Tracing the origin of morphological change in tooth class during human evolution ~ QTL analysis with Suncus murinus ~
追踪人类进化过程中齿类形态变化的起源〜用Suncus murinus进行QTL分析〜
基本信息
- 批准号:22K06416
- 负责人:
- 金额:$ 2.75万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份:2022
- 资助国家:日本
- 起止时间:2022-04-01 至 2025-03-31
- 项目状态:未结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
今年度はまず、切歯、犬歯、小臼歯、大臼歯の各歯種についての遺伝子型-表現型マッピングに必要な実験動物であるスンクスの作出を進めた。F0世代として用いるカトマンズ系統の雌と長崎系統の雄を交配させてF1世代を生み出し、さらに同一家系のF1同士を交配させることによりF2世代を約50匹得ることができた。未咬耗なままの歯の形態を定量解析するために、生後16日齢でF2個体はサンプリングした。筋組織よりゲノムDNAを抽出し、ライブラリ作成の後にシーケンシングを外注し、ゲノムデータを得た。歯のシェイプ、サイズ、並びに特定の歯種(上顎第3切歯と第3小臼歯)の有無のデータを得るため、骨格標本を作製し、マイクロCT撮影で得られた画像から3次元モデルの再構築を進めた。構築した3次元サーフェスモデルは、形態地図法という定量化手法により2次元のマップ画像へと展開し、主成分分析により互いに独立した形状変異成分を抽出し、各主成分軸をシェイプデータとした。サイズデータには、歯冠の重心サイズを用いた。また、QTL解析のため交尾可能年齢を過ぎたF0,F1世代個体も順次サンプリングしゲノムデータを収集した。これらゲノムデータと形態データの相関を調べるため、予備的ではあるが、得られた個体を用いてゲノムワイド関連解析(GWAS)、並びに、量的形質遺伝子座(QTL)解析を行った。その結果、歯の正常な発声に必須な遺伝子や、歯のパターニングに用いられるシグナル伝達経路関連遺伝子、体の成長に関与する遺伝子などが候補として有意な相関が見いだされた。これらの予備的な解析結果を国内外の学会で発表した。
This year, we will make progress in the development of genetic subtypes and phenotypes of teeth, incisors, canine teeth, small teeth and large teeth. F0 generation: female and male of Nagasaki system: F1 generation: male and female of Nagasaki system: female and male of Nagasaki system A quantitative analysis of the morphology of unconsumed teeth was performed on F2 individuals at 16 days after birth. Tendon tissue extraction, extraction The tooth shape, tooth shape, tooth shape and tooth shape of the tooth shape (the third tooth shape and tooth shape of the tooth shape) are different. The tooth shape, tooth shape and tooth shape are different. 3-D structure, shape and quantity analysis, 2-D structure, shape and quantity analysis, principal component analysis The center of gravity of the crown QTL analysis and mating may occur in F0,F1 generations. The analysis of QTL was carried out by GWAS, QTL and QTL. The results of this study indicate that the normal transmission of DNA must be carried out in the presence of DNA, DNA and DNA. The analytical results of this paper are presented to the domestic and foreign academic societies.
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
4つの歯種それぞれの形態変異に関わるゲノム領域の同定とその人類進化史上の意義
四种牙齿类型中涉及形态变异的基因组区域的鉴定及其在人类进化史上的意义
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Morita W;Mekada K;Kawada S;Nagata N;Yamanaka A;森田 航
- 通讯作者:森田 航
Differences in morphogenetic process between the premolar and the molar
前磨牙和磨牙形态发生过程的差异
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Haider Y;Iwai H;Kuramoto E;Goto T;Nakamura N;Yamanaka A
- 通讯作者:Yamanaka A
Evolution and development of the mammalian multicuspid teeth
哺乳动物多尖牙的进化和发育
- DOI:10.1016/j.job.2022.03.007
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:2.4
- 作者:Yamanaka A
- 通讯作者:Yamanaka A
現生トガリネズミ科の臼歯の発生過程:歯の発生と進化の並行性に関する考察
现代鼩鼱臼齿的发育过程:牙齿发育与进化平行性的思考
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Yamanaka A;Morita W;Haider Y;Goto T;山中淳之
- 通讯作者:山中淳之
Developmental assessment of cusp formation in the modern shrew’s molar: an implication for the evolution of the tribosphenic molar in Mesozoic mammals
现代鼩鼱臼齿牙尖形成的发育评估:对中生代哺乳动物三蝶臼齿进化的影响
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Yamanaka A;Morita W;Haider Y;Goto T
- 通讯作者:Goto T
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
森田 航其他文献
オフライン墨書仮名文字認識支援システムの開発
离线墨迹假名字符识别支持系统的开发
- DOI:
- 发表时间:
2013 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
森田 航;矢野 航;長岡 朋人;安部 みき子;中務 真人;西田茂生,梅本直邦 - 通讯作者:
西田茂生,梅本直邦
ヒト上顎第一大臼歯、第二乳臼歯におけるエナメル象牙境とエナメル質外表面の幾何学的形態解析
人上颌第一磨牙和第二乳磨牙牙釉质-牙本质边界和牙釉质外表面的几何形态分析
- DOI:
- 发表时间:
2013 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
森田航;矢野航;長岡朋人;安部みき子;中務真人;森田 航 - 通讯作者:
森田 航
中新世後期ナカリ出土の未記載類人猿大臼歯化石の形態解析.
对中新世晚期中里出土的未描述的猿磨牙化石进行形态分析。
- DOI:
- 发表时间:
2020 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
森田 航;森本 直記;國松 豊;河野 礼子;諏訪 元;中務 真人. - 通讯作者:
中務 真人.
エルサルバドル共和国から出土した先スペイン期埋葬人骨の同位体分析-人の移動と食性復元にむけて-
对萨尔瓦多共和国出土的西班牙前埋葬人骨进行同位素分析 - 重建人类迁徙和饮食习惯 -
- DOI:
- 发表时间:
2013 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
南 雅代;市川 彰;坂田 健;森田 航;伊藤伸幸 - 通讯作者:
伊藤伸幸
胎生初期の低栄養環境が仔ラットの骨成長に及ぼす影響
胚胎早期低营养环境对幼鼠骨骼生长的影响
- DOI:
- 发表时间:
2013 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
木村 智子;玉川 俊広;金子 隼也;原澤 俊也;河野 匡暁;野津 瑛未奈;森田 航;中務 真人;山田 重人;宇田川 潤;工藤 基 - 通讯作者:
工藤 基
森田 航的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('森田 航', 18)}}的其他基金
先史時代中南米における歯の形態を用いた集団移動の解明
利用牙齿形态阐明史前中美洲和南美洲的人口迁移
- 批准号:
11J00940 - 财政年份:2011
- 资助金额:
$ 2.75万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
相似海外基金
Collaborative Research: EDGE CMT: A four-dimensional genotype-phenotype map of poison frog skin color
合作研究:EDGE CMT:毒蛙肤色的四维基因型-表型图
- 批准号:
2319711 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 2.75万 - 项目类别:
Continuing Grant
Identification of the origins of inherited retinal diseases and clarification of genotype-phenotype correlations based on three major ethnic groups worldwide utilizing artificial intelligence.
利用人工智能,基于全球三个主要种族群体,识别遗传性视网膜疾病的起源并阐明基因型-表型相关性。
- 批准号:
22KJ2665 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 2.75万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
NSF PRFB FY 2022: Uncovering the Influence of Hormone Signaling in Reptile Reproductive Development: Using CRISPR to Link Genotype, Phenotype, and Fitness
NSF PRFB 2022 财年:揭示激素信号传导对爬行动物生殖发育的影响:使用 CRISPR 连接基因型、表型和健康度
- 批准号:
2209150 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 2.75万 - 项目类别:
Fellowship Award
next-generation sequencing approaches to identify genotype-phenotype relationships during miRNA tuning of neural crest osteogenesis
新一代测序方法可识别神经嵴成骨过程中 miRNA 调节过程中的基因型与表型关系
- 批准号:
10579800 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 2.75万 - 项目类别:
Exploring genotype-phenotype correlations in Sox10 mutations
探索 Sox10 突变的基因型-表型相关性
- 批准号:
2892101 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 2.75万 - 项目类别:
Studentship
Collaborative Research: EDGE CMT: A four-dimensional genotype-phenotype map of poison frog skin color
合作研究:EDGE CMT:毒蛙肤色的四维基因型-表型图
- 批准号:
2319712 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 2.75万 - 项目类别:
Standard Grant
Investigating the Genotype-Phenotype Relationships that Underlie Congenital Disorders with Cardiovascular Symptoms through Population-scale Analyses
通过人群规模分析研究具有心血管症状的先天性疾病背后的基因型-表型关系
- 批准号:
10724185 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 2.75万 - 项目类别:
Diagnosis and Genotype-Phenotype Correlations in Early Life Epilepsy and CDKL5 Disorder
早期癫痫和 CDKL5 疾病的诊断和基因型-表型相关性
- 批准号:
10758725 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 2.75万 - 项目类别:
Exploring genotype-phenotype correlations in Sox10 mutations
探索 Sox10 突变的基因型-表型相关性
- 批准号:
2885791 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 2.75万 - 项目类别:
Studentship
Influence of T cell genotype/phenotype in atherosclerotic cardiovascular disease
T细胞基因型/表型对动脉粥样硬化性心血管疾病的影响
- 批准号:
10754115 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 2.75万 - 项目类别: