Tracing the origin of morphological change in tooth class during human evolution ~ QTL analysis with Suncus murinus ~

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今年度はまず、切歯、犬歯、小臼歯、大臼歯の各歯種についての遺伝子型-表現型マッピングに必要な実験動物であるスンクスの作出を進めた。F0世代として用いるカトマンズ系統の雌と長崎系統の雄を交配させてF1世代を生み出し、さらに同一家系のF1同士を交配させることによりF2世代を約50匹得ることができた。未咬耗なままの歯の形態を定量解析するために、生後１６日齢でF2個体はサンプリングした。筋組織よりゲノムDNAを抽出し、ライブラリ作成の後にシーケンシングを外注し、ゲノムデータを得た。歯のシェイプ、サイズ、並びに特定の歯種（上顎第３切歯と第３小臼歯）の有無のデータを得るため、骨格標本を作製し、マイクロCT撮影で得られた画像から３次元モデルの再構築を進めた。構築した３次元サーフェスモデルは、形態地図法という定量化手法により２次元のマップ画像へと展開し、主成分分析により互いに独立した形状変異成分を抽出し、各主成分軸をシェイプデータとした。サイズデータには、歯冠の重心サイズを用いた。また、QTL解析のため交尾可能年齢を過ぎたF0,F1世代個体も順次サンプリングしゲノムデータを収集した。これらゲノムデータと形態データの相関を調べるため、予備的ではあるが、得られた個体を用いてゲノムワイド関連解析（GWAS）、並びに、量的形質遺伝子座（QTL）解析を行った。その結果、歯の正常な発声に必須な遺伝子や、歯のパターニングに用いられるシグナル伝達経路関連遺伝子、体の成長に関与する遺伝子などが候補として有意な相関が見いだされた。これらの予備的な解析結果を国内外の学会で発表した。