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Chromosome elimination in subspecies distance cross in grass species: analysis in centromere diversity

草种亚种距离交叉的染色体消除：着丝粒多样性分析

基本信息

批准号：
22K05572
负责人：
石井孝佳
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Tottori University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

イネ科においては亜科間レベルでの遠縁交雑が可能な場合がある。しかし、雑種初期胚から片親の染色体が選択的に排除される染色体脱落現象が報告されている。申請者は、過去の研究において、イネ科イチゴツナギ亜科のパンコムギおよびエンバクに、イネ科キビ亜科のパールミレットを交雑して、エンバクを雌親に用いた場合には、パールミレットの動原体がエンバクの動原体特異的ヒストンH3（CENH3）を自身のCENH3のように動原体に取り込み、脱落から免れることを明らかにした。本申請では、雌親にパンコムギとエンバクを使用し、花粉親に、イネ科キビ亜科に属する10種のPennisetum属植物を用いた際に起こる様々な染色体脱落の違いを生み出す動原体の違いを特定する。初年度は、Pennisetum属の鳥取における簡易栽培方法の開発に成功し、省力によるPennisetum属の室内栽培を可能にした。この基盤的栽培技術により、植物材料の簡易な維持が可能になり、研究のスピードが加速する事が予想される。また、初年度は染色体脱落レベルの異なるPennisetum属の長鎖DNAを抽出し、パックバイオのHiFiリードを用いてロングリードを獲得した。さらに、イルミナによるRNA-Seq、ナノポアによるRNA-Seq情報なども取得しており、これら新規に獲得したゲノム関連情報は非常に有益である。Pennisetum属の近縁野生種のゲノム情報は無く、染色体脱落における貴重な基盤情報となった。

In the case of a family, it is possible to communicate with each other at a distance. Chromosome shedding was reported in the early embryo stage and the early embryo stage. The applicant is responding to past research on the development of biotech, biotech The invention relates to a method for identifying chromosome abscission, chromosome production, and chromosome mutation of 10 species of Penisetum plants belonging to the genus Penisetum in the use of female parents, pollen parents, and biological families. In the early years, the development of a simple cultivation method for Penisetum was successful and labor-saving. The cultivation technology of this substrate, the simple maintenance of plant materials, the acceleration of research and development are envisaged. In addition, in the early years, the long chain DNA of Penisetum was extracted and the high frequency DNA was obtained. The RNA-Seq, RNA-Seq and RNA-Seq information can be very useful in obtaining new RNA-Seq information. There is no information about the genus Pennisetum, a near-wild species, and valuable basic information is needed when chromosomes fall off.