膵癌の局所空間における分子遺伝学的不均一性とその病理形態学的意義の探索

点击翻译按钮获取中文摘要

診断、治療技術の発展した今日においても膵癌は悪性腫瘍全体の中で有意に予後不良である。本研究は、この難治性癌の代表である膵癌に対して、近年注目されている空間的遺伝子発現解析を用いて局所の進展過程の背景にある分子遺伝学的変化を解明しようというものである。杏林大学病理部に保管されている膵管癌症例を100例以上を系統的にレビューして腫瘍内で形態学的変化の強い20例を抽出した。そして、FFPE（ホルマリン固定パラフィン包埋標本）検体から抽出したRNAをquality checkの上、解析基準を満たす10症例を選出した。これらの症例のうち、退形成変化のある膵管癌4症例を用いて、FFPE対応のVisiumプラットフォーム（10X社）で解析を行った。特殊スライドの6.5mm四方内にある5000スポットのうち、平均で4660(4057-4992)スポットの発現が同定可能であった。Loupe Browserを用いた高次解析では、形態学的変化が見られる部分に概ね一致して発現変化が見られるとともに、形態学的変化が乏しい部分でも領域性の発現変化が見られた。現在はこの結果をもとに、gene ontology analysisやパスウェイ解析により変動遺伝子の特徴、分子遺伝学的意義を探索している。同時に鍵となる遺伝子（遺伝子群）の抽出を進めている。なお、本研究は理化学研究所がんゲノム研究チーム（中川研究室）と共同で行っている。