Comparative phylogeography of amphibians in northeastern Japan based on genomic data

本研究課題では中部・関東以北の東北日本の両生類を対象とした種網羅的な比較系統地理解析を通じて、日本列島の生物相形成史における東北日本の位置づけの再評価を目指す。関東地方以北の東北本州、特に東北地方は両生・爬虫類の種多様性が西南本州に比べて低く、遺伝的多様性も低い種が多いことから、多くの種で氷期に一度集団が縮小あるいは消滅した後で、近年に一斉に拡大した歴史の浅い地域と考えられていた。しかし小型サンショウウオなど一部の種では中新世に起源をもつような古い遺伝的な多様性を残していることも分かってきている。2022年度はこれまで種内の遺伝構造の解明が不十分であったアカガエル属2種（ニホンアカガエル、ヤマアカガエル）の新規サンプル収集を進めるとともに、京都大学等の共同研究者からサンプルの提供を受け、東日本を中心とした分布域全体から得られたサンプルについて、ミトコンドリアDNAのシーケンスによる予備的な遺伝構造の解析を順次進めている。さらに、トウキョウダルマガエルおよびトノサマガエルでも関東以北の集団の新規サンプル収集と遺伝解析を進め、関東平野より北では遺伝的多様性が著しく低下することが明らかになった。他にも東日本産ハコネサンショウウオ属4種（狭義ハコネ、バンダイハコネ、タダミハコネ、ツクバハコネ）、サンショウウオ属3種（トウホクサンショウウオ、イワキサンショウウオ、トウキョウサンショウウオ）でも新規サンプル収集と過去に収集したサンプルの整理をおこない、ミトコンドリアDNAおよび核SNPに基づく遺伝構造の解析を進めた。それらの一環として、広義のトウキョウサンショウウオのうち北部遺伝集団とされてきた地域集団を遺伝的、形態的な違いに基づいて新種イワキサンショウウオとして記載した。

本研究課題では中部・関東以北の東北日本の両生類を対象とした種網羅的な比較系統地理解析を通じて、日本列島の生物相形成史における東北日本の位置づけの再評価を目指す。関東地方以北の東北本州、特に東北地方は両生・爬虫類の種多様性が西南本州に比べて低く、遺伝的多様性も低い種が多いことから、多くの種で氷期に一度集団が縮小あるいは消滅した後で、近年に一斉に拡大した歴史の浅い地域と考えられていた。しかし小型サンショウウオなど一部の種では中新世に起源をもつような古い遺伝的な多様性を残していることも分かってきている。2022年度はこれまで種内の遺伝構造の解明が不十分であったアカガエル属2種（ニホンアカガエル、ヤマアカガエル）の新規サンプル収集を進めるとともに、京都大学等の共同研究者からサンプルの提供を受け、東日本を中心とした分布域全体から得られたサンプルについて、ミトコンドリアDNAのシーケンスによる予備的な遺伝構造の解析を順次進めている。さらに、トウキョウダルマガエルおよびトノサマガエルでも関東以北の集団の新規サンプル収集と遺伝解析を進め、関東平野より北では遺伝的多様性が著しく低下することが明らかになった。他にも東日本産ハコネサンショウウオ属4種（狭義ハコネ、バンダイハコネ、タダミハコネ、ツクバハコネ）、サンショウウオ属3種（トウホクサンショウウオ、イワキサンショウウオ、トウキョウサンショウウオ）でも新規サンプル収集と過去に収集したサンプルの整理をおこない、ミトコンドリアDNAおよび核SNPに基づく遺伝構造の解析を進めた。それらの一環として、広義のトウキョウサンショウウオのうち北部遺伝集団とされてきた地域集団を遺伝的、形態的な違いに基づいて新種イワキサンショウウオとして記載した。