シングルセルRNA解析を用いた重症筋無力症の分子病態解明

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我々は、末梢血を対象にしてシングルセル解析技術を用いて1細胞レベルでのmRNA発現を解析している。またRNA発現だけでなく、細胞表面蛋白も解析対象としており、従来の細胞表面蛋白の発現で定義した細胞との比較も可能である。以下に、研究の途中経過を示す。・クラスタリング解析：シングルセルRNA解析データを用いて、病態に関連する細胞集団のクラスタリング解析を行った。この解析により、重症筋無力症患者の末梢血中に存在する細胞サブセットが明らかとなり、それぞれのサブセットが病態発現にどのように関与しているかを詳細に解析できる。・発現変動遺伝子の探索：シングルセルRNA解析技術を用いて、クラスター毎の重症筋無力症に関連する発現変動遺伝子を同定した。これらの遺伝子は、免疫応答や細胞増殖などの生物学的プロセスに関与していると想定されるため、今後これらの遺伝子に注目した実験や解析を行っていく。・細胞間相互作用の解析：重症筋無力症患者の末梢血中のT細胞やB細胞における細胞間相互作用に関与する因子やシグナル伝達経路を同定した。この解析により、病態発現における細胞間のコミュニケーション機構が明らかになった。・転写因子ネットワークの解析：シングルセルRNA解析により得られたデータをもとに、転写因子ネットワークを同定した。正常対照と比較することで重症筋無力症でより活性化している転写因子ネットワークの同定が可能となった。これにより、病態発現の制御機構の解明を目指す。