深海微生物叢情報を利用した新規糖質分解酵素の探索及び機能解析と応用展開

利用深海微生物组信息、功能分析和应用开发寻找新的碳水化合物降解酶

• 批准号: 22K05398
• 负责人: 澄田 智美
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K05398/
• 关键词: 糖質関連酵素; 糖鎖; グリコシダーゼ; メタゲノム解析; 海洋; X線結晶構造解析; グリコシダーぜ

糖鎖は多糖・糖脂質・糖タンパク質などの複合糖質として自然界に広く分布し、様々な生命現象の一端を担っている。これまで糖鎖を介した生命現象の解明は陸上の試料を中心に進められてきており、海洋、特に深海環境の細菌叢を対象とした研究例は極端に少ない。深海環境微生物は、陸上とは全く異なる環境に適応するために独自の生存戦略を持つことが予想されるため、深海メタゲノム情報には未知の性質を持つ酵素が数多く眠ることが期待される。深海細菌の大半は未培養系統に属し、実験室での培養が困難であるが、海洋水や深海堆積物を対象にしたメタゲノム解析からの探索を行うことで、遺伝子情報に直接アプローチした遺伝子配列探索が可能となる。本研究では、深海環境での糖鎖を介した生命現象の解明を行うため、深海メタゲノム情報を大規模に活用して新規糖質関連酵素の探索を行い、糖質関連酵素に関する知見の大幅な拡張と更なる応用へと繋げる。

Lock は polysaccharide, sugar, lipid, sugar sugar タ ン パ ク qualitative な ど の composite sugar と し て nature に hiroo く し distribution, others 々 な を bear life phenomenon の end っ て い る. こ れ ま で sugar lock を interface し た life phenomenon の interpret は onshore の sample を center に into め ら れ て き て お り, Marine, に deep-sea environment の bacterial flora を like と seaborne し た research example は less extreme に な い. Deep-sea microbial は environment, land と は く all different な る environment に optimum 応 す る た め に の survival 戦 slightly を alone hold つ こ と が to think さ れ る た め, deep sea メ タ ゲ ノ ム intelligence に は unknown の nature を hold つ enzyme が more く sleeps る こ と が expect さ れ る. Deep-sea bacteria of the genus の most は not cultivate system に し, be 験 chamber で の cultivate が difficult で あ る が や, sea water deep debris を like に seaborne し た メ タ ゲ ノ ム parsing か ら の exploration line を う こ と で directly, but 伝 intelligence に ア プ ロ ー チ し た heritage 伝 with sequence may explore が と な る. This study で は, deep sea environment で の sugar lock を interface し た life phenomenon の interpret を line う た め, deep sea メ タ ゲ ノ ム intelligence を large-scale に use し て new rules sugar masato even enzyme の exploration line を い, sugar masato even enzyme に masato す る knowledge の sharply な company, zhang と more な る 応 with へ と 繋 げ る.