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共生性渦鞭毛藻類　Ａｍｐｈｉｄｉｎｉｕｍｓｐ．　のゲノムおよび毒素生合成

共生甲藻 Amphidiniumsp.

基本信息

批准号：
17J00597
负责人：
BEEDESSEE Girish
金额：
$ 1.79万
依托单位：
Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2017
资助国家：
日本
起止时间：
2017-04-26 至 2020-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

We completed the genome of Amphidinium gibbosum and using an integrated omics approach, we surveyed the mechanisms of secondary metabolite biosynthesis. We combined genomics, transcriptomics and microRNAomics using sequencing data from Illumina and Pacbio.We identified key enzymes needed to make secondary metabolites.We also found that under nutrient conditions ( nitrate), secondary metabolites biosynthesis is downregulated because of the probably role of a miRNA.Such information is helpful in helping understand harmful algal bloom formation.We also identified several molecular events such as alternative splicing in secondary metabolite genes, that affect their expression.Taken together, we propose 2 strategies for the synthesis of secondary metabolites in dinoflagellates that include iterative use of enzymes.

我们完成了前沟藻的基因组测序，并利用整合的组学方法研究了前沟藻次生代谢产物的生物合成机制。我们使用Illumina和Pacbio的测序数据，将基因组学、转录组学和microRNAomics结合起来。我们确定了产生次级代谢产物所需的关键酶。我们还发现，在营养条件下，（硝酸盐），次级代谢物的生物合成下调，因为可能的作用的miRNA。这些信息有助于帮助理解有害藻华的形成。我们还确定了几个分子事件，如选择性剪接，次级代谢物基因，影响其表达。综上所述，我们提出了2种策略，用于甲藻次级代谢物的合成，包括反复使用酶。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Genomic insights on secondary metabolism in symbiotic dinoflagellates

共生甲藻次生代谢的基因组见解

DOI：
发表时间：
2019
期刊：
影响因子：
0
作者：
Beedessee Girish;Hisata Kanako;Roy Michael C.;Van Dolah Frances M.;Satoh Noriyuki;Shoguchi Eiichi;Girish Beedessee
通讯作者：
Girish Beedessee

Transcriptomic analysis reveals expression of multifunctional secondary metabolite biosynthesis gene clusters in dinoflagellates.

转录组分析揭示了甲藻中多功能次级代谢物生物合成基因簇的表达。