Elucidation of evolution of liver architecture in vertebrates by comparative genomics and morphological analysis
Elucidation of evolution of liver architecture in vertebrates by comparative genomics and morphological analysis
批准号:
18J21880
负责人:
太田 考陽
金额:
$1.41万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2018
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2018-04-25 至 2021-03-31
中文摘要
本年度も引き続き、脊椎動物種々の肝臓構造の比較、その違いを生み出す分子進化の研究を行い、その成果を学会等で発表し学術論文の執筆を行った。比較ゲノム解析により、進化的保存された転写調節領域(ECR)の候補を同定したが、肝臓進化には直接関わらない領域であると予想され、予定していたゲノム編集を用いたECR領域の機能解析は断念した。その一方で、jag1の分子進化・ゲノム進化に関しては引き続き解析を進めた。その結果、真骨魚類特異的なJag1重複遺伝子間では、様々な観点で保存傾向と革新傾向を示すことが明らかとなり、この傾向は重複直後の決定ではなく、各系統群間の進化の中で別々にその傾向が決定していることが明らかとなった。これらのバリエーションの違いが真骨魚類の多様性を引き起こしている可能性があり、これらに関して論文の執筆を行っている。また、本年度は、肝臓の起源・進化に迫るため、原始的な肝臓の探索を目標に行った。哺乳類から系統的に離れている円口類ヌタウナギとスナヤツメ、軟骨魚類イヌザメの肝臓が、形態学的・遺伝子発現的に哺乳類の肝臓と類似しているのかin situ hybridization法を用いて調べた。その結果、円口類の肝臓でも、肝機能を担う“肝細胞”と、胆汁を運ぶ胆管を構成する“胆管上皮細胞”は、哺乳類同様の遺伝子発現差で区別することができた。このことから、形態学的でも分子レベルでも顎口類と円口類の肝臓は類似していると明らかにし、脊椎動物は同一起源の肝臓を保持していると予想された。また、イヌザメの胚を使用した発生の比較解析では、軟骨魚類は哺乳類の肝発生様式と非常に類似した発生様式を有することが明らかとなった。このことから、軟骨魚類と哺乳類の肝発生システムは同一起源である可能性が高く、少なくとも顎口類誕生前後には哺乳類での肝発生システムと同様のシステムが確立していたことが予想された。
英文摘要
本年度も引き続き、脊椎動物種々の肝臓構造の比較、その違いを生み出す分子進化の研究を行い、その成果を学会等で発表し学術論文の執筆を行った。比較ゲノム解析により、進化的保存された転写調節領域(ECR)の候補を同定したが、肝臓進化には直接関わらない領域であると予想され、予定していたゲノム編集を用いたECR領域の機能解析は断念した。その一方で、jag1の分子進化・ゲノム進化に関しては引き続き解析を進めた。その結果、真骨魚類特異的なJag1重複遺伝子間では、様々な観点で保存傾向と革新傾向を示すことが明らかとなり、この傾向は重複直後の決定ではなく、各系統群間の進化の中で別々にその傾向が決定していることが明らかとなった。これらのバリエーションの違いが真骨魚類の多様性を引き起こしている可能性があり、これらに関して論文の執筆を行っている。また、本年度は、肝臓の起源・進化に迫るため、原始的な肝臓の探索を目標に行った。哺乳類から系統的に離れている円口類ヌタウナギとスナヤツメ、軟骨魚類イヌザメの肝臓が、形態学的・遺伝子発現的に哺乳類の肝臓と類似しているのかin situ hybridization法を用いて調べた。その結果、円口類の肝臓でも、肝機能を担う“肝細胞”と、胆汁を運ぶ胆管を構成する“胆管上皮細胞”は、哺乳類同様の遺伝子発現差で区別することができた。このことから、形態学的でも分子レベルでも顎口類と円口類の肝臓は類似していると明らかにし、脊椎動物は同一起源の肝臓を保持していると予想された。また、イヌザメの胚を使用した発生の比較解析では、軟骨魚類は哺乳類の肝発生様式と非常に類似した発生様式を有することが明らかとなった。このことから、軟骨魚類と哺乳類の肝発生システムは同一起源である可能性が高く、少なくとも顎口類誕生前後には哺乳類での肝発生システムと同様のシステムが確立していたことが予想された。
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DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
肝臓の形態進化から脊椎動物の進化を紐解きたい
我想从肝脏的形态进化来了解脊椎动物的进化。
DOI:
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发表时间:
2019
期刊:
日本進化学会ニュース
影响因子:
--
作者:
[Ota N, Hirose H, Kato H, Maeda H, Shiojiri N, 太田考陽]
通讯作者:
太田考陽
Evolution of liver architectures having the portal triad in vertebrates
脊椎动物门静脉三联体肝脏结构的进化
DOI:
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发表时间:
2019
期刊:
影响因子:
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作者:
[Noriaki Ota, Nobuyoshi Shiojiri]
通讯作者:
Nobuyoshi Shiojiri
肝臓形成遺伝子の分子進化と円口類の肝臓における発現パターン
圆形茎肝脏中肝源基因的分子进化和表达模式
DOI:
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发表时间:
2020
期刊:
影响因子:
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作者:
[太田考陽, 加藤英明, 山崎裕治, 池尾一穂, 塩尻信義]
通讯作者:
塩尻信義
脊椎動物における肝臓構築の進化発生学的解析と胆管誘導因子Jag1の比較ゲノム解析
脊椎动物肝脏结构的进化胚胎学分析和胆管诱导因子 Jag1 的比较基因组分析
DOI:
--
发表时间:
2018
期刊:
影响因子:
--
作者:
[太田考陽, 池尾一穂, 塩尻信義]
通讯作者:
塩尻信義
共 17 条
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基于全基因组和重测序的藤茶起源与进化机制研究
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批准号:JCZRLH202601865
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项目类别:省市级项目
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批准年份:2026
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负责人:
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依托单位:
二硫化钼潮湿环境下润滑性能失效起源和环境适应性改性理论研究
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批准号:QN25E050048
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:郝宇
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依托单位:
基于蛋白质三维结构解析ASGARD古菌与
真核生物的起源过程
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:10.0万元
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批准年份:2025
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负责人:冯晓远
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依托单位:
人工智能软件精准定位流出道起源特发性室性心律失常的应用研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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批准年份:2025
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负责人:傅国华
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依托单位:
黑洞吸积模式对活动星系核射电起源的影响
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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批准年份:2024
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负责人:王倚君
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依托单位:
日冕物质抛射起源的低层大气特征研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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批准年份:2024
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负责人:邢晨
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依托单位:
基于LAMOST巡天数据研究逃逸0B星的化学组成和起源
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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批准年份:2024
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负责人:
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依托单位:
小鼠B-1淋巴细胞的胚胎起源研究
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项目类别:青年科学基金项目
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批准年份:2024
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负责人:宁小伟
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依托单位:
长江中游地区澧阳平原稻作农业起源和早期发展过程
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批准号:
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项目类别:面上项目
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资助金额:50万元
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批准年份:2024
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负责人:郇秀佳
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依托单位:
利用脉冲星周期跃变研究银河系内快速射电
暴的物理起源
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批准号:Q24A030004
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项目类别:省市级项目
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批准年份:2024
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负责人:汪卫华
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依托单位: