Novel Platform for Bioorganism Identification Optimised for Archaeological Research

针对考古研究优化的生物有机体鉴定新平台

• 批准号: 21K18382
• 负责人: 押鐘 浩之
• 金额: $ 4.08万
• 依托单位: Osaka University (2022)Teikyo University (2021)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-07-09 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21K18382/
• 关键词: DNA考古学; 土壌DNA; 考古学目的に最適化したDNA定量法

本研究は考古学研究領域における生物種同定法に対する、分子生物学的手法の応用を通した新規メソドロジーの構築に関する。PCR法はピコグラムオーダーのDNAでも増感できることから考古学研究において非常に有用な手法であるものの、考古資料中に普遍的に含まれるフミン酸等はPCRを阻害し得るため、当該年度においてはフミン酸を精製によって除去する、または多少のフミン酸を含んでもPCRを可能にする条件検討を中心に実施した。さらにPCRの阻害要因として、一種のDNAの経年変化であるシトシン（dC）のウラシル化（dU）といった考古資料に特徴的な問題も見出されたことから、このウラシル化問題も解決し得る方法論に対する試行錯誤も実施した。当該年度において、これらPCR阻害要因を除去する方法論の構築を実施し、（１）遺跡土壌からの直接的な核酸定量法、および（２）実際の文化財資料（浮世絵）製作に用いられた膠の動物種同定について研究成果をまとめ、それぞれ専門誌にて研究成果を発表できた。

This study is related to the identification of biological species in the field of archaeology and the application of molecular biology techniques to the construction of new technologies. PCR is a very useful method for archaeological research. It is commonly used in archaeological data. It is difficult for PCR to be detected. When the acid is refined, it is removed. How much acid is contained in PCR is possible. The main reason for PCR inhibition is that a problem of DNA sequencing (dC) and DNA sequencing (dU) and archaeological data characterization has been identified and solved. During the year, the methodological construction for removing the main factors of PCR inhibition was carried out,(1) direct nucleic acid quantitative method for trace DNA detection, and (2) actual cultural property data (floating world) production, animal species identification, and research results were reported.

项目成果

生体分子が有する情報の効率的な抽出法の検討

生物分子所拥有信息的有效提取方法的检验

• 发表时间: 2022
• 作者: 上田たかね;押鐘浩之
• 通讯作者: 押鐘浩之

考古学ジャーナル2022年7月号

考古学杂志 2022 年 7 月号

• 发表时间: 2022
• 作者: 上田たかね;押鐘浩之;押鐘 浩之
• 通讯作者: 押鐘 浩之

Animal species identification utilising DNAs extracted from traditionally manufactured gelatin (Wanikawa)

• DOI: 10.1186/s40494-022-00798-z
• 发表时间: 2022-11-11
• 期刊: HERITAGE SCIENCE
• 影响因子: 2.5
• 作者: Kuramata，Haruki;Hashiba，Miho;Oshikane，Hiroyuki
• 通讯作者: Oshikane，Hiroyuki

DNA考古学へのマイルストーン

DNA考古学的里程碑

• 发表时间: 2022
• 作者: 押鐘浩之;橋場美穂;上田たかね;藤澤明;植月学;山内和也
• 通讯作者: 山内和也

Novel and Rapid on site Nucleic Acid Quantification Platform Customised for Archaeological Science

专为考古科学定制的新型快速现场核酸定量平台

• 发表时间: 2022
• 期刊: Annals of Biomedical Research
• 作者: Hiroyuki Oshikane;Miho Hashiba;Takane Kikuchi-Ueda;Yuriko Kai;Tsuyoshi Inoue;Kei Asayama;Ryuichi Fujisaki;Koichi Makimura;Manabu Uetsuki;Akira Fujisawa;Kazuya Yamauchi
• 通讯作者: Kazuya Yamauchi