Tropical diseases-related protein-protein interaction analysis by using exhaustive docking

使用穷举对接进行热带疾病相关蛋白质-蛋白质相互作用分析

• 批准号: 16K00388
• 负责人: Matsuzaki Yuri
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: Tokyo Institute of Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2016
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2016-04-01 至 2019-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16K00388/
• 关键词: タンパク質間相互作用; タンパク質ドッキング; タンパク質間相互作用ネットワーク; 並列計算

项目成果

Protein-protein interaction network prediction by using rigid-body docking.

使用刚体对接预测蛋白质-蛋白质相互作用网络。

• 发表时间: 2016
• 作者: Yuri Matsuzaki;Nobuyuki Uchikoga;Jaak Simm
• 通讯作者: Jaak Simm

Interaction surfaces of proteins involved in bacterial chemotaxis with rigid-body docking decoys.

参与细菌趋化性的蛋白质与刚体对接诱饵的相互作用表面。

• 发表时间: 2017
• 作者: Nobuyuki Uchikoga;Yuri Matsuzaki;Masahito Ohue;Yutaka Akiyama
• 通讯作者: Yutaka Akiyama

Protein interaction surfaces of protein-protein interaction networks in bacterial chemotaxis networks using profile methods.

使用剖面方法观察细菌趋化网络中蛋白质-蛋白质相互作用网络的蛋白质相互作用表面。

• 发表时间: 2017
• 作者: Nobuyuki Uchikoga;Yuri Matsuzaki;Masahito Ohue;Yutaka Akiyama
• 通讯作者: Yutaka Akiyama

Rigid-Docking Approaches to Explore Protein-Protein Interaction Space

• DOI: 10.1007/10_2016_41
• 发表时间: 2017-01-01
• 期刊: NETWORK BIOLOGY
• 作者: Matsuzaki, Yuri;Uchikoga, Nobuyuki;Akiyama, Yutaka
• 通讯作者: Akiyama, Yutaka

Analysis of Protein interaction surfaces using a profile method with rigid-body docking decoys.

使用轮廓法和刚体对接诱饵分析蛋白质相互作用表面。

• 发表时间: 2017
• 作者: Nobuyuki Uchikoga;Yuri Matsuzaki;Masahito Ohue;Yutaka Akiyama
• 通讯作者: Yutaka Akiyama