エピゲノムパターン構築に不可欠な遺伝子と有害配列の識別メカニズムの解明

阐明表观基因组模式构建和有害序列必需基因的识别机制

• 批准号: 22K06180
• 负责人: 藤 泰子
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K06180/
• 关键词: エピジェネティクス; クロマチン; DNAメチル化; ヒストンバリアント; 植物; ゲノム

真核生物は、ゲノムにコードされる遺伝子と潜在的に有害なトランスポゾンとの違いを正確に識別し、それぞれ異なるクロマチン修飾を付加して転写制御する。本研究では、こうした抑制的クロマチン修飾の喪失からの回復過程において必要なエピゲノム情報の探索を通して、遺伝子と有害配列の識別メカニズムの理解を目指している。今研究計画では、研究代表者の先行研究により見出された識別因子候補「CGメチル化」および「H２Aバリアント」に焦点を当て、また研究代表者が確立したde novoエピゲノム構築系を応用し、これら因子のゲノム分布を人為的に操作して喪失型および増加型de novoエピゲノム構築系を確立し、そのF１個体における抑制修飾回復の有無や親との同一性を評価する。2022年度はその準備として、「CGメチル化」および「H２Aバリアント」の喪失型および増加型de novoエピゲノム構築系を確立するため、系のコンストラクションや植物の交配、ジェノタイピングなどの作業を進めた。また、本研究に関連する最近の研究論文の総説執筆を行なった。

真核生物准确地识别基因组编码基因与潜在有害转座子之间的差异，每种基因组化的基因添加了不同的染色质修饰以调节转录。这项研究旨在通过搜索抑制性染色质修饰的恢复过程中所必需的表观基因组信息来了解基因和有害序列的歧视机制。 In this research plan, we will focus on the candidates for discriminating factors, "CG methylation" and "H2A variants," which were founded in previous research by the researcher, and will also apply the de novo epigenome construction system established by the researcher, and artificially manipulate the genome distribution of these factors to establish a lost and increased de novo epigenome construction system, and evaluate whether or not the F1 individual has recovered inhibitory modification和父母的身份。为此，在2022财年的准备工作中，我们继续进行了诸如系统的构建，植物交配和基因分型的工作，以建立一种系统损失并增加了从头表观遗传组构建系统，用于CG甲基化和H2A变体。他还撰写了有关与这项研究有关的最新研究论文的评论。

项目成果

Crosstalk between CG and non-CG DNA methylation drives plant epigenomic pattern formation

CG 和非 CG DNA 甲基化之间的串扰驱动植物表观基因组模式的形成

• 发表时间: 2022
• 作者: Taiko To;Chikae Yamasaki;Shoko Oda;Shumpei Takeuchi;Sayaka Tominaga;Tetsuji Kakutani
• 通讯作者: Tetsuji Kakutani

Crosstalk among pathways to generate DNA methylome

• DOI: 10.1016/j.pbi.2022.102248
• 发表时间: 2022-08-01
• 期刊: CURRENT OPINION IN PLANT BIOLOGY
• 影响因子: 9.5
• 作者: To, Taiko Kim;Kakutani, Tetsuji
• 通讯作者: Kakutani, Tetsuji

２種のDNAメチル化間のクロストークが植物エピゲノムパターン形成を駆動する

两种 DNA 甲基化之间的串扰驱动植物表观基因组模式

• 发表时间: 2022
• 作者: 藤 泰子;山崎慈恵;小田頌子;富永さやか;竹内俊平;角谷徹仁
• 通讯作者: 角谷徹仁

非ゲノム情報のゲノム内パターン形成における非ゲノム情報間クロストーク - 植物の視点から -

基因组内模式形成中非基因组信息之间的串扰 - 从植物角度 -

• 发表时间: 2022
• 作者: 藤泰子;角谷徹仁
• 通讯作者: 角谷徹仁