熱水生態系における原始的一本鎖DNAウイルスの探索：その実態と初期進化の解明
熱水生態系における原始的一本鎖DNAウイルスの探索：その実態と初期進化の解明
在热液生态系统中寻找原始单链 DNA 病毒：阐明其现实和早期进化
批准号：
22K06366
负责人：
吉田 ゆかり
金额：
$2.66万
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
项目状态：
未结题
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
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英文摘要
本年度は、沖縄トラフ鳩間海丘の熱水活動域から採取した試料を用いて、ウイルスの宿主となる好熱性化学合成独立栄養細菌を単離・培養した。16S rDNA配列を用いた分子系統関係を調べ、各培養株の系統学的位置ならびに分類情報を整備した。次に、一本鎖DNA抽出キットを用いて培養上清から核酸を抽出し、一本鎖DNAの存在の有無を調べた。その結果、2株の化学合成独立栄養細菌において一本鎖DNAが検出された。これらの培養株の濾液を電子顕微鏡下で観察したところ、長さ約1,200nm、幅約10nmの繊維状のウイルス粒子が確認された。形態学的特徴から、それらの粒子はInovirusに分類されることが明らかとなった。ゲノム解析の結果、両ウイルスとも鎖長約10kbの環状DNAを有しており、ゲノム上には14個の遺伝子がコードされていた。既知の一本鎖DNAウイルスとのゲノム比較を行ったところ、本研究で単離したウイルス2株は一本鎖DNAウイルスの中で新規な系統群に分類されることが示された。
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会议论文
深海底熱水生態系における一本鎖DNAウイルスの探索
在深海热液生态系统中寻找单链DNA病毒
在深海热液生态系统中寻找单链DNA病毒
DOI：
--
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
--
作者：
[吉田(高島)ゆかり, 吉田 光宏, 高木 善弘, 布浦 拓郎, 高井 研]
通讯作者：
高井 研
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