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熱スパイクによって誘起される分子運動およびその生物作用の解明

熱スパイクによって誘起される分子運動およびその生物作用の解明
阐明热尖峰引起的分子运动及其生物效应
批准号:
21K18148
负责人:
鹿園 直哉
金额:
$16.39万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2021-07-09 至 2026-03-31

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项目成果

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量子ビームによって付与されるエネルギーの大半は熱に変換され局所的な高温状態(熱スパイク)が生じる。熱スパイクは生物作用に関与しないと一般的に考えられているが、これまでの研究対象は主にタンパク質等であり、生物作用を左右する可能性についての検討は十分とはいない。本研究では、近年向上が目覚ましい各種解析技術を組み合わせ、量子ビームによって誘起される熱スパイクに由来する圧力波がDNAに作用し、生物作用を左右する可能性を明らかにすることを目指して研究を進める。本年度は、水分子の温度上昇による密度変化を測定するための超音波エコー測定装置による実験を進め、鉄イオンビーム照射後の水槽中の水の変化を観測した。昨年度までは測定におけるバックグラウンドが高かったが、超音波吸収シートを水槽内に設置することで、大幅な改善を得た。鉄イオンビーム強度およびビーム径と超音波エコーシグナルの関係を明らかにすることを目的に実験を行った結果、ビーム強度が増すにつれて超音波エコーシグナルの輝度が明るくなることを見出した。また、ビーム強度を一定にしてビーム径を変化させたときは、ビーム径を小さくするにつれ超音波エコーシグナルの輝度が明るくなった。このことは熱スパイク間の距離により水分子の挙動が影響を受ける可能性を示す一方、超音波エコーによる量子ビーム照射のリアルタイム検出に対して重要な示唆を与える。一方本年度は、水に照射された量子ビームのエネルギー付与による軌道付近の水分子の挙動を調べる分子動力学計算を可能とする計算コードを開発した。本計算コードにより、瞬間的に大きなエネルギーが局所的に付与されると、付近の水分子は押し出され、極短時間だが空洞が生じることが示された。
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会议论文
重イオンビーム照射による散逸構造,自己組織化形成の可能性
通过重离子束照射形成耗散结构和自组织的可能性
DOI: --
发表时间: 2021
期刊:
影响因子: --
作者: [三原基嗣, 松多健策, 福田光順, 若林諒, 沖本直哉, 福留美樹, 泉川卓司, 野口法秀, 生越瑞揮, 大坪隆, 西村太樹, 高橋弘幸, 菅原奏来, Aleksey Gladkov, 北川敦志, 佐藤眞二, 奥 隆之, 森林 健悟]
通讯作者: 森林 健悟
脱塩基部位からなるクラスターDNA損傷の分子動力学シミュレーション
由脱碱基位点组成的簇状 DNA 损伤的分子动力学模拟
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [寺川 和志, 藤原 進, 水口 朋子, 米谷 佳晃, 鹿園 直哉, 赤松 憲, 中村 浩章]
通讯作者: 中村 浩章
放射線照射したプラスミドDNAに生じたクラスター損傷のFRET分析―乾燥及び細胞模擬条件下での比較
FRET 分析辐照质粒 DNA 中引起的簇损伤 - 干燥条件和细胞模拟条件下的比较
DOI: --
发表时间: 2021
期刊:
影响因子: --
作者: [赤松憲, 鹿園直哉]
通讯作者: 鹿園直哉
Molecular Dynamics Study on Cluster Damaged DNA Containing Apurinic/Apyrimidinic Sites on the Same Strand
同链上含有脱嘌呤/脱嘧啶位点的簇状损伤DNA的分子动力学研究
DOI: --
发表时间: 2023
期刊:
影响因子: --
作者: [Terakawa Kazushi, Fujiwara Susumu, Mizuguchi Tomoko, Yonetani Yoshiteru, Shikazono Naoya, Akamatsu Ken, Nakamura Hiroaki]
通讯作者: Nakamura Hiroaki
修復困難な一本鎖切断の新規耐性機構及びゲノム変異生成に関する研究