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抗菌ペプチド天然物ライソシンを基盤とした構造機能相関研究

基于抗菌肽天然产物溶菌素的结构与功能关系研究

基本信息

批准号：
16J08733
负责人：
加治拓哉
金额：
$ 1.22万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2016
资助国家：
日本
起止时间：
2016-04-22 至 2018-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

４月中は研究計画に従い、ライソシン類の構造活性相関研究に取り組んだ。前年度、これまで構造活性相関研究を行なっていなかった４箇所のアミノ酸（３残基目のセリン、６残基目のロイシン、９残基目のグルタミン、１１残基目のイソロイシン）の側鎖構造をランダム化したOBOCライブラリを作成し、アッセイを行った。その結果、天然物の配列を含む２６個のペプチド配列を高いメナキノンへの親和性と抗菌活性を有するライソシン類縁体の候補として見出していた。得られた候補配列の内、１３個の配列からなる新規ライソシン類縁体についてさらなる機能評価、解析を行うためにスケールアップ合成を実施した。合成した類縁体を抗菌活性評価に供した結果、天然物と同等の抗菌活性を有するものが含まれることを明らかにした。５月からは計画を変更し、学振PDの海外渡航制度により、環状ペプチド類の溶液構造解析や配座固定効果に関する知識・経験の習得を目的として、トロント大学化学科のYudin研にて環状ペプチドの構造機能相関研究に従事した。Yudin研では最近、N-(isocyanimino)-triphenylphospharane (Pinc)試薬を用いることで直鎖ペプチドを液相１工程にてオキサジアゾール/アミン構造を形成しながら環化することが出来ることを報告している。この反応で導入されるリンカー構造が、脂溶性の向上や分子内水素結合安定化による配座固定効果など、単純な環状ペプチド化合物に対し有用な特性を有することが示唆された。そこで、本リンカー構造による配座効果のさらなる検証を行なった。新たに合成した環状ペプチド類はいずれもβターン構造を主要な溶液構造として取ることが温度可変NMR測定や分子動力学計算などから示唆され、また、導入されたアミン部位が分子内水素結合に関与していることを明らかにした。

In mid-April, the activity of the research project was compared with that of the research project. In the previous year, we did a study on the bioactivity of OBOC. In the previous year, we did a study on the production of acid (3, 6, 9, and 11) in the first year. According to the results of the experiment, there were 26 samples of natural products, including 26 samples of high-level bacteria, and the antibacterial activity of natural products was similar to that of mice. In the waiting list, 13 of them are assigned to the list of new rules and regulations, and the performance of the system is analyzed. The synthetic antifungal activity test results show that the natural substance has the same antibacterial activity. In May, the PD overseas Voyage system Program was conducted, the overseas Voyage system was designed and analyzed, and the fixed seating system was analyzed. The objective knowledge was obtained, and the environmental environmental equipment machine of the Department of Chemistry of the University of Taiwan was able to study the relationship between each other. Recently, Yudin research and development, N-(isocyanimino)-triphenylphospharane (Pinc) system, has been used to improve the performance of the liquid phase 1 project. The chemical reaction is sensitive to the production, fat-soluble upward extraction of intramolecular water, and the combination of stabilized liquids, seating fixtures, and environmental compounds. There is an indication of the useful properties of the compounds. This is the best way to make a seat match. The temperature of the main solution can be determined by NMR. The temperature of molecular dynamics calculation indicates that the combination of water in the molecule and the temperature in the part of the complex are sensitive.