Development of detection schemes for endangered and invasive animals based on pan-animalia enviromental DNA analysis

基于泛动物环境DNA分析制定濒危和入侵动物检测方案

• 批准号: 17K19298
• 负责人: SATO Yukuto
• 金额: $ 4.16万
• 依托单位: University of the Ryukyus
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• 财政年份: 2017
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2017-06-30 至 2019-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-17K19298/
• 关键词: 環境DNA; 大量DNA分析; 次世代シークエンサー; バイオインフォマティクス; 希少種; 外来種; メタバーコーディング; 遺伝的多様性; 生態調査

项目成果

Development of environmental DNA (eDNA) analysis platform in the University of the Ryukyus

琉球大学开发环境DNA（eDNA）分析平台

• 发表时间: 2017
• 作者: Yukuto Sato;Kaori Tsurui-Sato;Shingo Fujimoto
• 通讯作者: Shingo Fujimoto

IIBMP2018 生命情報科学若手の会 ハイライトトラック: MitoFish and MiFish pipeline: a mitochondrial genome database of fish with an analysis pipeline for environmental DNA metabarcoding.

IIBMP2018 青年生物信息学学会亮点专题：MitoFish 和 MiFish 管道：鱼类线粒体基因组数据库，具有环境 DNA 元条形码分析管道。

• 发表时间: 2018
• 作者: Yukuto Sato;Masaki Miya;Tsukasa Fukunaga;Tetsuya Sado;Wataru Iwasaki
• 通讯作者: Wataru Iwasaki

Environmental DNA metabarcoding to detect pathogenic Leptospira and associated organisms in leptospirosis-endemic areas of Japan

• DOI: 10.1038/s41598-019-42978-1
• 发表时间: 2019-04-25
• 期刊: SCIENTIFIC REPORTS
• 影响因子: 4.6
• 作者: Sato, Yukuto;Mizuyama, Masaru;Toma, Claudia
• 通讯作者: Toma, Claudia

Environmental DNA enables detection of terrestrial mammals from forest pond water

• DOI: 10.1111/1755-0998.12690
• 发表时间: 2017-11-01
• 期刊: MOLECULAR ECOLOGY RESOURCES
• 影响因子: 7.7
• 作者: Ushio, Masayuki;Fukuda, Hisato;Miya, Masaki
• 通讯作者: Miya, Masaki

Preliminary study on eDNA of the coelacanth's habitat around deep sea conservation areas of North Sulawesi, Indonesia

印度尼西亚北苏拉威西深海保护区周围腔棘鱼栖息地eDNA初步研究

• 发表时间: 2018
• 作者: Kawilarang W.A. Masengi;I.F. Mandagi;H. Manengkey;P.N.I. Kalangi;A. Luasunaung;F.P.T. Pangalila;M. Iwata;Y. Abe;Y. Sato;R. Kimura;K. Yamahira
• 通讯作者: K. Yamahira