ゲノム・エピゲノム新規統合解析によるナルコレプシー遺伝要因の探索と発症機序の検討
ゲノム・エピゲノム新規統合解析によるナルコレプシー遺伝要因の探索と発症機序の検討
批准号:
17J01616
负责人:
杉本(嶋多) 美穂子
金额:
$2.83万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2017
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2017-04-26 至 2020-03-31
中文摘要
本研究課題では、多数の層のオミックスデータを取得し、それらを統合的に解析することで、オッズは小さくとも真にナルコレプシーに関連する要因を同定することを目的としていた。前年度までに血液、脳のサンプルを用いた網羅的なDNAメチル化解析を実施し、各々の解析において候補遺伝子を同定していた。今年度は、それらの結果を比較することで、脳組織や血液細胞特異的な遺伝要因、並びに両組織において共通して関連を示す要因について検討を行った。その結果複数の脂肪酸代謝に関わる遺伝子領域のメチル化が、両組織において共に関連を示すという結果が得られ、ナルコレプシーにおける脂肪酸代謝の重要性が示唆された。そこで今年度はさらに患者・対照群の脳脊髄液を用いた網羅的なメタボローム解析を実施した。その結果、ヒスチジンがナルコレプシーと最も強い関連を示し(P = 4.0 ×10-4)、その他22の代謝物質が有意な関連を示した。それらの代謝物質を用いたパスウェイ解析の結果、糖原性アミノ酸の代謝に関わるパスウェイが検出され、ナルコレプシーにおいて脂肪酸代謝が障害されていることに対する代償的な変化である可能性が示唆された。また今年度はCD4+T細胞とCD8+T細胞における網羅的なメチル化解析も実施した。その結果、全血から抽出したDNAを用いてすでに実施していたメチル化解析の結果と同様に、患者群における全体的な低メチル化傾向が見られた。また、CD8+T細胞においては、CCR5やCCL5といったケモカイン関連遺伝子領域上流のメチル化の関連が同定された。以上の結果から、エピゲノムの観点からも免疫系ならびに代謝系の異常が発症機序に関与することが支持されたと共に、メチル化が全体的に低くなることも疾患の発症に寄与している可能性が示唆された。
英文摘要
本研究課題では、多数の層のオミックスデータを取得し、それらを統合的に解析することで、オッズは小さくとも真にナルコレプシーに関連する要因を同定することを目的としていた。前年度までに血液、脳のサンプルを用いた網羅的なDNAメチル化解析を実施し、各々の解析において候補遺伝子を同定していた。今年度は、それらの結果を比較することで、脳組織や血液細胞特異的な遺伝要因、並びに両組織において共通して関連を示す要因について検討を行った。その結果複数の脂肪酸代謝に関わる遺伝子領域のメチル化が、両組織において共に関連を示すという結果が得られ、ナルコレプシーにおける脂肪酸代謝の重要性が示唆された。そこで今年度はさらに患者・対照群の脳脊髄液を用いた網羅的なメタボローム解析を実施した。その結果、ヒスチジンがナルコレプシーと最も強い関連を示し(P = 4.0 ×10-4)、その他22の代謝物質が有意な関連を示した。それらの代謝物質を用いたパスウェイ解析の結果、糖原性アミノ酸の代謝に関わるパスウェイが検出され、ナルコレプシーにおいて脂肪酸代謝が障害されていることに対する代償的な変化である可能性が示唆された。また今年度はCD4+T細胞とCD8+T細胞における網羅的なメチル化解析も実施した。その結果、全血から抽出したDNAを用いてすでに実施していたメチル化解析の結果と同様に、患者群における全体的な低メチル化傾向が見られた。また、CD8+T細胞においては、CCR5やCCL5といったケモカイン関連遺伝子領域上流のメチル化の関連が同定された。以上の結果から、エピゲノムの観点からも免疫系ならびに代謝系の異常が発症機序に関与することが支持されたと共に、メチル化が全体的に低くなることも疾患の発症に寄与している可能性が示唆された。
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Metabolomic analysis of cerebrospinal fluid in narcolepsy
发作性睡病脑脊液的代谢组学分析
DOI:
--
发表时间:
2019
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Mihoko Shimada, Taku Miyagawa, Katsushi Tokunaga, Makoto Honda]
通讯作者:
Makoto Honda
ナルコレプシーのDNAメチル化解析
发作性睡病的 DNA 甲基化分析
DOI:
--
发表时间:
2018
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Shimada, Taku Miyagawa, Hiromi Toyoda, Katsushi Tokunaga, Makoto Honda, 嶋多美穂子]
通讯作者:
嶋多美穂子
EWAS of narcolepsy-affected brain and overlapping methylation profile between narcolepsy and neurological disorders
发作性睡病影响的大脑的 EWAS 以及发作性睡病和神经系统疾病之间重叠的甲基化谱
DOI:
--
发表时间:
2018
期刊:
影响因子:
--
作者:
[嶋多美穂子, 宮川卓, 徳永勝士, 本多真]
通讯作者:
本多真
An epigenome-wide DNA methylation analysis of narcolepsy and integrative analysis with GWAS data
发作性睡病的全表观基因组 DNA 甲基化分析以及与 GWAS 数据的综合分析
DOI:
--
发表时间:
2017
期刊:
影响因子:
--
作者:
[嶋多美穂子, 宮川卓, 豊田裕美, 徳永勝士, 本多真]
通讯作者:
本多真
DNA methylation profile of narcolepsy-affected brain and overlapping methylation profile between narcolepsy and multiple sclerosis
发作性睡病患者大脑的 DNA 甲基化谱以及发作性睡病和多发性硬化症之间重叠的甲基化谱
DOI:
--
发表时间:
2019
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Mihoko Shimada, Taku Miyagawa, Katsushi Tokunaga, Makoto Honda]
通讯作者:
Makoto Honda
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