熱水生態系における原始的一本鎖DNAウイルスの探索：その実態と初期進化の解明

在热液生态系统中寻找原始单链 DNA 病毒：阐明其现实和早期进化

• 批准号: 22K06366
• 负责人: 吉田 ゆかり
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K06366/
• 关键词: 熱水生態系; ウイルス; 一本鎖DNA

本年度は、沖縄トラフ鳩間海丘の熱水活動域から採取した試料を用いて、ウイルスの宿主となる好熱性化学合成独立栄養細菌を単離・培養した。16S rDNA配列を用いた分子系統関係を調べ、各培養株の系統学的位置ならびに分類情報を整備した。次に、一本鎖DNA抽出キットを用いて培養上清から核酸を抽出し、一本鎖DNAの存在の有無を調べた。その結果、2株の化学合成独立栄養細菌において一本鎖DNAが検出された。これらの培養株の濾液を電子顕微鏡下で観察したところ、長さ約1,200nm、幅約10nmの繊維状のウイルス粒子が確認された。形態学的特徴から、それらの粒子はInovirusに分類されることが明らかとなった。ゲノム解析の結果、両ウイルスとも鎖長約10kbの環状DNAを有しており、ゲノム上には14個の遺伝子がコードされていた。既知の一本鎖DNAウイルスとのゲノム比較を行ったところ、本研究で単離したウイルス2株は一本鎖DNAウイルスの中で新規な系統群に分類されることが示された。

This year, the hot water activity area of the sea mound in the middle of the sea was used to collect samples, and the hosts of the samples were isolated and cultured independently. 16S rDNA alignment was used to adjust molecular phylogenetic relationships, and the phylogenetic position and taxonomic information of individual cultures were prepared. In addition, the presence or absence of DNA in the culture supernatant is regulated by the presence or absence of DNA. As a result, two chemically synthesized independent bacteria were isolated from the DNA of one of the locks. The filtrate of these cultured plants was observed under electron microscope and the particles with a length of about 1,200 nm and an amplitude of about 10nm were identified. Morphological characteristics of particles are classified as Inovirus. As a result of the analysis, there are 14 circular DNA fragments with a length of about 10kb. The results of this study show that two strains of DNA from a known DNA sequence are classified into new phylogenetic groups.

项目成果

深海底熱水生態系における一本鎖DNAウイルスの探索

在深海热液生态系统中寻找单链DNA病毒

• 发表时间: 2022
• 作者: 吉田(高島)ゆかり;吉田 光宏;高木 善弘;布浦 拓郎;高井 研
• 通讯作者: 高井 研