菌 DNA 複製再開始因子 DnaT の構造と機能
大肠杆菌 DNA 复制重新启动因子 DnaT 的结构和功能
  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    阿部 義人;藤山 紗希;池田 陽平;片山 勉;植田 正
  • 通讯作者:
    植田 正
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  • 通讯作者:
    長谷川和範

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