淡水性ハゼ科魚類における平行的な卵サイズ大型化の遺伝的基盤

日本の南西諸島に分布するクローキバラヨシノボリ種群では，島ごとに何度もクロヨシノボリ（以下，回遊性種）からキバラヨシノボリ（以下，淡水性種）への種分化が起きたことが明らかとなってきた．淡水性種では卵サイズが回遊性種に比べて大型化しており，適応進化の結果であると考えられている．本研究では，ヨシノボリ属の淡水進出に伴う多様化機構の一端を解明するために，淡水進出において重要な形質である卵サイズ変異に特に着目した，淡水進出の進化遺伝的機構の解明を目的としている．1.ドラフトゲノム解読：ゲノム解析の基盤構築を目的として，ドラフトゲノムの解読を試みた．昨年度に得られた，10Xgenomics社の技術を用いて作成されたDNAライブラリをillumina社のHiSeqXでシーケンスしたデータをアセンブルした．その結果，比較的長く繋がった良好なドラフトゲノムデータを取得でき，また重要な遺伝領域は十分に読まれていることが示唆された．連鎖地図上にスキャッフォールドを紐づけた結果，非常に長く繋がった配列が得られ，十分に解析の土台として機能しうるドラフトゲノムを得ることができた．2. リシーケンスによるデモグラフィ解析と淡水化関連領域の探索の試み：交雑を含むヨシノボリ種群の進化史の解明と，種群間で共通して淡水適応に利用されたゲノム領域を探索するために，それぞれ独立に淡水化がおきた２種群を含むヨシノボリ属7種についてゲノムのリシーケンスを行った．現在解析が進行中である．3. 野外生態調査による卵巣発達過程の観察：淡水性種と回遊性種の生活環において，卵がどのように発達することで卵サイズ差が生まれるのかを明らかにするため，沖縄県西表島での定期的なサンプリングを行った．2016年7月から1.5ヶ月おきに，2017年の6月まで調査を行い，通年での卵巣サイズの変化を観察できるサンプルを取得することができた．

日本の南西諸島に分布するクローキバラヨシノボリ種群では，島ごとに何度もクロヨシノボリ（以下，回遊性種）からキバラヨシノボリ（以下，淡水性種）への種分化が起きたことが明らかとなってきた．淡水性種では卵サイズが回遊性種に比べて大型化しており，適応進化の結果であると考えられている．本研究では，ヨシノボリ属の淡水進出に伴う多様化機構の一端を解明するために，淡水進出において重要な形質である卵サイズ変異に特に着目した，淡水進出の進化遺伝的機構の解明を目的としている．1.ドラフトゲノム解読：ゲノム解析の基盤構築を目的として，ドラフトゲノムの解読を試みた．昨年度に得られた，10Xgenomics社の技術を用いて作成されたDNAライブラリをillumina社のHiSeqXでシーケンスしたデータをアセンブルした．その結果，比較的長く繋がった良好なドラフトゲノムデータを取得でき，また重要な遺伝領域は十分に読まれていることが示唆された．連鎖地図上にスキャッフォールドを紐づけた結果，非常に長く繋がった配列が得られ，十分に解析の土台として機能しうるドラフトゲノムを得ることができた．2. リシーケンスによるデモグラフィ解析と淡水化関連領域の探索の試み：交雑を含むヨシノボリ種群の進化史の解明と，種群間で共通して淡水適応に利用されたゲノム領域を探索するために，それぞれ独立に淡水化がおきた２種群を含むヨシノボリ属7種についてゲノムのリシーケンスを行った．現在解析が進行中である．3. 野外生態調査による卵巣発達過程の観察：淡水性種と回遊性種の生活環において，卵がどのように発達することで卵サイズ差が生まれるのかを明らかにするため，沖縄県西表島での定期的なサンプリングを行った．2016年7月から1.5ヶ月おきに，2017年の6月まで調査を行い，通年での卵巣サイズの変化を観察できるサンプルを取得することができた．