Cellular responses to DNA double-strand breaks caused by transcription stress
Cellular responses to DNA double-strand breaks caused by transcription stress
批准号:
21K12245
负责人:
逆井 良
金额:
$2.66万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31
中文摘要
カンプトテシン(CPT)はDNAトポイソメラーゼI(Top1)の阻害剤であり、Top1がDNAに共有結合したTop1-DNA cleavage complex(Top1cc)を蓄積させる。Top1ccは転写を強く抑制してストレス応答を引き起こすが、その際に転写と関連したDNA二本鎖切断(transcription-coupled DSB:tc-DSB)を生じることが分かっている。しかし、tc-DSBの発生および修復機序は不明である。我々はDNAヘリカーゼであるRecQL5がtc-DSBの発生を抑制することを見出しており、RecQL5に注目した解析から、tc-DSBの生成及び修復機構を解明することが本研究の目的である。tc-DSBは神経細胞のような増殖していない静止期の細胞でも生じるDNA損傷であり、本研究の成果は神経疾患の病態解明につながることも期待される。これまでに、転写共役ヌクレオチド除去修復(TC-NER)およびRecQL5がtc-DSB生成に関わることを見出しており、DNAヘリカーゼで解かれるようなDNAの二次構造が発生し、その構造がtc-DSBの生成に関わると考えられる。TC-NERに関しては、CSBおよびCSAのノックアウト細胞を作成し、その関与を確認した。DNAの二次構造としては、DNA-RNA hybridを持つR-loopや、グアニンが多い領域で生じるグアニン4重鎖(G4)構造等を想定した。これまでのところ、R-loopに関しては、tc-DSBの発生に顕著な影響はみられていない。G4構造に関しては、G4検出系の条件検討が難航しており、具体的な影響については検証中である。tc-DSBの修復経路に関する研究としては、DSB修復因子LIG4の関与が示唆されたが限定的であったため、現在はLIG4以外の因子の特定を試みている。
英文摘要
カンプトテシン(CPT)はDNAトポイソメラーゼI(Top1)の阻害剤であり、Top1がDNAに共有結合したTop1-DNA cleavage complex(Top1cc)を蓄積させる。Top1ccは転写を強く抑制してストレス応答を引き起こすが、その際に転写と関連したDNA二本鎖切断(transcription-coupled DSB:tc-DSB)を生じることが分かっている。しかし、tc-DSBの発生および修復機序は不明である。我々はDNAヘリカーゼであるRecQL5がtc-DSBの発生を抑制することを見出しており、RecQL5に注目した解析から、tc-DSBの生成及び修復機構を解明することが本研究の目的である。tc-DSBは神経細胞のような増殖していない静止期の細胞でも生じるDNA損傷であり、本研究の成果は神経疾患の病態解明につながることも期待される。これまでに、転写共役ヌクレオチド除去修復(TC-NER)およびRecQL5がtc-DSB生成に関わることを見出しており、DNAヘリカーゼで解かれるようなDNAの二次構造が発生し、その構造がtc-DSBの生成に関わると考えられる。TC-NERに関しては、CSBおよびCSAのノックアウト細胞を作成し、その関与を確認した。DNAの二次構造としては、DNA-RNA hybridを持つR-loopや、グアニンが多い領域で生じるグアニン4重鎖(G4)構造等を想定した。これまでのところ、R-loopに関しては、tc-DSBの発生に顕著な影響はみられていない。G4構造に関しては、G4検出系の条件検討が難航しており、具体的な影響については検証中である。tc-DSBの修復経路に関する研究としては、DSB修復因子LIG4の関与が示唆されたが限定的であったため、現在はLIG4以外の因子の特定を試みている。
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Camptothecin compromises transcription recovery and cell survival against cisplatin and ultraviolet irradiation regardless of transcription-coupled nucleotide excision repair
无论转录偶联的核苷酸切除修复如何,喜树碱都会损害顺铂和紫外线照射下的转录恢复和细胞存活
DOI:
10.1016/j.dnarep.2022.103318
发表时间:
2022
期刊:
DNA Repair
影响因子:
3.8
作者:
[Sakasai Ryo, Wakasugi Mitsuo, Matsui Tadashi, Sunatani Yumi, Saijo Masafumi, Matsunaga Tsukasa, Iwabuchi Kuniyoshi]
通讯作者:
Iwabuchi Kuniyoshi
Lens-specific conditional knockout of tropomyosin 1 gene in mice causes abnormal fiber differentiation and lens opacity
小鼠晶状体特异性条件性敲除原肌球蛋白 1 基因导致纤维分化异常和晶状体混浊
DOI:
10.1016/j.mad.2021.111492
发表时间:
2021
期刊:
Mechanisms of Ageing and Development
影响因子:
5.3
作者:
[Shibata Teppei, Ikawa Masahito, Sakasai Ryo, Ishigaki Yasuhito, Kiyokawa Etsuko, Iwabuchi Kuniyoshi, Singh Dhirendra P, Sasaki Hiroshi, Kubo Eri]
通讯作者:
Kubo Eri
金沢医科大学 医学部 生化学I
金泽医科大学医学部生物化学Ⅰ
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
53BP1- and BRCA2-dependent biphasic repair of replication-mediated one-ended DSBs
复制介导的单端 DSB 的 53BP1 和 BRCA2 依赖性双相修复
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[逆井良, 岩淵邦芳]
通讯作者:
岩淵邦芳
BRCA2 prevents nuclear fragmentation mediated by LINC-lamina-53BP1 axis in response to one-ended DNA double-strand breaks
BRCA2 防止 LINC-lamina-53BP1 轴响应单端 DNA 双链断裂介导的核断裂
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Ryo Sakasai, Yumi Sunatani, Tadashi Matsui, Kuniyoshi Iwabuchi]
通讯作者:
Kuniyoshi Iwabuchi
共 6 条
53BP1が制御する核断片化を伴う新規ゲノム不安定化経路の解析
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批准号:24K15295
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2024
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负责人:逆井 良
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依托单位:
海外基金