Recessive lethal alleles linked to seed abortion and their effect on fruit development in blueberries

ブルーベリー（Vaccinium spp.）は自家不稔性を有し，自家受粉を行うと果実中の成熟種子数が減少することが知られている．果実中の成熟種子数は果実サイズや熟期と相関関係にあることが報告されているため，種子数はブルーベリー栽培の成否に影響する重大な因子であるが，種子に発育不全をもたらすメカニズムは明らかにされていない．本研究は，広く栽培されている四倍体ブルーベリーを供試して，種子発達を制御するメカニズムおよび種子発達が果実肥大に及ぼす影響の解明を目指すものである．ブルーベリーの遺伝解析に先立ち，dpMIG-seq法によるジェノタイピングの最適化を行った．同一のDNAサンプルについてdpMIG-seq法により2回シーケンスを行ったところ，得られるジェノタイプの再現性が高いことが示された．全ゲノムリシーケンスにより得られたジェノタイプと比較したところ，dpMIG-seq法におけるジェノタイプエラーが比較的高いことが示唆された．しかしながら，分離集団を供試する遺伝解析においては，メンデル遺伝を想定した場合に期待される分離比との適合度を調査することで，エラーだと推測されるSNPsを除くことができると考えられた．続いて，‘スパルタン’を種子親，‘ブルーマフィン’を花粉親とするF1集団を供試し，dpMIG-seq法を用いてジェノタイピングを行った．連鎖地図を構築し，アレルの分離に関して調査を行ったところ，‘ブルーマフィン’は同質倍数体においてよく見られる遺伝様式を示すと考えられた．これらの結果を前提に，‘ブルーマフィン’の自殖後代を供試し，種子の致死現象に関連する遺伝領域の探索に取り組む．

ブルーベリー（Vaccinium spp.）は自家不稔性を有し，自家受粉を行うと果実中の成熟種子数が減少することが知られている．果実中の成熟種子数は果実サイズや熟期と相関関係にあることが報告されているため，種子数はブルーベリー栽培の成否に影響する重大な因子であるが，種子に発育不全をもたらすメカニズムは明らかにされていない．本研究は，広く栽培されている四倍体ブルーベリーを供試して，種子発達を制御するメカニズムおよび種子発達が果実肥大に及ぼす影響の解明を目指すものである．ブルーベリーの遺伝解析に先立ち，dpMIG-seq法によるジェノタイピングの最適化を行った．同一のDNAサンプルについてdpMIG-seq法により2回シーケンスを行ったところ，得られるジェノタイプの再現性が高いことが示された．全ゲノムリシーケンスにより得られたジェノタイプと比較したところ，dpMIG-seq法におけるジェノタイプエラーが比較的高いことが示唆された．しかしながら，分離集団を供試する遺伝解析においては，メンデル遺伝を想定した場合に期待される分離比との適合度を調査することで，エラーだと推測されるSNPsを除くことができると考えられた．続いて，‘スパルタン’を種子親，‘ブルーマフィン’を花粉親とするF1集団を供試し，dpMIG-seq法を用いてジェノタイピングを行った．連鎖地図を構築し，アレルの分離に関して調査を行ったところ，‘ブルーマフィン’は同質倍数体においてよく見られる遺伝様式を示すと考えられた．これらの結果を前提に，‘ブルーマフィン’の自殖後代を供試し，種子の致死現象に関連する遺伝領域の探索に取り組む．